204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3148 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
737 aa  1418    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  42.57 
 
 
862 aa  145  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  31.08 
 
 
790 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  38.07 
 
 
730 aa  128  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  35.97 
 
 
639 aa  126  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  31.1 
 
 
691 aa  125  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  26.54 
 
 
800 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  28.43 
 
 
742 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  28.09 
 
 
742 aa  120  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  29.56 
 
 
681 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  33.59 
 
 
633 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  41.67 
 
 
760 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  43.8 
 
 
890 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  24.37 
 
 
635 aa  115  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  31.93 
 
 
763 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  24.15 
 
 
742 aa  114  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  26.86 
 
 
742 aa  114  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  26.86 
 
 
742 aa  114  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  26.86 
 
 
742 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  26.86 
 
 
742 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 
736 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  28.42 
 
 
728 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  29.24 
 
 
689 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  25.89 
 
 
742 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  32.65 
 
 
662 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  31.84 
 
 
674 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  33.68 
 
 
676 aa  112  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  28.19 
 
 
815 aa  112  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  25.99 
 
 
742 aa  111  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  30 
 
 
635 aa  111  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  32.93 
 
 
645 aa  111  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  42.86 
 
 
744 aa  110  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  32.35 
 
 
668 aa  110  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  37.27 
 
 
681 aa  110  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  45.93 
 
 
800 aa  109  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  31.83 
 
 
788 aa  108  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  40.91 
 
 
795 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  34.13 
 
 
684 aa  108  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  31.23 
 
 
680 aa  108  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  33.81 
 
 
705 aa  108  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1208  transglutaminase domain-containing protein  33.11 
 
 
831 aa  107  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  30.62 
 
 
720 aa  107  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  31.17 
 
 
846 aa  107  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  32.53 
 
 
644 aa  107  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  31.39 
 
 
674 aa  107  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  32.68 
 
 
644 aa  107  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  31.39 
 
 
674 aa  107  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  30.59 
 
 
667 aa  107  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  46.62 
 
 
826 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  30.86 
 
 
840 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  32.21 
 
 
662 aa  105  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  38.92 
 
 
730 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  32.11 
 
 
806 aa  105  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  32.21 
 
 
680 aa  104  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  31.87 
 
 
689 aa  104  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  32.21 
 
 
671 aa  104  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  34.07 
 
 
668 aa  103  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  33.81 
 
 
631 aa  102  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  33.6 
 
 
632 aa  103  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  30.96 
 
 
812 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  25.68 
 
 
754 aa  102  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  29.12 
 
 
767 aa  102  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  30.17 
 
 
688 aa  101  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  29.43 
 
 
767 aa  101  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  31.7 
 
 
661 aa  101  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  32.38 
 
 
632 aa  101  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  29.55 
 
 
707 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  30.51 
 
 
688 aa  100  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1077  transglutaminase domain protein  26.41 
 
 
770 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785713 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  31.32 
 
 
673 aa  100  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  29 
 
 
685 aa  100  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  41.89 
 
 
798 aa  100  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  28.73 
 
 
645 aa  99.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  29 
 
 
685 aa  99.8  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  30.94 
 
 
774 aa  98.2  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  29.55 
 
 
689 aa  98.2  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  29.17 
 
 
653 aa  97.8  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  42.42 
 
 
782 aa  97.8  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  27.57 
 
 
660 aa  97.8  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  29.07 
 
 
641 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  38.97 
 
 
810 aa  96.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  32.09 
 
 
685 aa  97.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  29.77 
 
 
634 aa  95.9  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  37.79 
 
 
790 aa  96.3  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  33.21 
 
 
672 aa  95.9  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  44.36 
 
 
763 aa  95.5  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  40.38 
 
 
790 aa  95.5  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  28.95 
 
 
730 aa  95.1  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  32.46 
 
 
943 aa  95.1  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  34.39 
 
 
709 aa  95.1  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  30.36 
 
 
732 aa  94.7  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  32.37 
 
 
850 aa  94.7  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3833  transglutaminase domain protein  36.7 
 
 
790 aa  94.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0481829  normal  0.0321175 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  42.73 
 
 
739 aa  94.4  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  42.73 
 
 
739 aa  94.4  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  28.28 
 
 
687 aa  94  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  38.69 
 
 
734 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  39.13 
 
 
815 aa  94  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3747  transglutaminase domain protein  26.28 
 
 
768 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664376  normal  0.434261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  38.69 
 
 
734 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>