150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3562 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3494  transglutaminase domain protein  99.81 
 
 
523 aa  1038    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3413  transglutaminase-like  97.32 
 
 
523 aa  942    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3474  transglutaminase domain-containing protein  78.2 
 
 
528 aa  758    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.934792  normal  0.0999002 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3562  transglutaminase domain protein  100 
 
 
523 aa  1039    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.209631  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2936  hypothetical protein  30.97 
 
 
506 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.993231  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1083  hypothetical protein  28.71 
 
 
498 aa  166  8e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0137712  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2284  hypothetical protein  26.25 
 
 
513 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335362  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2082  hypothetical protein  26.25 
 
 
511 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.624856  hitchhiker  0.00537733 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23180  hypothetical protein  25.05 
 
 
508 aa  149  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1932  hypothetical protein  25.19 
 
 
511 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.22516  hitchhiker  0.00000000116182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1772  hypothetical protein  25.19 
 
 
511 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100254  hitchhiker  0.0000124002 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1070  hypothetical protein  30.89 
 
 
510 aa  145  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0393268  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3439  hypothetical protein  25.19 
 
 
511 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0125923  normal  0.0502015 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2331  hypothetical protein  25 
 
 
511 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000549038 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2077  hypothetical protein  25.37 
 
 
508 aa  144  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0719754  normal  0.0665585 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1761  hypothetical protein  24.62 
 
 
511 aa  144  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329639  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41710  hypothetical protein  24.95 
 
 
508 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2430  hypothetical protein  28.21 
 
 
516 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3540  hypothetical protein  24.95 
 
 
508 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2084  gonadoliberin III-related protein  25.63 
 
 
501 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0826807  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2580  gonadoliberin III-related protein  25.63 
 
 
504 aa  135  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00280281  hitchhiker  0.00000893339 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1848  gonadoliberin III-related protein  27.35 
 
 
500 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.860631  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01592  hypothetical protein  25.77 
 
 
501 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003931  gonadoliberin III-related protein  26.02 
 
 
501 aa  131  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2085  gonadoliberin III-related protein  25.47 
 
 
502 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1948  hypothetical protein  25.48 
 
 
502 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0098  hypothetical protein  24.12 
 
 
507 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0083  hypothetical protein  24.12 
 
 
507 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1893  gonadoliberin III-related protein  25.85 
 
 
502 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.670166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2025  gonadoliberin III-related protein  29.72 
 
 
503 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.281213  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2189  gonadoliberin III-related protein  25.92 
 
 
502 aa  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00173239  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2033  gonadoliberin III-related protein  25.72 
 
 
501 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2312  gonadoliberin III-related protein  25.72 
 
 
501 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2428  gonadoliberin III-related protein  25.72 
 
 
501 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.142743  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1892  gonadoliberin III-related protein  25.87 
 
 
502 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00034155  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0730  hypothetical protein  25.51 
 
 
502 aa  120  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2371  gonadoliberin III-related protein  24.18 
 
 
502 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00837826  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2035  gonadoliberin III-related protein  24.49 
 
 
504 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17779  hitchhiker  0.0000537383 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1106  hypothetical protein  30.06 
 
 
505 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1880  hypothetical protein  28.51 
 
 
502 aa  108  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28303  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2271  hypothetical protein  32.11 
 
 
505 aa  107  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.669345  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1882  membrane protein  23.37 
 
 
502 aa  107  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0770  hypothetical protein  27.93 
 
 
506 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232253  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2043  hypothetical protein  24.58 
 
 
505 aa  103  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.474553  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3347  hypothetical protein  27.33 
 
 
517 aa  96.7  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00261859  hitchhiker  0.00987006 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4178  transglutaminase domain-containing protein  37.14 
 
 
485 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00683366  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  30.5 
 
 
485 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  31.2 
 
 
492 aa  70.9  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  35.2 
 
 
515 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3887  transglutaminase domain protein  34.53 
 
 
478 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.978849 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3803  transglutaminase domain protein  36.22 
 
 
478 aa  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  30.52 
 
 
634 aa  65.1  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  28.78 
 
 
500 aa  61.6  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0053  transglutaminase-like  27.2 
 
 
484 aa  61.2  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.538035 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  33.61 
 
 
1305 aa  60.8  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  33.57 
 
 
265 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  43.02 
 
 
259 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  42.25 
 
 
276 aa  57  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  43.02 
 
 
259 aa  57  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  42.25 
 
 
276 aa  57  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  33.33 
 
 
269 aa  57  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  43.02 
 
 
259 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  32.59 
 
 
274 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  34.17 
 
 
269 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  32.8 
 
 
266 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  43.48 
 
 
277 aa  55.5  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5617  transglutaminase domain protein  38.95 
 
 
517 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0710722 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  37.08 
 
 
264 aa  55.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  32.35 
 
 
275 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  32.56 
 
 
265 aa  54.7  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4075  transglutaminase domain-containing protein  34.48 
 
 
287 aa  54.3  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  43.02 
 
 
266 aa  54.3  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  31.62 
 
 
274 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  33.07 
 
 
266 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  42.67 
 
 
259 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11690  hypothetical protein  32.28 
 
 
310 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.556512  normal  0.379907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  39.73 
 
 
269 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2984  transglutaminase domain protein  31.39 
 
 
302 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  33.64 
 
 
268 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2845  transglutaminase domain protein  33.03 
 
 
243 aa  52.8  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  40.45 
 
 
266 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  35.35 
 
 
279 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  35.35 
 
 
279 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  34.44 
 
 
279 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  35.35 
 
 
279 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  41.67 
 
 
268 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1644  transglutaminase domain protein  34.12 
 
 
379 aa  52  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  35.37 
 
 
263 aa  51.6  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1555  transglutaminase domain-containing protein  36.78 
 
 
290 aa  51.6  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  32.29 
 
 
436 aa  51.2  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  29.06 
 
 
287 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  35.42 
 
 
274 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  35.65 
 
 
273 aa  50.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
279 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  27.12 
 
 
338 aa  50.4  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  34.52 
 
 
296 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  34.52 
 
 
286 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  29.8 
 
 
266 aa  50.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  42.11 
 
 
280 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5604  transglutaminase domain-containing protein  36.59 
 
 
309 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.639349  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>