More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3379 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  62.35 
 
 		 688 aa  745    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  62.22 
 
 		 689 aa  783    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 673 aa  1336    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  63.52 
 
 		 673 aa  821    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  60.24 
 
 		 685 aa  676    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  63.73 
 
 		 676 aa  778    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  59.62 
 
 		 684 aa  720    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  56.69 
 
 		 726 aa  654    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  62.79 
 
 		 688 aa  751    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  52.01 
 
 		 698 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  49.37 
 
 		 706 aa  483  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  41.23 
 
 		 645 aa  379  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  39.27 
 
 		 653 aa  369  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  37.25 
 
 		 656 aa  334  4e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  34.15 
 
 		 662 aa  332  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  36.35 
 
 		 661 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  34.3 
 
 		 645 aa  296  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  36.92 
 
 		 680 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  33.44 
 
 		 641 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  36.04 
 
 		 668 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  40.74 
 
 		 672 aa  282  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  38.13 
 
 		 635 aa  283  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  35.41 
 
 		 705 aa  279  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  37.52 
 
 		 662 aa  276  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  37.83 
 
 		 676 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  33.78 
 
 		 669 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  31.75 
 
 		 683 aa  272  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  33.57 
 
 		 767 aa  271  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  34.62 
 
 		 681 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  32.94 
 
 		 689 aa  269  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  39.43 
 
 		 649 aa  268  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  34.2 
 
 		 671 aa  266  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  33.33 
 
 		 767 aa  265  3e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  32.57 
 
 		 707 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  32.43 
 
 		 680 aa  258  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  33.86 
 
 		 696 aa  255  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  30.9 
 
 		 734 aa  253  7e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  39.93 
 
 		 943 aa  252  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  29.64 
 
 		 667 aa  251  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  30.85 
 
 		 734 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  32.18 
 
 		 667 aa  249  1e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  35.65 
 
 		 674 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  31.09 
 
 		 732 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  35.11 
 
 		 685 aa  246  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  35.65 
 
 		 674 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  35.11 
 
 		 685 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  28.87 
 
 		 689 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  31.66 
 
 		 715 aa  244  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  30.03 
 
 		 754 aa  242  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  31.35 
 
 		 715 aa  239  8e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  28.89 
 
 		 674 aa  239  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  31.19 
 
 		 715 aa  238  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  36.15 
 
 		 668 aa  238  4e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  29.21 
 
 		 691 aa  236  7e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  30.15 
 
 		 739 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  30.15 
 
 		 739 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  27.96 
 
 		 662 aa  227  6e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  30.46 
 
 		 709 aa  226  9e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  28.23 
 
 		 662 aa  219  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  30.67 
 
 		 730 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  31 
 
 		 660 aa  193  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  28.55 
 
 		 692 aa  184  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  30.56 
 
 		 633 aa  157  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  29.65 
 
 		 687 aa  154  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  23.55 
 
 		 631 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  25.35 
 
 		 744 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  26.21 
 
 		 634 aa  141  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  28.05 
 
 		 644 aa  139  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  27.94 
 
 		 644 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  28.63 
 
 		 632 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  28.99 
 
 		 632 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  25.85 
 
 		 730 aa  132  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  29.87 
 
 		 639 aa  122  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  27.29 
 
 		 634 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  22.86 
 
 		 637 aa  109  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4603  transglutaminase domain-containing protein  26.67 
 
 		 764 aa  107  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  38.46 
 
 		 782 aa  95.5  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  34.84 
 
 		 706 aa  94.7  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  28.61 
 
 		 763 aa  93.6  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  32.24 
 
 		 681 aa  90.9  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  39.1 
 
 		 788 aa  89.7  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  51.58 
 
 		 673 aa  89.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  35.29 
 
 		 862 aa  89  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  36.03 
 
 		 790 aa  86.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  34.18 
 
 		 720 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  29.2 
 
 		 737 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  37.11 
 
 		 790 aa  85.9  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  33.14 
 
 		 890 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  35.92 
 
 		 760 aa  84.7  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  37.96 
 
 		 815 aa  84.7  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  30.99 
 
 		 728 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  28.52 
 
 		 749 aa  82  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  35.53 
 
 		 812 aa  81.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  36.55 
 
 		 800 aa  81.3  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  38.93 
 
 		 743 aa  80.5  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  42.2 
 
 		 763 aa  79.7  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  26.14 
 
 		 742 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  46.25 
 
 		 826 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3707  transglutaminase domain-containing protein  28 
 
 		 876 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  36.63 
 
 		 730 aa  79  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>