More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0315 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  79.7 
 
 
826 aa  1278    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
815 aa  1626    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  42.11 
 
 
790 aa  548  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  36.06 
 
 
800 aa  412  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  35.1 
 
 
862 aa  196  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  29.75 
 
 
742 aa  153  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  29.2 
 
 
635 aa  153  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  30.11 
 
 
742 aa  152  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  29.95 
 
 
742 aa  152  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  29.2 
 
 
742 aa  151  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  31.61 
 
 
742 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0156  transglutaminase-like  27.33 
 
 
799 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.0989488 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  30.03 
 
 
742 aa  149  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  30.03 
 
 
742 aa  149  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  29.75 
 
 
742 aa  147  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  29.75 
 
 
742 aa  147  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1473  transglutaminase-like  27.44 
 
 
753 aa  143  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.647705  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  30.12 
 
 
728 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  32.5 
 
 
730 aa  134  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1077  transglutaminase domain protein  30.5 
 
 
770 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785713 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  41.85 
 
 
806 aa  132  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  33.44 
 
 
774 aa  130  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  32.03 
 
 
890 aa  126  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  48.63 
 
 
720 aa  125  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  32.72 
 
 
749 aa  122  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2905  transglutaminase domain protein  25.96 
 
 
769 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  31.49 
 
 
736 aa  121  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  42.75 
 
 
760 aa  121  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3747  transglutaminase domain protein  25.4 
 
 
768 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664376  normal  0.434261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3693  transglutaminase domain protein  25.4 
 
 
768 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  41.08 
 
 
677 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  30.03 
 
 
744 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  30.72 
 
 
840 aa  117  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  35.38 
 
 
730 aa  114  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2535  transglutaminase domain protein  31.13 
 
 
748 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  29.03 
 
 
730 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  28.19 
 
 
737 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  30.28 
 
 
689 aa  110  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  33.77 
 
 
800 aa  109  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  45.38 
 
 
850 aa  108  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  38.78 
 
 
762 aa  105  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  27.78 
 
 
732 aa  104  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  37.28 
 
 
681 aa  104  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  39.06 
 
 
943 aa  104  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  30 
 
 
886 aa  103  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  32.32 
 
 
725 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  34.21 
 
 
810 aa  102  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  32.93 
 
 
825 aa  102  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0440  transglutaminase domain protein  28.28 
 
 
748 aa  100  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  30.42 
 
 
633 aa  99.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  30.6 
 
 
763 aa  100  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  28.69 
 
 
668 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  29.72 
 
 
641 aa  99  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  27.92 
 
 
661 aa  99  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  37.5 
 
 
634 aa  99  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  24.78 
 
 
674 aa  98.2  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  31.06 
 
 
662 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  22.34 
 
 
689 aa  98.2  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  44.19 
 
 
676 aa  97.8  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  34.78 
 
 
795 aa  97.8  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  42.11 
 
 
671 aa  97.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  27.81 
 
 
667 aa  96.3  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  26.79 
 
 
734 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  32 
 
 
812 aa  95.5  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  27.76 
 
 
715 aa  95.9  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  27.76 
 
 
715 aa  95.9  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  41.48 
 
 
782 aa  95.9  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  26.49 
 
 
734 aa  95.1  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  28.57 
 
 
669 aa  94  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  25.05 
 
 
680 aa  94  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  28.48 
 
 
715 aa  94  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  32.95 
 
 
691 aa  92.8  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  29.82 
 
 
790 aa  92.8  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  25.89 
 
 
707 aa  92.4  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  30.71 
 
 
706 aa  92.4  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  28.36 
 
 
673 aa  92  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  35.8 
 
 
798 aa  92  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  35.68 
 
 
771 aa  91.7  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  39.57 
 
 
649 aa  90.5  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  28.32 
 
 
683 aa  90.1  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  26.54 
 
 
653 aa  90.5  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  34.56 
 
 
767 aa  90.1  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  30.55 
 
 
645 aa  89.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  28.17 
 
 
635 aa  89.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  39.26 
 
 
644 aa  89  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  25.93 
 
 
662 aa  89  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  35.54 
 
 
790 aa  89  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  36.3 
 
 
739 aa  88.6  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  34.66 
 
 
763 aa  88.2  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  36.3 
 
 
739 aa  88.6  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  25.82 
 
 
667 aa  88.2  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  34.43 
 
 
668 aa  87.8  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  27.79 
 
 
689 aa  87.4  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  28.89 
 
 
767 aa  87  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  29.06 
 
 
656 aa  87.4  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  40.44 
 
 
684 aa  86.3  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  31.63 
 
 
815 aa  86.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  36.46 
 
 
672 aa  85.9  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  35.88 
 
 
709 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  42.25 
 
 
673 aa  85.5  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>