More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1181 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  100 
 
 
760 aa  1561    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  30.29 
 
 
890 aa  144  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  44.44 
 
 
788 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  28.21 
 
 
806 aa  136  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  40.88 
 
 
790 aa  135  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  31.29 
 
 
728 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  42.14 
 
 
800 aa  132  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  33.68 
 
 
862 aa  129  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  42.75 
 
 
720 aa  125  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  35.16 
 
 
742 aa  122  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  42.75 
 
 
815 aa  121  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  27.84 
 
 
800 aa  120  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  35.16 
 
 
742 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  35.16 
 
 
742 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  40.12 
 
 
763 aa  120  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  27.18 
 
 
730 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  35.16 
 
 
742 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  35.16 
 
 
742 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  27.47 
 
 
742 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  41.67 
 
 
737 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  33.48 
 
 
681 aa  119  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  33.52 
 
 
742 aa  119  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  38.13 
 
 
742 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  37.41 
 
 
742 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  37.41 
 
 
635 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  36.84 
 
 
744 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  40.29 
 
 
795 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  33.51 
 
 
734 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  33.51 
 
 
734 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  33.51 
 
 
707 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  39.44 
 
 
674 aa  115  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  43.28 
 
 
826 aa  115  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  34.04 
 
 
739 aa  114  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  34.04 
 
 
739 aa  114  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  38 
 
 
850 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  36.26 
 
 
730 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  41.67 
 
 
709 aa  110  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  39.22 
 
 
680 aa  109  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0440  transglutaminase domain protein  32.43 
 
 
748 aa  109  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  36.53 
 
 
782 aa  108  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  34.91 
 
 
730 aa  108  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  28.81 
 
 
691 aa  107  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  26.97 
 
 
689 aa  107  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  35.29 
 
 
846 aa  107  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  41.35 
 
 
943 aa  107  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  35.66 
 
 
790 aa  107  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  40.91 
 
 
825 aa  107  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  36.62 
 
 
667 aa  106  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  33.68 
 
 
715 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  33.68 
 
 
715 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  33.63 
 
 
676 aa  105  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  36.18 
 
 
689 aa  105  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  33.68 
 
 
715 aa  105  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  36 
 
 
783 aa  104  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  39.39 
 
 
633 aa  104  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  38.81 
 
 
767 aa  103  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  31.95 
 
 
812 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  37.41 
 
 
767 aa  103  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  36.55 
 
 
762 aa  103  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  35.29 
 
 
732 aa  102  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  37.35 
 
 
653 aa  103  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  36.42 
 
 
736 aa  103  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  25.32 
 
 
662 aa  101  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  32.42 
 
 
645 aa  100  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  38.78 
 
 
840 aa  100  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  39.13 
 
 
661 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  25.5 
 
 
668 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1473  transglutaminase-like  22.87 
 
 
753 aa  99  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.647705  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  32.83 
 
 
815 aa  98.6  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1208  transglutaminase domain-containing protein  32.72 
 
 
831 aa  98.2  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  38.81 
 
 
662 aa  97.8  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  37.41 
 
 
681 aa  97.8  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  35.76 
 
 
810 aa  97.8  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  29.67 
 
 
669 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  34.21 
 
 
671 aa  97.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0156  transglutaminase-like  25.95 
 
 
799 aa  96.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.0989488 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  33.57 
 
 
639 aa  96.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  36.57 
 
 
644 aa  96.3  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  36.3 
 
 
674 aa  95.9  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  36.3 
 
 
674 aa  95.9  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  37.59 
 
 
673 aa  95.9  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  36.43 
 
 
774 aa  96.3  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  37.76 
 
 
725 aa  96.3  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  38.93 
 
 
914 aa  95.5  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  33.52 
 
 
688 aa  95.1  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1077  transglutaminase domain protein  24.02 
 
 
770 aa  95.1  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2905  transglutaminase domain protein  22.83 
 
 
769 aa  94.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  34.03 
 
 
641 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  39.2 
 
 
668 aa  93.2  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  32.96 
 
 
688 aa  92.8  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  34.81 
 
 
662 aa  92.4  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3804  transglutaminase domain-containing protein  39.86 
 
 
820 aa  92  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3747  transglutaminase domain protein  25 
 
 
768 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664376  normal  0.434261 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  38.73 
 
 
685 aa  92  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  34.07 
 
 
662 aa  91.3  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  27.38 
 
 
754 aa  90.9  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  31.89 
 
 
689 aa  90.9  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  32.37 
 
 
726 aa  90.5  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  34.59 
 
 
771 aa  89.4  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  30.81 
 
 
696 aa  89.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>