More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2448 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  62.01 
 
 		 641 aa  745    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  62.48 
 
 		 669 aa  759    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 661 aa  1299    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  68.67 
 
 		 662 aa  739    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  67.02 
 
 		 668 aa  794    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  43.38 
 
 		 662 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  41.44 
 
 		 653 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  38.33 
 
 		 683 aa  432  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  33.18 
 
 		 689 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  40 
 
 		 656 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  34.86 
 
 		 680 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  35.09 
 
 		 732 aa  381  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  34.36 
 
 		 667 aa  378  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  34.97 
 
 		 715 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  35.12 
 
 		 715 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  35.16 
 
 		 715 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  34.16 
 
 		 674 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  36.6 
 
 		 645 aa  372  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  32.1 
 
 		 691 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  38.3 
 
 		 696 aa  371  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  34.44 
 
 		 709 aa  366  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  38.62 
 
 		 705 aa  363  6e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  35.71 
 
 		 689 aa  362  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  40.13 
 
 		 671 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  32.5 
 
 		 734 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  33.19 
 
 		 707 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  32.36 
 
 		 734 aa  352  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  32.05 
 
 		 739 aa  345  2e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  32.05 
 
 		 739 aa  345  2e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  38.37 
 
 		 645 aa  342  1e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  37.85 
 
 		 681 aa  331  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  34.54 
 
 		 730 aa  331  3e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  36.15 
 
 		 673 aa  325  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  35.51 
 
 		 767 aa  325  2e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  36.59 
 
 		 680 aa  320  6e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  36.45 
 
 		 673 aa  319  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  38.98 
 
 		 676 aa  316  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  31.53 
 
 		 660 aa  315  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  36.22 
 
 		 689 aa  314  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  34.39 
 
 		 767 aa  313  7.999999999999999e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  40.1 
 
 		 674 aa  313  9e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  40.1 
 
 		 674 aa  313  9e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  32.37 
 
 		 754 aa  312  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  38.32 
 
 		 684 aa  310  6.999999999999999e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  35.19 
 
 		 676 aa  309  9e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  36.64 
 
 		 698 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  38.23 
 
 		 685 aa  303  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  35.28 
 
 		 688 aa  292  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  35.42 
 
 		 688 aa  291  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  35.47 
 
 		 667 aa  288  2.9999999999999996e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  39.34 
 
 		 943 aa  280  6e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  37.57 
 
 		 726 aa  271  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  39.35 
 
 		 672 aa  271  4e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  28.34 
 
 		 662 aa  259  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  31.46 
 
 		 687 aa  258  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  33.22 
 
 		 635 aa  247  4.9999999999999997e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  28.53 
 
 		 662 aa  245  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  34.54 
 
 		 649 aa  243  6e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  31.31 
 
 		 685 aa  242  2e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  31.16 
 
 		 685 aa  240  6.999999999999999e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  34.66 
 
 		 668 aa  239  9e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  36.28 
 
 		 706 aa  232  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  29.33 
 
 		 692 aa  219  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  28.67 
 
 		 634 aa  181  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  30.25 
 
 		 633 aa  177  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  29.65 
 
 		 644 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  27.99 
 
 		 632 aa  146  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  23.53 
 
 		 631 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  32.32 
 
 		 632 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  30.54 
 
 		 639 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  27.17 
 
 		 634 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  28.98 
 
 		 644 aa  126  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  25.56 
 
 		 730 aa  124  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  26.16 
 
 		 744 aa  117  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  23.89 
 
 		 637 aa  116  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  30.43 
 
 		 790 aa  107  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  28.54 
 
 		 815 aa  105  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  31.7 
 
 		 737 aa  100  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  22.24 
 
 		 742 aa  100  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  39.13 
 
 		 760 aa  99.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  31.14 
 
 		 826 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  21.2 
 
 		 742 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  23.65 
 
 		 742 aa  95.9  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  23.65 
 
 		 742 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  23.65 
 
 		 742 aa  95.1  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  23.65 
 
 		 742 aa  95.1  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  33.12 
 
 		 728 aa  94.4  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  23.31 
 
 		 635 aa  94.4  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  35.98 
 
 		 720 aa  94  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  25.5 
 
 		 742 aa  94  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  32.72 
 
 		 862 aa  92.8  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  32.89 
 
 		 742 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  35.04 
 
 		 825 aa  90.9  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  24.15 
 
 		 742 aa  90.5  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  36.36 
 
 		 681 aa  90.1  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  23.72 
 
 		 730 aa  90.1  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  34.62 
 
 		 850 aa  88.6  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4603  transglutaminase domain-containing protein  25.67 
 
 		 764 aa  86.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  27.18 
 
 		 840 aa  86.7  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  28.09 
 
 		 800 aa  86.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>