More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02438 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  66.56 
 
 
649 aa  738    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  60.53 
 
 
685 aa  732    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  100 
 
 
635 aa  1255    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  60.53 
 
 
685 aa  732    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  38.32 
 
 
662 aa  362  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  35.86 
 
 
645 aa  347  4e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  36.1 
 
 
680 aa  324  3e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  37.65 
 
 
767 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  34.81 
 
 
656 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  38.1 
 
 
653 aa  302  1e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  36.77 
 
 
767 aa  296  5e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  37.23 
 
 
705 aa  295  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  37.17 
 
 
689 aa  292  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  36.27 
 
 
673 aa  289  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  37.59 
 
 
674 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  37.59 
 
 
674 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  36.72 
 
 
681 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  35.31 
 
 
676 aa  283  8.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  36.25 
 
 
645 aa  278  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  38.23 
 
 
673 aa  277  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  31.46 
 
 
683 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  34.95 
 
 
667 aa  268  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  38.04 
 
 
684 aa  268  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  39.11 
 
 
676 aa  267  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  34.56 
 
 
671 aa  267  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  34.92 
 
 
688 aa  259  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  37.35 
 
 
688 aa  258  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  35.66 
 
 
668 aa  254  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  38.89 
 
 
672 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  29.02 
 
 
689 aa  251  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  36.67 
 
 
943 aa  249  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  32.81 
 
 
689 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  31.68 
 
 
668 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  36.16 
 
 
726 aa  244  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  32.77 
 
 
661 aa  239  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  29.59 
 
 
732 aa  239  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  32.6 
 
 
680 aa  238  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  29.61 
 
 
691 aa  237  4e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  36.48 
 
 
685 aa  236  7e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  31.64 
 
 
641 aa  236  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  34.52 
 
 
698 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  32.44 
 
 
696 aa  228  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  29.32 
 
 
674 aa  227  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  27.9 
 
 
715 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  28.11 
 
 
715 aa  227  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  31.42 
 
 
662 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  30.14 
 
 
667 aa  225  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  31.16 
 
 
730 aa  225  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  27.74 
 
 
715 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  28.17 
 
 
662 aa  224  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  28.45 
 
 
707 aa  220  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  29.76 
 
 
669 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  29.7 
 
 
709 aa  216  7e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  28.15 
 
 
662 aa  216  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  35.73 
 
 
706 aa  214  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  27.18 
 
 
734 aa  207  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  27.18 
 
 
734 aa  207  7e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  27.15 
 
 
739 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  27.15 
 
 
739 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  28.64 
 
 
754 aa  198  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  29.41 
 
 
692 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  29.84 
 
 
660 aa  187  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  28.13 
 
 
633 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  29.27 
 
 
644 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  25.6 
 
 
687 aa  144  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  26.75 
 
 
634 aa  144  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  31.11 
 
 
644 aa  137  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  27.97 
 
 
744 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  24.42 
 
 
631 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  27.64 
 
 
632 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  28.05 
 
 
632 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  28.96 
 
 
639 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  28.12 
 
 
730 aa  114  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  21.83 
 
 
637 aa  111  5e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  26.26 
 
 
634 aa  110  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  29.79 
 
 
737 aa  111  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  29.74 
 
 
790 aa  103  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  49.06 
 
 
673 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  42.55 
 
 
782 aa  101  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  28.28 
 
 
840 aa  100  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  35.5 
 
 
812 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2905  transglutaminase domain protein  25.71 
 
 
769 aa  97.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  38.89 
 
 
862 aa  97.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  42.96 
 
 
763 aa  96.3  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3747  transglutaminase domain protein  22.46 
 
 
768 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664376  normal  0.434261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3693  transglutaminase domain protein  22.75 
 
 
768 aa  94.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  37.82 
 
 
790 aa  94  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  35.84 
 
 
800 aa  93.6  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  42.27 
 
 
681 aa  92.4  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  36.96 
 
 
788 aa  91.7  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1473  transglutaminase-like  22.73 
 
 
753 aa  91.3  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.647705  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  28.17 
 
 
815 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  31.05 
 
 
728 aa  89  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  29.15 
 
 
886 aa  88.6  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  34.55 
 
 
810 aa  87.8  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  36.76 
 
 
760 aa  87.8  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  32.86 
 
 
742 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  32.86 
 
 
742 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  32.86 
 
 
742 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  32.86 
 
 
742 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>