252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2074 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  100 
 
 
645 aa  1281    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  41.37 
 
 
662 aa  428  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  38.83 
 
 
645 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  40.16 
 
 
653 aa  405  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  38.01 
 
 
705 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  38.28 
 
 
656 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  40 
 
 
681 aa  343  7e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  33.48 
 
 
683 aa  339  8e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  41.34 
 
 
674 aa  323  5e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  41.34 
 
 
674 aa  323  5e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  37.91 
 
 
661 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  36 
 
 
680 aa  318  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  38.05 
 
 
668 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  35.39 
 
 
689 aa  307  4.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  38.23 
 
 
671 aa  307  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  36.45 
 
 
673 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  35.2 
 
 
641 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  36.25 
 
 
668 aa  299  1e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  33.59 
 
 
673 aa  293  9e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  37.55 
 
 
684 aa  291  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  41.7 
 
 
943 aa  288  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  33.75 
 
 
696 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  35.6 
 
 
676 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  31.12 
 
 
689 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  37.66 
 
 
662 aa  280  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  38.87 
 
 
672 aa  280  6e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  36 
 
 
635 aa  279  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  35.24 
 
 
669 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  34.59 
 
 
676 aa  276  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  35.81 
 
 
649 aa  276  7e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  33.23 
 
 
732 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  31.02 
 
 
691 aa  273  6e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  30.78 
 
 
680 aa  272  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  30.49 
 
 
674 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  35.09 
 
 
726 aa  270  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  32.54 
 
 
715 aa  266  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  30.7 
 
 
667 aa  265  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  34.46 
 
 
688 aa  265  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  32.86 
 
 
715 aa  264  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  32.65 
 
 
715 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  35.59 
 
 
688 aa  263  8e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  34.27 
 
 
685 aa  262  1e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  35.93 
 
 
685 aa  263  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  36.88 
 
 
767 aa  261  4e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  34.27 
 
 
685 aa  261  4e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  33.72 
 
 
767 aa  257  5e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  31.2 
 
 
689 aa  256  7e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  27.67 
 
 
662 aa  256  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  33.03 
 
 
698 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  30.87 
 
 
709 aa  253  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  33.85 
 
 
667 aa  245  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  29.78 
 
 
754 aa  242  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  31.03 
 
 
707 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  29.8 
 
 
662 aa  241  4e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  30.12 
 
 
734 aa  237  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  30.2 
 
 
734 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  32.96 
 
 
730 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  37.3 
 
 
706 aa  226  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  29.29 
 
 
692 aa  223  8e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  29.36 
 
 
739 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  29.36 
 
 
739 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  27.9 
 
 
634 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  28.34 
 
 
660 aa  207  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  32.08 
 
 
687 aa  196  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  34.09 
 
 
644 aa  182  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  30.37 
 
 
633 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  30.8 
 
 
639 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  23.79 
 
 
637 aa  153  7e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  29.29 
 
 
632 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  28.42 
 
 
632 aa  151  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  30.19 
 
 
644 aa  150  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  28.22 
 
 
634 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  22.11 
 
 
631 aa  145  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  24.89 
 
 
744 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  26.12 
 
 
730 aa  124  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  32.93 
 
 
737 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  31.02 
 
 
790 aa  94.7  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  38.61 
 
 
800 aa  93.2  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  25.07 
 
 
742 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  30 
 
 
728 aa  91.7  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  30.07 
 
 
720 aa  89.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  38.89 
 
 
782 aa  90.1  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  29.34 
 
 
812 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  24.78 
 
 
742 aa  89  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1293  transglutaminase domain protein  25.24 
 
 
803 aa  88.6  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269788  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  36.62 
 
 
760 aa  87.8  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2905  transglutaminase domain protein  27.62 
 
 
769 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  36.36 
 
 
681 aa  86.7  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  41.91 
 
 
792 aa  86.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  36.23 
 
 
806 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  33.64 
 
 
825 aa  85.1  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  31.75 
 
 
850 aa  85.5  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  24.76 
 
 
742 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  29.61 
 
 
815 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  32.98 
 
 
706 aa  83.6  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  29.21 
 
 
763 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  23.48 
 
 
742 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  40.34 
 
 
788 aa  82  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  47.37 
 
 
673 aa  82.4  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  24.82 
 
 
730 aa  82  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>