More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0892 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0892  transglutaminase domain protein  100 
 
 
277 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5163  transglutaminase domain protein  58.89 
 
 
279 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4657  transglutaminase domain protein  52.13 
 
 
289 aa  282  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1392  transglutaminase-like enzyme, cysteine protease  48.43 
 
 
1151 aa  268  5e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.284441  normal  0.67203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0393  transglutaminase domain-containing protein  47.04 
 
 
1114 aa  265  7e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1014  transglutaminase domain protein  48.08 
 
 
1128 aa  261  8.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3099  transglutaminase-like domain-containing protein  47.04 
 
 
1116 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.595628  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2637  transglutaminase domain-containing protein  45.3 
 
 
1091 aa  249  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0330314  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2628  transglutaminase domain-containing protein  46.44 
 
 
1112 aa  249  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329937  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0515  transglutaminase domain-containing protein  45.33 
 
 
1136 aa  247  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3010  transglutaminase-like  46.69 
 
 
1117 aa  247  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.424161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3771  transglutaminase domain-containing protein  44.75 
 
 
1133 aa  247  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510583  normal  0.20356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5370  transglutaminase domain protein  47.2 
 
 
1081 aa  247  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1496  transglutaminase domain protein  44.95 
 
 
1188 aa  246  2e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2470  transglutaminase domain-containing protein  47.2 
 
 
1122 aa  246  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.42853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0655  transglutaminase domain-containing protein  46.69 
 
 
1097 aa  246  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.559922  hitchhiker  0.000135984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2558  transglutaminase-like  45.99 
 
 
1090 aa  246  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.884999  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0067  transglutaminase-like  45.99 
 
 
1147 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3159  transglutaminase-like  45.64 
 
 
1217 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.668757  normal  0.863803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3512  transglutaminase domain protein  45.83 
 
 
1141 aa  246  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2907  transglutaminase-like domain protein  45.61 
 
 
1120 aa  244  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2524  transglutaminase domain protein  45.61 
 
 
1120 aa  244  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0988  transglutaminase domain-containing protein  43.21 
 
 
1119 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0588  transglutaminase-like  45.99 
 
 
1092 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.332727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2315  Protein of unknown function DUF2126  44.63 
 
 
1155 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0702822  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1309  Protein of unknown function DUF2126  45.52 
 
 
1100 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.544002  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3334  transglutaminase domain protein  45.42 
 
 
1139 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387126  normal  0.0234354 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4926  transglutaminase-like superfamily domain protein  45.64 
 
 
1092 aa  242  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0541  transglutaminase-like  45.3 
 
 
1091 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.649463  normal  0.642878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2320  transglutaminase-like protein  45.08 
 
 
1108 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0950324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2367  transglutaminase domain-containing protein  45.08 
 
 
1108 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.021822  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1065  transglutaminase domain-containing protein  45.58 
 
 
1121 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.417532 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1778  transglutaminase domain-containing protein  44.48 
 
 
1140 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.527948  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2055  transglutaminase-like superfamily protein  44.48 
 
 
1140 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1063  transglutaminase domain-containing protein  44.48 
 
 
1140 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2359  transglutaminase domain-containing protein  45.08 
 
 
1108 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0769  transglutaminase domain-containing protein  44.48 
 
 
1140 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.106544  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0678  transglutaminase domain-containing protein  44.48 
 
 
1140 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5075  transglutaminase domain-containing protein  46.32 
 
 
1080 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.804608  normal  0.120829 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2038  transglutaminase domain-containing protein  44.48 
 
 
1140 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.654776  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0770  transglutaminase domain-containing protein  44.48 
 
 
1140 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3879  transglutaminase domain protein  45.52 
 
 
1158 aa  239  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12586  hypothetical protein  44.63 
 
 
1140 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.265908  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0725  transglutaminase family protein  45.3 
 
 
1157 aa  238  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101578  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2947  hypothetical protein  43.55 
 
 
1103 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.104803 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2553  transglutaminase-like superfamily protein  44.25 
 
 
1169 aa  238  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4005  transglutaminase domain-containing protein  44.14 
 
 
1144 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962784  normal  0.211891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0210  transglutaminase domain protein  46.52 
 
