More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5565 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  100 
 
 
676 aa  1326    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  63.57 
 
 
671 aa  788    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  51.38 
 
 
681 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  53.2 
 
 
674 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  53.2 
 
 
674 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  39.64 
 
 
653 aa  388  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  39.04 
 
 
656 aa  339  8e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  36.36 
 
 
705 aa  336  7e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  34.75 
 
 
732 aa  336  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  37.2 
 
 
641 aa  334  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  39.62 
 
 
661 aa  334  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  34.53 
 
 
667 aa  333  5e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  37.94 
 
 
645 aa  332  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  38.14 
 
 
662 aa  331  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  33.91 
 
 
691 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  32.42 
 
 
689 aa  325  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  37.8 
 
 
669 aa  323  8e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  33.38 
 
 
707 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  32.79 
 
 
715 aa  319  9e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  32.97 
 
 
674 aa  318  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  32.2 
 
 
715 aa  318  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  34.01 
 
 
680 aa  318  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  37.95 
 
 
668 aa  317  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  32.05 
 
 
715 aa  316  9e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  38.71 
 
 
662 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  31.97 
 
 
734 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  32.4 
 
 
739 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  32.4 
 
 
739 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  31.82 
 
 
734 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  38.06 
 
 
645 aa  303  9e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  33.18 
 
 
683 aa  302  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  31.46 
 
 
709 aa  297  5e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  34.72 
 
 
680 aa  297  5e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  32.79 
 
 
689 aa  294  4e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  33.81 
 
 
730 aa  293  9e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  36.9 
 
 
767 aa  291  3e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  36.4 
 
 
767 aa  289  1e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  35.28 
 
 
696 aa  288  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  36.08 
 
 
673 aa  285  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  38.82 
 
 
672 aa  282  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  34.5 
 
 
754 aa  282  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  34.13 
 
 
667 aa  278  2e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  35.8 
 
 
673 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  37.21 
 
 
635 aa  272  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  35.96 
 
 
689 aa  272  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  37.21 
 
 
684 aa  271  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  35.43 
 
 
688 aa  268  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  35.58 
 
 
688 aa  268  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  29.08 
 
 
662 aa  263  8e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  29.62 
 
 
660 aa  257  4e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  34.55 
 
 
685 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  34.55 
 
 
685 aa  254  3e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  35.65 
 
 
676 aa  252  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  37.52 
 
 
685 aa  250  7e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  35.05 
 
 
698 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  28.68 
 
 
662 aa  244  5e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  35.27 
 
 
668 aa  243  7e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  37.56 
 
 
649 aa  241  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  39.85 
 
 
943 aa  240  5.999999999999999e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  35.69 
 
 
726 aa  225  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  35.56 
 
 
706 aa  210  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  34.06 
 
 
687 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  32.6 
 
 
633 aa  187  8e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  31.06 
 
 
632 aa  182  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  31.71 
 
 
632 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  30.71 
 
 
692 aa  172  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  32.16 
 
 
639 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  28.23 
 
 
634 aa  167  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  32.97 
 
 
644 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  31.5 
 
 
644 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  26.54 
 
 
631 aa  160  8e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  25.71 
 
 
744 aa  140  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  29.29 
 
 
634 aa  136  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  25.04 
 
 
730 aa  125  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  22.15 
 
 
637 aa  120  9e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  31.79 
 
 
790 aa  120  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  34.81 
 
 
826 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  33.46 
 
 
737 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1077  transglutaminase domain protein  27.07 
 
 
770 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785713 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  31.13 
 
 
760 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  30.54 
 
 
815 aa  104  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2905  transglutaminase domain protein  23.35 
 
 
769 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  38.46 
 
 
681 aa  100  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  24.86 
 
 
862 aa  99  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  32.65 
 
 
806 aa  98.2  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  26.77 
 
 
800 aa  98.2  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4603  transglutaminase domain-containing protein  26.97 
 
 
764 aa  97.4  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1473  transglutaminase-like  23.92 
 
 
753 aa  94.4  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.647705  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  35 
 
 
706 aa  94.4  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  33.17 
 
 
850 aa  94.4  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  27.97 
 
 
774 aa  92.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3693  transglutaminase domain protein  23.59 
 
 
768 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  27.73 
 
 
763 aa  90.1  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3747  transglutaminase domain protein  23.19 
 
 
768 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664376  normal  0.434261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  39.06 
 
 
800 aa  89.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0156  transglutaminase-like  21.73 
 
 
799 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.0989488 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  35.75 
 
 
792 aa  89  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  41.67 
 
 
788 aa  89  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  27.55 
 
 
815 aa  86.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  32.31 
 
 
763 aa  85.5  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>