More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2281 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  61.83 
 
 
641 aa  724    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  61.62 
 
 
669 aa  717    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  100 
 
 
662 aa  1288    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  68.4 
 
 
661 aa  805    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  88.97 
 
 
668 aa  1080    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  37.83 
 
 
683 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  41.3 
 
 
662 aa  412  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  36.29 
 
 
680 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  39.62 
 
 
653 aa  405  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  34.93 
 
 
732 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  35.16 
 
 
674 aa  399  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  32.88 
 
 
689 aa  396  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  35.16 
 
 
667 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  41.08 
 
 
705 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  33.59 
 
 
691 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  35.12 
 
 
707 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  35.17 
 
 
715 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  34.35 
 
 
734 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  34.49 
 
 
734 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  34.59 
 
 
715 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  34.3 
 
 
715 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  34.01 
 
 
709 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  36.54 
 
 
689 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  37.73 
 
 
645 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  39.25 
 
 
656 aa  372  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  36.77 
 
 
730 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  37.44 
 
 
696 aa  360  3e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  37.8 
 
 
767 aa  354  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  37.28 
 
 
767 aa  347  5e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  40 
 
 
645 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  31.96 
 
 
739 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  31.96 
 
 
739 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  38.83 
 
 
671 aa  329  8e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  36.39 
 
 
680 aa  317  4e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  37.52 
 
 
673 aa  314  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  40.77 
 
 
676 aa  314  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  36.7 
 
 
667 aa  307  4.0000000000000004e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  32.82 
 
 
660 aa  306  8.000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  31.43 
 
 
754 aa  300  5e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  36.88 
 
 
681 aa  295  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  39.1 
 
 
674 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  39.1 
 
 
674 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  36.44 
 
 
698 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  35.7 
 
 
684 aa  283  7.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  33.28 
 
 
689 aa  281  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  34.68 
 
 
688 aa  277  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  33.13 
 
 
673 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  34.39 
 
 
688 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  35.39 
 
 
676 aa  269  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  32.75 
 
 
687 aa  260  7e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  35.08 
 
 
726 aa  259  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  37.13 
 
 
943 aa  257  4e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  36.44 
 
 
685 aa  254  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  29.66 
 
 
662 aa  251  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  33.56 
 
 
635 aa  247  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  29.66 
 
 
662 aa  244  3e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  35.77 
 
 
672 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  33.39 
 
 
668 aa  230  7e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  36.44 
 
 
649 aa  224  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  35.36 
 
 
706 aa  218  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  32.29 
 
 
685 aa  217  5.9999999999999996e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  32.29 
 
 
685 aa  216  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  28.64 
 
 
692 aa  200  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  28.9 
 
 
634 aa  179  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  29.68 
 
 
633 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  32.55 
 
 
639 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  29.04 
 
 
644 aa  152  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  30.35 
 
 
644 aa  142  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  28.93 
 
 
632 aa  138  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  30.13 
 
 
632 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  23.68 
 
 
637 aa  133  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  26.76 
 
 
744 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  29.12 
 
 
634 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  24.1 
 
 
631 aa  124  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  32.65 
 
 
737 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  31.32 
 
 
790 aa  112  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  23.53 
 
 
730 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  28.63 
 
 
815 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  25.55 
 
 
760 aa  101  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  25.14 
 
 
742 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  30.14 
 
 
706 aa  95.1  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  24.44 
 
 
742 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  24.44 
 
 
742 aa  94.7  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  31.54 
 
 
749 aa  94.4  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  31.55 
 
 
806 aa  93.2  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  24.29 
 
 
742 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  24.29 
 
 
742 aa  92.4  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  22.08 
 
 
635 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  24.36 
 
 
742 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  24.72 
 
 
742 aa  91.3  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  24.01 
 
 
742 aa  90.9  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  41.89 
 
 
673 aa  89.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  32.62 
 
 
862 aa  89.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  23.82 
 
 
742 aa  89  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  41.04 
 
 
800 aa  88.6  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  28.49 
 
 
826 aa  87.8  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  33.78 
 
 
681 aa  87.8  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  34.51 
 
 
728 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4603  transglutaminase domain-containing protein  25.25 
 
 
764 aa  84.7  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  38.19 
 
 
782 aa  84.7  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>