More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2519 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  100 
 
 
645 aa  1300    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  44.85 
 
 
653 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  44.03 
 
 
656 aa  466  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  42 
 
 
662 aa  457  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  34.99 
 
 
683 aa  405  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  38.1 
 
 
680 aa  402  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  39.97 
 
 
705 aa  398  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  39.43 
 
 
645 aa  393  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  42.55 
 
 
672 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  38.62 
 
 
673 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  40.28 
 
 
681 aa  379  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  42.39 
 
 
688 aa  379  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  42.39 
 
 
688 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  38.09 
 
 
689 aa  375  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  40.03 
 
 
673 aa  372  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  39.04 
 
 
676 aa  368  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  38.48 
 
 
674 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  38.48 
 
 
674 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  37.15 
 
 
698 aa  351  3e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  38 
 
 
684 aa  350  6e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  41.43 
 
 
685 aa  349  9e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  37.06 
 
 
635 aa  338  2.9999999999999997e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  36.29 
 
 
661 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  40.23 
 
 
943 aa  333  7.000000000000001e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  37.25 
 
 
641 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  36.3 
 
 
685 aa  323  8e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  36.3 
 
 
685 aa  322  9.999999999999999e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  35.96 
 
 
671 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  36.1 
 
 
669 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  31.59 
 
 
691 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  34.16 
 
 
668 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  37.57 
 
 
649 aa  314  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  38.29 
 
 
726 aa  313  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  39.72 
 
 
676 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  38.19 
 
 
662 aa  306  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  33.33 
 
 
767 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  28.85 
 
 
689 aa  302  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  31.51 
 
 
689 aa  302  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  35.01 
 
 
767 aa  295  1e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  30.72 
 
 
732 aa  292  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  29.81 
 
 
667 aa  291  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  31.23 
 
 
680 aa  290  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  35.05 
 
 
667 aa  290  8e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  30.87 
 
 
707 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  36.69 
 
 
668 aa  288  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  31.85 
 
 
715 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  29.26 
 
 
674 aa  287  5e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  30.88 
 
 
709 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  31.38 
 
 
715 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  30.79 
 
 
715 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  37.07 
 
 
706 aa  280  8e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  30.14 
 
 
734 aa  279  9e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  30 
 
 
734 aa  277  5e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  32.59 
 
 
696 aa  276  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  30.64 
 
 
754 aa  271  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  32.65 
 
 
730 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  27.82 
 
 
662 aa  237  6e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  29.03 
 
 
692 aa  237  6e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  27.8 
 
 
662 aa  226  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  28.6 
 
 
660 aa  216  7e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  33.42 
 
 
739 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  33.42 
 
 
739 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  28.67 
 
 
687 aa  192  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  31.71 
 
 
633 aa  177  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  27.66 
 
 
634 aa  173  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  30.73 
 
 
639 aa  167  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  27.21 
 
 
644 aa  160  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  29.51 
 
 
632 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  29.74 
 
 
644 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  29.72 
 
 
632 aa  152  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  22.55 
 
 
631 aa  139  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  24.21 
 
 
744 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  25.22 
 
 
634 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  23.13 
 
 
730 aa  125  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  22.53 
 
 
637 aa  124  5e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  25.71 
 
 
862 aa  101  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1077  transglutaminase domain protein  28.26 
 
 
770 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2905  transglutaminase domain protein  25.91 
 
 
769 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1473  transglutaminase-like  28.89 
 
 
753 aa  101  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.647705  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  38.41 
 
 
790 aa  101  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  32.42 
 
 
760 aa  100  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  28.54 
 
 
737 aa  100  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3747  transglutaminase domain protein  27.15 
 
 
768 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664376  normal  0.434261 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  31.09 
 
 
706 aa  97.1  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  48.94 
 
 
673 aa  95.1  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  29.37 
 
 
850 aa  95.1  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  25.88 
 
 
890 aa  94.7  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3693  transglutaminase domain protein  26.63 
 
 
768 aa  94.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  41.01 
 
 
812 aa  92  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  30.55 
 
 
815 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  38.57 
 
 
788 aa  89.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  33.78 
 
 
800 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  32.02 
 
 
806 aa  88.2  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  38.36 
 
 
782 aa  87.4  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  35.16 
 
 
681 aa  87.4  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  34.27 
 
 
800 aa  87  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  34.46 
 
 
720 aa  87  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  25.59 
 
 
728 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  29.35 
 
 
825 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  34.75 
 
 
763 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>