More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2350 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  52.93 
 
 		 732 aa  739    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  51.51 
 
 		 734 aa  719    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  52.59 
 
 		 707 aa  719    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  50.65 
 
 		 739 aa  710    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  50.65 
 
 		 739 aa  710    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  51.09 
 
 		 709 aa  697    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  47.79 
 
 		 689 aa  660    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  100 
 
 		 730 aa  1494    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  53.91 
 
 		 680 aa  646    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  51.51 
 
 		 734 aa  720    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  53.14 
 
 		 715 aa  742    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  53.28 
 
 		 715 aa  742    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  57.7 
 
 		 691 aa  820    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  52.73 
 
 		 715 aa  734    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  49.66 
 
 		 667 aa  668    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  48.48 
 
 		 674 aa  676    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  48.16 
 
 		 689 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  37.09 
 
 		 641 aa  354  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  35.53 
 
 		 668 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  36.98 
 
 		 669 aa  330  6e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  33.62 
 
 		 661 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  33.18 
 
 		 754 aa  320  6e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  33.33 
 
 		 667 aa  320  6e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  34.03 
 
 		 662 aa  317  5e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  31.57 
 
 		 662 aa  308  3e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  31.28 
 
 		 653 aa  297  5e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  31.43 
 
 		 683 aa  294  4e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  31.68 
 
 		 656 aa  281  4e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  36.79 
 
 		 676 aa  278  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  39.36 
 
 		 767 aa  278  4e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  32.67 
 
 		 696 aa  274  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  38.44 
 
 		 767 aa  266  1e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  31.69 
 
 		 645 aa  266  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  34.06 
 
 		 674 aa  265  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  34.06 
 
 		 674 aa  265  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  29.76 
 
 		 681 aa  262  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  39.55 
 
 		 671 aa  262  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  33.27 
 
 		 660 aa  261  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  28.53 
 
 		 705 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  31.79 
 
 		 687 aa  251  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  31.16 
 
 		 645 aa  242  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  28.38 
 
 		 673 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  28.81 
 
 		 698 aa  225  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  29.09 
 
 		 662 aa  224  6e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  30.27 
 
 		 662 aa  224  7e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  29.3 
 
 		 680 aa  223  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  31.63 
 
 		 635 aa  222  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  36.57 
 
 		 943 aa  222  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  29.68 
 
 		 688 aa  220  8.999999999999998e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  29.51 
 
 		 688 aa  217  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  30.73 
 
 		 673 aa  216  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  33.63 
 
 		 672 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  29.77 
 
 		 689 aa  213  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  28.74 
 
 		 684 aa  208  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  32.56 
 
 		 685 aa  206  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  32.56 
 
 		 685 aa  205  2e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  30.03 
 
 		 676 aa  204  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  34.63 
 
 		 668 aa  193  8e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  32.86 
 
 		 685 aa  191  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  29.37 
 
 		 649 aa  189  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  32.01 
 
 		 726 aa  185  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  31.63 
 
 		 706 aa  179  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  27.25 
 
 		 634 aa  162  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  29.53 
 
 		 633 aa  157  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  25.98 
 
 		 644 aa  150  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  30.06 
 
 		 632 aa  146  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  30.85 
 
 		 644 aa  145  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  29.45 
 
 		 632 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  25.82 
 
 		 639 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  25.7 
 
 		 634 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  22.99 
 
 		 637 aa  129  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  26.68 
 
 		 744 aa  127  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  25.59 
 
 		 631 aa  126  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  26.67 
 
 		 692 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  30 
 
 		 800 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  37.43 
 
 		 790 aa  114  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  31.58 
 
 		 760 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  29.03 
 
 		 815 aa  112  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4603  transglutaminase domain-containing protein  25.22 
 
 		 764 aa  107  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  28.78 
 
 		 788 aa  102  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  36.43 
 
 		 862 aa  101  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  28.67 
 
 		 826 aa  100  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  39.29 
 
 		 681 aa  97.1  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  25.14 
 
 		 728 aa  94.7  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  28.95 
 
 		 737 aa  95.1  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1077  transglutaminase domain protein  24.75 
 
 		 770 aa  94  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  39.53 
 
 		 815 aa  94  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  36.92 
 
 		 782 aa  93.2  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  26.91 
 
 		 720 aa  90.9  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  26.33 
 
 		 742 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  28.14 
 
 		 810 aa  89.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  28.35 
 
 		 706 aa  89.7  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  25.96 
 
 		 742 aa  89  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  24.44 
 
 		 742 aa  88.6  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  37.5 
 
 		 890 aa  87  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  24.21 
 
 		 635 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  27.37 
 
 		 812 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  34.59 
 
 		 850 aa  86.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  25.59 
 
 		 742 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  32.12 
 
 		 742 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>