 
1122 aa  237  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1919  transglutaminase domain-containing protein  43.79 
 
 
1145 aa  236  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1701  transglutaminase-like  43.06 
 
 
1090 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126756  normal  0.484971 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4110  transglutaminase domain-containing protein  43.79 
 
 
1148 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4406  transglutaminase domain protein  45.3 
 
 
1157 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.298511 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3522  transglutaminase domain-containing protein  44.14 
 
 
1149 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.585862  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2605  transglutaminase domain-containing protein  43.21 
 
 
1174 aa  236  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04320  transglutaminase domain protein  43.9 
 
 
1118 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1218  transglutaminase domain-containing protein  45.3 
 
 
1135 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.695465  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1933  transglutaminase-like  44.14 
 
 
1142 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.643054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3033  transglutaminase domain-containing protein  42.86 
 
 
1100 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3412  transglutaminase domain-containing protein  43.79 
 
 
1137 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298435  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4489  transglutaminase domain-containing protein  44.25 
 
 
1142 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4255  transglutaminase-like  43.79 
 
 
1137 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253349  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4111  transglutaminase domain-containing protein  43.79 
 
 
1137 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70474  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3585  transglutaminase-like  43.75 
 
 
1128 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.222679  normal  0.726735 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3405  transglutaminase domain protein  45.14 
 
 
1180 aa  231  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1712  transglutaminase-like  43.4 
 
 
1114 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.347512 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2246  transglutaminase domain protein  44.14 
 
 
1145 aa  229  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.637206  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3608  transglutaminase domain protein  45.33 
 
 
1104 aa  226  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  0.238952 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4275  transglutaminase domain protein  44.06 
 
 
1113 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0684346  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1621  transglutaminase domain-containing protein  43.75 
 
 
1091 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0187167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4758  transglutaminase domain-containing protein  46.64 
 
 
1125 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446948  normal  0.0794526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3415  transglutaminase domain-containing protein  44.29 
 
 
1116 aa  221  7e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296016  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3343  transglutaminase domain protein  45.39 
 
 
1108 aa  221  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2051  Protein of unknown function DUF2126  41.32 
 
 
1078 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.238647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3724  transglutaminase domain protein  43.94 
 
 
1116 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.565418  normal  0.0894015 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3752  hypothetical protein  45.02 
 
 
1114 aa  218  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139209  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3645  transglutaminase domain protein  44.65 
 
 
1108 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701627  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0857  transglutaminase domain protein  42.16 
 
 
1112 aa  215  8e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250645  normal  0.314962 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2614  transglutaminase domain-containing protein  43.71 
 
 
1107 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.95635 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0954  transglutaminase-like domain-containing protein  43.71 
 
 
1173 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.722165  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3017  transglutaminase domain-containing protein  42.31 
 
 
1127 aa  201  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0756013  normal  0.525776 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1984  transglutaminase-like  35.63 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4490  transglutaminase domain protein  36.29 
 
 
296 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4426  transglutaminase domain protein  36.29 
 
 
296 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1034  transglutaminase-like  34.51 
 
 
287 aa  151  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4766  transglutaminase domain protein  33.84 
 
 
290 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00820  Transglutaminase-like Super Family Protein  35.85 
 
 
313 aa  142  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3591  transglutaminase domain protein  35.21 
 
 
291 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2855  transglutaminase domain protein  35.11 
 
 
276 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0224006  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2266  transglutaminase-like  32.84 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4755  transglutaminase domain protein  31.2 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1611  transglutaminase domain protein  30.68 
 
 
305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5097  hypothetical protein  29.69 
 
 
297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1555  transglutaminase domain-containing protein  33.71 
 
 
290 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4075  transglutaminase domain-containing protein  32.67 
 
 
287 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1814  transglutaminase domain protein  31.2 
 
 
302 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.853279 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1847  transglutaminase-like  31.69 
 
 
300 aa  122  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5604  transglutaminase domain-containing protein  32.61 
 
 
309 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.639349  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2753  transglutaminase-like  32.08 
 
 
288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.251215  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4135  transglutaminase-like  31.85 
 
 
304 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1408  transglutaminase domain protein  31.02 
 
 
302 aa  119  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.543659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>