255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4558 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
790 aa  1558    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  46.18 
 
 
763 aa  551  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  33.22 
 
 
812 aa  271  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  32.12 
 
 
810 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  31.03 
 
 
846 aa  239  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1208  transglutaminase domain-containing protein  30.58 
 
 
831 aa  236  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  32.16 
 
 
850 aa  229  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  33.14 
 
 
762 aa  227  7e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  31.72 
 
 
800 aa  225  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  35.38 
 
 
788 aa  224  6e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  33.62 
 
 
798 aa  223  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  30.48 
 
 
825 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  33.85 
 
 
782 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  33.6 
 
 
725 aa  207  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  35.73 
 
 
790 aa  188  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  33.47 
 
 
771 aa  181  5.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  34.37 
 
 
783 aa  164  6e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  28.31 
 
 
914 aa  142  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  25.88 
 
 
794 aa  135  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  29.01 
 
 
743 aa  134  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  25.87 
 
 
818 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  28.92 
 
 
720 aa  125  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  27.59 
 
 
822 aa  124  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  31.31 
 
 
792 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  27.97 
 
 
890 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27440  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  32.97 
 
 
859 aa  119  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  29.97 
 
 
736 aa  118  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  31.46 
 
 
749 aa  117  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  35.82 
 
 
815 aa  117  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  27.78 
 
 
728 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3804  transglutaminase domain-containing protein  27.85 
 
 
820 aa  112  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  34.33 
 
 
862 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  35.54 
 
 
774 aa  110  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  25.61 
 
 
730 aa  108  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  32.04 
 
 
790 aa  107  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  35.76 
 
 
840 aa  106  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  35.42 
 
 
760 aa  107  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  28.13 
 
 
827 aa  106  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  36.61 
 
 
800 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  44.68 
 
 
744 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5534  transglutaminase domain protein  30.77 
 
 
753 aa  99.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0283272  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  27.78 
 
 
742 aa  97.8  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  22.35 
 
 
795 aa  97.4  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  40.99 
 
 
737 aa  97.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  28.1 
 
 
742 aa  95.9  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  26.06 
 
 
742 aa  95.1  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  37.82 
 
 
635 aa  94  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2535  transglutaminase domain protein  34.46 
 
 
748 aa  94  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8517  transglutaminase domain protein  26.96 
 
 
788 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0481033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  29.29 
 
 
815 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  37.41 
 
 
730 aa  91.7  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  35.21 
 
 
886 aa  90.5  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  24.36 
 
 
742 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  39.45 
 
 
673 aa  90.1  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  26.53 
 
 
806 aa  90.1  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  28.64 
 
 
742 aa  89.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  28.16 
 
 
742 aa  90.1  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  28.64 
 
 
742 aa  89.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  30.25 
 
 
826 aa  89.7  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  28.64 
 
 
742 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  34.09 
 
 
689 aa  89.7  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  25.74 
 
 
742 aa  88.2  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3833  transglutaminase domain protein  31.02 
 
 
790 aa  87.8  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0481829  normal  0.0321175 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  43.69 
 
 
943 aa  87.4  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3572  transglutaminase domain protein  42.74 
 
 
982 aa  87.4  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0384986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  23.45 
 
 
635 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  38.53 
 
 
684 aa  86.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  38.53 
 
 
688 aa  87  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
685 aa  87.4  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2914  transglutaminase domain-containing protein  28.36 
 
 
769 aa  87  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2344  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  37.61 
 
 
688 aa  85.9  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  37.11 
 
 
673 aa  86.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  38.67 
 
 
673 aa  86.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  32.37 
 
 
677 aa  85.9  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  32.38 
 
 
706 aa  85.5  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  33.53 
 
 
726 aa  85.1  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  30.77 
 
 
680 aa  84.7  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  32.32 
 
 
676 aa  84.7  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  34.29 
 
 
639 aa  84.3  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  33.11 
 
 
681 aa  84  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0960  transglutaminase-like cysteine protease  26 
 
 
837 aa  82.8  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  36.96 
 
 
644 aa  81.6  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  28 
 
 
763 aa  81.6  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  38.84 
 
 
767 aa  80.9  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  34.09 
 
 
730 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0440  transglutaminase domain protein  29.67 
 
 
748 aa  80.9  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  34.39 
 
 
683 aa  80.9  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3114  transglutaminase domain-containing protein  29.17 
 
 
784 aa  80.1  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.0170569 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  27.01 
 
 
674 aa  80.1  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  40.91 
 
 
706 aa  79.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  27.01 
 
 
674 aa  80.1  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  25.67 
 
 
660 aa  79.3  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  37.84 
 
 
685 aa  79.7  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  37.84 
 
 
685 aa  80.1  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  38.84 
 
 
767 aa  79  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2905  transglutaminase domain protein  26.65 
 
 
769 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  35.04 
 
 
691 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  29.44 
 
 
676 aa  78.2  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  43.4 
 
 
653 aa  77.8  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  32.59 
 
 
709 aa  77.4  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>