230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1321 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  94.46 
 
 		 632 aa  1123    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 632 aa  1252    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  42.74 
 
 		 644 aa  464  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  42.99 
 
 		 644 aa  445  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  40.16 
 
 		 634 aa  392  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  41.56 
 
 		 639 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  37.11 
 
 		 633 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  33.8 
 
 		 634 aa  302  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  30.63 
 
 		 631 aa  248  4e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  29.81 
 
 		 676 aa  180  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  32.04 
 
 		 653 aa  172  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  29.5 
 
 		 645 aa  167  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  29.94 
 
 		 645 aa  167  6.9999999999999995e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  27.12 
 
 		 680 aa  166  9e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  26.5 
 
 		 683 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  31.76 
 
 		 674 aa  164  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  31.76 
 
 		 674 aa  164  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  29.27 
 
 		 681 aa  163  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  31.25 
 
 		 641 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  28.44 
 
 		 689 aa  161  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  28.94 
 
 		 662 aa  161  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  26.24 
 
 		 730 aa  157  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  23.71 
 
 		 637 aa  155  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  27.42 
 
 		 705 aa  152  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  27.88 
 
 		 684 aa  151  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  29.03 
 
 		 730 aa  150  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  29.32 
 
 		 673 aa  150  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  28.69 
 
 		 680 aa  150  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  28.22 
 
 		 691 aa  150  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  28.14 
 
 		 667 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  27.11 
 
 		 671 aa  147  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  26.08 
 
 		 656 aa  145  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  29.25 
 
 		 672 aa  145  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  29.49 
 
 		 667 aa  144  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  29.25 
 
 		 689 aa  144  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  28.07 
 
 		 688 aa  143  9e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  25.86 
 
 		 674 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  27.87 
 
 		 696 aa  141  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  29.37 
 
 		 669 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  27.27 
 
 		 688 aa  139  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  31.3 
 
 		 661 aa  139  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  27.67 
 
 		 767 aa  137  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  29.01 
 
 		 689 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  29.36 
 
 		 673 aa  136  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  32.03 
 
 		 943 aa  134  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  26.79 
 
 		 767 aa  133  7.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  27.96 
 
 		 744 aa  133  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  29.02 
 
 		 706 aa  130  9.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  26.56 
 
 		 754 aa  129  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  23.66 
 
 		 662 aa  129  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  23.54 
 
 		 662 aa  128  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  27.37 
 
 		 635 aa  127  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  25.89 
 
 		 732 aa  127  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  27.1 
 
 		 676 aa  127  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  26.69 
 
 		 685 aa  124  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  26.28 
 
 		 715 aa  124  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  30.33 
 
 		 662 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  26.28 
 
 		 715 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  24.22 
 
 		 707 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  27.44 
 
 		 698 aa  120  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  25.84 
 
 		 715 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  33.01 
 
 		 685 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  33.01 
 
 		 685 aa  117  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  27.72 
 
 		 668 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  29.07 
 
 		 681 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  28.16 
 
 		 709 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  30.77 
 
 		 649 aa  115  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  29.12 
 
 		 668 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  31.53 
 
 		 692 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  25.75 
 
 		 734 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  25.75 
 
 		 734 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  24.41 
 
 		 739 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  24.41 
 
 		 739 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  27.23 
 
 		 726 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  32.94 
 
 		 862 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1293  transglutaminase domain protein  23.83 
 
 		 803 aa  104  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269788  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  32.38 
 
 		 737 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  39.57 
 
 		 790 aa  100  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4603  transglutaminase domain-containing protein  25.26 
 
 		 764 aa  99  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  22.11 
 
 		 660 aa  97.4  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  35.97 
 
 		 742 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  35.97 
 
 		 742 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  35.29 
 
 		 720 aa  93.2  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  38.35 
 
 		 763 aa  93.2  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  35.25 
 
 		 742 aa  90.5  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  35.25 
 
 		 742 aa  90.5  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  35.25 
 
 		 742 aa  90.1  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  35.25 
 
 		 742 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 826 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  34.53 
 
 		 742 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  31.21 
 
 		 728 aa  87.4  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  34.53 
 
 		 742 aa  87.4  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  34.53 
 
 		 742 aa  87  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  23.37 
 
 		 687 aa  86.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0440  transglutaminase domain protein  36.43 
 
 		 748 aa  85.9  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  34.53 
 
 		 635 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  23.38 
 
 		 730 aa  85.5  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  28.07 
 
 		 795 aa  85.1  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  31.51 
 
 		 815 aa  84.3  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  26.67 
 
 		 760 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>