158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2052 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  100 
 
 		 634 aa  1279    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  39.56 
 
 		 644 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  42.06 
 
 		 644 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  40.97 
 
 		 632 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  39.91 
 
 		 632 aa  398  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  36.51 
 
 		 633 aa  363  7.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  37.99 
 
 		 639 aa  324  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  32.36 
 
 		 634 aa  268  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  27.84 
 
 		 631 aa  252  1e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  28.67 
 
 		 645 aa  153  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  24.68 
 
 		 637 aa  150  7e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  26.6 
 
 		 662 aa  147  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  29.52 
 
 		 676 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  29.04 
 
 		 667 aa  139  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  29.13 
 
 		 767 aa  139  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  28.57 
 
 		 767 aa  138  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  25.57 
 
 		 645 aa  134  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  23.66 
 
 		 691 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  28.15 
 
 		 671 aa  133  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  27.22 
 
 		 673 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  26.4 
 
 		 730 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  23.96 
 
 		 730 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  27.37 
 
 		 656 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  26.01 
 
 		 683 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  29.49 
 
 		 653 aa  127  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  28.16 
 
 		 681 aa  127  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  26.88 
 
 		 705 aa  125  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  27.55 
 
 		 680 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  31.3 
 
 		 943 aa  124  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  27.86 
 
 		 661 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  29.48 
 
 		 689 aa  120  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  25.19 
 
 		 696 aa  120  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  25.61 
 
 		 689 aa  120  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  27.73 
 
 		 684 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  26.07 
 
 		 674 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  25.87 
 
 		 662 aa  118  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  27.88 
 
 		 672 aa  118  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  27.5 
 
 		 667 aa  117  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  26.92 
 
 		 685 aa  117  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  25.46 
 
 		 754 aa  116  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  26.92 
 
 		 685 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  27.56 
 
 		 641 aa  115  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  27.87 
 
 		 674 aa  115  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  28.1 
 
 		 668 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  27.09 
 
 		 673 aa  115  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  27.87 
 
 		 674 aa  115  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  25.51 
 
 		 680 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  25.61 
 
 		 662 aa  114  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  28.06 
 
 		 689 aa  113  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  24.47 
 
 		 732 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  25.22 
 
 		 744 aa  111  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  28.25 
 
 		 662 aa  111  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  29.02 
 
 		 676 aa  110  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  26.69 
 
 		 688 aa  109  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  30.13 
 
 		 669 aa  109  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  26.16 
 
 		 635 aa  108  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  25.51 
 
 		 685 aa  106  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  29.19 
 
 		 649 aa  106  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  26.28 
 
 		 688 aa  104  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  28.72 
 
 		 726 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  24.89 
 
 		 715 aa  102  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  22.95 
 
 		 715 aa  101  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  25.73 
 
 		 698 aa  101  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  22.5 
 
 		 715 aa  99.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  24.85 
 
 		 660 aa  98.2  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  26.11 
 
 		 707 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  27.55 
 
 		 709 aa  94  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  26.64 
 
 		 681 aa  92  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  33.12 
 
 		 720 aa  91.3  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  25.72 
 
 		 742 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  33.33 
 
 		 742 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  33.09 
 
 		 742 aa  88.2  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  30.05 
 
 		 742 aa  87.4  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  30.05 
 
 		 742 aa  87.4  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  36.69 
 
 		 790 aa  87.4  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  23.99 
 
 		 739 aa  87.4  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  23.99 
 
 		 739 aa  87.4  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  30.05 
 
 		 742 aa  87  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4603  transglutaminase domain-containing protein  22.56 
 
 		 764 aa  87  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  24.38 
 
 		 687 aa  86.3  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  29.56 
 
 		 742 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  32.39 
 
 		 728 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  33.33 
 
 		 635 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  32.64 
 
 		 742 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  30.77 
 
 		 734 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  30.77 
 
 		 734 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  33.6 
 
 		 742 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  35.34 
 
 		 763 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  27.5 
 
 		 668 aa  82  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  27.33 
 
 		 706 aa  82  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0440  transglutaminase domain protein  24.05 
 
 		 748 aa  80.9  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3804  transglutaminase domain-containing protein  34.48 
 
 		 820 aa  80.5  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  29.32 
 
 		 862 aa  80.5  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0581  transglutaminase-like domain-containing protein  30.94 
 
 		 1238 aa  79  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  36.03 
 
 		 800 aa  77.4  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  38.41 
 
 		 815 aa  77.4  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  28.08 
 
 		 737 aa  77  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  33.09 
 
 		 806 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1293  transglutaminase domain protein  31.78 
 
 		 803 aa  75.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269788  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  21.22 
 
 		 730 aa  73.9  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>