More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3010 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0210  transglutaminase domain protein  56.13 
 
 
1122 aa  1267    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0988  transglutaminase domain-containing protein  54.64 
 
 
1119 aa  1251    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4926  transglutaminase-like superfamily domain protein  68.46 
 
 
1092 aa  1600    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0770  transglutaminase domain-containing protein  65.06 
 
 
1140 aa  1501    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3645  transglutaminase domain protein  56.34 
 
 
1108 aa  1275    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701627  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3334  transglutaminase domain protein  49.32 
 
 
1139 aa  1093    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387126  normal  0.0234354 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1778  transglutaminase domain-containing protein  65.06 
 
 
1140 aa  1501    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.527948  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2553  transglutaminase-like superfamily protein  63.68 
 
 
1169 aa  1476    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0588  transglutaminase-like  68.19 
 
 
1092 aa  1596    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.332727 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2907  transglutaminase-like domain protein  55.26 
 
 
1120 aa  1248    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4005  transglutaminase domain-containing protein  63.76 
 
 
1144 aa  1491    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962784  normal  0.211891 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1218  transglutaminase domain-containing protein  61.41 
 
 
1135 aa  1458    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.695465  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3010  transglutaminase-like  100 
 
 
1117 aa  2315    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.424161 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3752  hypothetical protein  55.9 
 
 
1114 aa  1260    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139209  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0067  transglutaminase-like  62.26 
 
 
1147 aa  1437    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1621  transglutaminase domain-containing protein  55.81 
 
 
1091 aa  1222    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0187167 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2614  transglutaminase domain-containing protein  55.21 
 
 
1107 aa  1177    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.95635 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2055  transglutaminase-like superfamily protein  64.97 
 
 
1140 aa  1503    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0515  transglutaminase domain-containing protein  59.07 
 
 
1136 aa  1283    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0541  transglutaminase-like  69.95 
 
 
1091 aa  1612    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.649463  normal  0.642878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2947  hypothetical protein  58.04 
 
 
1103 aa  1285    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.104803 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2524  transglutaminase domain protein  55.26 
 
 
1120 aa  1248    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0954  transglutaminase-like domain-containing protein  55.39 
 
 
1173 aa  1190    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.722165  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5370  transglutaminase domain protein  56.88 
 
 
1081 aa  1241    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0655  transglutaminase domain-containing protein  72.07 
 
 
1097 aa  1623    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.559922  hitchhiker  0.000135984 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1933  transglutaminase-like  63.53 
 
 
1142 aa  1500    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.643054 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3415  transglutaminase domain-containing protein  55.8 
 
 
1116 aa  1259    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296016  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2051  Protein of unknown function DUF2126  45.76 
 
 
1078 aa  931    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.238647 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3343  transglutaminase domain protein  56.97 
 
 
1108 aa  1283    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2558  transglutaminase-like  59.79 
 
 
1090 aa  1352    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.884999  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4489  transglutaminase domain-containing protein  61.93 
 
 
1142 aa  1449    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1919  transglutaminase domain-containing protein  64.8 
 
 
1145 aa  1494    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1712  transglutaminase-like  57.97 
 
 
1114 aa  1302    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.347512 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2246  transglutaminase domain protein  54.89 
 
 
1145 aa  1244    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.637206  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3608  transglutaminase domain protein  55.49 
 
 
1104 aa  1248    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  0.238952 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1309  Protein of unknown function DUF2126  54.87 
 
 
1100 aa  1225    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.544002  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3412  transglutaminase domain-containing protein  64.64 
 
 
1137 aa  1512    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298435  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2470  transglutaminase domain-containing protein  56.87 
 
 
1122 aa  1264    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.42853 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3879  transglutaminase domain protein  67.56 
 
 
1158 aa  1570    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3099  transglutaminase-like domain-containing protein  56.19 
 
 
1116 aa  1314    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.595628  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2315  Protein of unknown function DUF2126  48.91 
 
 
1155 aa  1054    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0702822  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1701  transglutaminase-like  58.27 
 
 
1090 aa  1286    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126756  normal  0.484971 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4275  transglutaminase domain protein  58.19 
 
 
1113 aa  1288    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0684346  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4110  transglutaminase domain-containing protein  63.36 
 
 
1148 aa  1490    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0678  transglutaminase domain-containing protein  64.89 
 
 
1140 aa  1501    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0769  transglutaminase domain-containing protein  64.97 
 
 
1140 aa  1503    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.106544  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3159  transglutaminase-like  60.26 
 
 
1217 aa  1486    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.668757  normal  0.863803 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1496  transglutaminase domain protein  62.9 
 
 
1188 aa  696    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0725  transglutaminase family protein  61.68 
 
