More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2384 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  58.7 
 
 
688 aa  709    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  53.82 
 
 
673 aa  680    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  55.83 
 
 
676 aa  663    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  56.83 
 
 
673 aa  694    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  58.56 
 
 
688 aa  708    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
726 aa  1428    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  59.06 
 
 
685 aa  660    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  58.04 
 
 
684 aa  701    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  56.71 
 
 
689 aa  695    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  47.42 
 
 
698 aa  537  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  49.24 
 
 
706 aa  486  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  38.29 
 
 
645 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  37.79 
 
 
653 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  38.32 
 
 
656 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  36.06 
 
 
662 aa  319  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  36.75 
 
 
645 aa  307  6e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  35.41 
 
 
680 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  36.78 
 
 
661 aa  296  7e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  36.52 
 
 
635 aa  281  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  35.69 
 
 
641 aa  280  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  36.16 
 
 
668 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  30.7 
 
 
683 aa  271  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  35.02 
 
 
705 aa  268  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  34.92 
 
 
669 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  40.39 
 
 
672 aa  261  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  34.59 
 
 
685 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  34.59 
 
 
685 aa  254  3e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  34.72 
 
 
671 aa  251  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  39.11 
 
 
943 aa  251  4e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  35.82 
 
 
681 aa  250  6e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  37.21 
 
 
676 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  37.14 
 
 
649 aa  246  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  35.36 
 
 
662 aa  245  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  33.84 
 
 
667 aa  243  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  33.06 
 
 
767 aa  242  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  28.96 
 
 
662 aa  240  5.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  32.59 
 
 
680 aa  237  6e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  28.16 
 
 
662 aa  236  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  34.08 
 
 
696 aa  236  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  32.05 
 
 
767 aa  235  3e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  31.2 
 
 
667 aa  231  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  31.2 
 
 
732 aa  230  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  30.37 
 
 
715 aa  230  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  30.11 
 
 
689 aa  229  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  30.67 
 
 
715 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  30.63 
 
 
715 aa  229  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  31.04 
 
 
689 aa  228  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  34.67 
 
 
674 aa  227  6e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  34.67 
 
 
674 aa  227  6e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  28.69 
 
 
754 aa  223  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  29.62 
 
 
707 aa  218  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  28.78 
 
 
691 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  30.67 
 
 
674 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  33.16 
 
 
668 aa  213  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  28.47 
 
 
734 aa  210  8e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  28.82 
 
 
734 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  27.71 
 
 
739 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  27.71 
 
 
739 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  29.65 
 
 
730 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  30.08 
 
 
709 aa  197  6e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  27.81 
 
 
692 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  28.21 
 
 
660 aa  166  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  26.75 
 
 
687 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  27.93 
 
 
744 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  27.09 
 
 
634 aa  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  31.28 
 
 
633 aa  151  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  29.18 
 
 
644 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  26.6 
 
 
644 aa  132  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  21.13 
 
 
631 aa  128  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  28.57 
 
 
639 aa  126  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  24.77 
 
 
730 aa  124  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  27.24 
 
 
632 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  27.22 
 
 
632 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  27.48 
 
 
634 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  35.62 
 
 
681 aa  106  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  24.43 
 
 
637 aa  97.4  7e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  29.19 
 
 
788 aa  95.5  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  40.88 
 
 
782 aa  94  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  30.8 
 
 
737 aa  91.7  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  32.35 
 
 
728 aa  91.3  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  35.9 
 
 
720 aa  91.3  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  31.58 
 
 
760 aa  90.9  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  29.17 
 
 
886 aa  90.5  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  37.32 
 
 
825 aa  89.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  32.37 
 
 
812 aa  88.2  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  33.12 
 
 
850 aa  87  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  38.36 
 
 
763 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  34.13 
 
 
790 aa  85.9  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  34.19 
 
 
810 aa  85.1  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3214  transglutaminase domain protein  41.41 
 
 
788 aa  85.1  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.257235  normal  0.234323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  27.88 
 
 
800 aa  84.7  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  38.16 
 
 
790 aa  84.3  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  45.74 
 
 
673 aa  82  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  26.92 
 
 
706 aa  80.9  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1293  transglutaminase domain protein  38.82 
 
 
803 aa  80.9  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269788  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  30.08 
 
 
840 aa  80.5  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  44.09 
 
 
743 aa  80.5  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  39.6 
 
 
792 aa  80.1  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  22.13 
 
 
795 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  40.78 
 
 
890 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>