 
1157 aa  1417    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101578  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3512  transglutaminase domain protein  54.29 
 
 
1141 aa  1263    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2605  transglutaminase domain-containing protein  62.95 
 
 
1174 aa  1508    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3585  transglutaminase-like  57.61 
 
 
1128 aa  1297    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.222679  normal  0.726735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3771  transglutaminase domain-containing protein  48.63 
 
 
1133 aa  1038    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510583  normal  0.20356 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3405  transglutaminase domain protein  61 
 
 
1180 aa  1461    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04320  transglutaminase domain protein  70.13 
 
 
1118 aa  1640    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4255  transglutaminase-like  64.47 
 
 
1137 aa  1505    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253349  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2320  transglutaminase-like protein  50.74 
 
 
1108 aa  1044    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0950324  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0857  transglutaminase domain protein  56.91 
 
 
1112 aa  1216    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250645  normal  0.314962 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1392  transglutaminase-like enzyme, cysteine protease  54.36 
 
 
1151 aa  1251    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.284441  normal  0.67203 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3522  transglutaminase domain-containing protein  63.45 
 
 
1149 aa  1488    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.585862  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3017  transglutaminase domain-containing protein  55.13 
 
 
1127 aa  1164    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0756013  normal  0.525776 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1063  transglutaminase domain-containing protein  65.06 
 
 
1140 aa  1500    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3724  transglutaminase domain protein  55.98 
 
 
1116 aa  1262    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.565418  normal  0.0894015 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1014  transglutaminase domain protein  58.6 
 
 
1128 aa  1338    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4111  transglutaminase domain-containing protein  64.47 
 
 
1137 aa  1505    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70474  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2637  transglutaminase domain-containing protein  57.28 
 
 
1091 aa  1236    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0330314  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0393  transglutaminase domain-containing protein  55.26 
 
 
1114 aa  1278    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12586  hypothetical protein  50.3 
 
 
1140 aa  1056    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.265908  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4758  transglutaminase domain-containing protein  54.75 
 
 
1125 aa  1192    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446948  normal  0.0794526 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2359  transglutaminase domain-containing protein  50.57 
 
 
1108 aa  1039    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2367  transglutaminase domain-containing protein  50.74 
 
 
1108 aa  1044    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.021822  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4406  transglutaminase domain protein  61.76 
 
 
1157 aa  1439    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.298511 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2628  transglutaminase domain-containing protein  50.17 
 
 
1112 aa  1037    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329937  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5075  transglutaminase domain-containing protein  57.46 
 
 
1080 aa  1255    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.804608  normal  0.120829 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3033  transglutaminase domain-containing protein  66.25 
 
 
1100 aa  1551    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1065  transglutaminase domain-containing protein  56.1 
 
 
1121 aa  1252    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.417532 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2038  transglutaminase domain-containing protein  65.06 
 
 
1140 aa  1500    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.654776  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1477  hypothetical protein  37.64 
 
 
731 aa  462  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.288638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4657  transglutaminase domain protein  52.82 
 
 
289 aa  313  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0892  transglutaminase domain protein  46.69 
 
 
277 aa  247  6.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5163  transglutaminase domain protein  41.4 
 
 
279 aa  224  9e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2052  Protein of unknown function DUF2126  32.79 
 
 
697 aa  190  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.598866 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1984  transglutaminase-like  36.06 
 
 
291 aa  172  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4490  transglutaminase domain protein  35.11 
 
 
296 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4426  transglutaminase domain protein  35.11 
 
 
296 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00820  Transglutaminase-like Super Family Protein  37.27 
 
 
313 aa  164  9e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2855  transglutaminase domain protein  34.07 
 
 
276 aa  153  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0224006  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3591  transglutaminase domain protein  35.14 
 
 
291 aa  152  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2984  transglutaminase domain protein  33.09 
 
 
302 aa  150  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1611  transglutaminase domain protein  33.99 
 
 
305 aa  150  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1034  transglutaminase-like  35.27 
 
 
287 aa  148  5e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1814  transglutaminase domain protein  32.38 
 
 
290 aa  148  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.070269  hitchhiker  0.00579618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2008  transglutaminase domain protein  32.38 
 
 
290 aa  147  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.200502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1814  transglutaminase domain protein  35.82 
 
 
302 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.853279 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5097  hypothetical protein  31.67 
 
 
297 aa  146  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1847  transglutaminase-like  34.11 
 
 
300 aa  146  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0273  transglutaminase domain-containing protein  33.58 
 
 
328 aa  146  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.260289 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4766  transglutaminase domain protein  33.58 
 
 
290 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4755  transglutaminase domain protein  32.32 
 
 
302 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5604  transglutaminase domain-containing protein  31.65 
 
 
309 aa  135  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.639349  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>