208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2368 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
660 aa  1343    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  35.38 
 
 
667 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  35.01 
 
 
674 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  35.01 
 
 
680 aa  355  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  32.93 
 
 
689 aa  355  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  33.18 
 
 
691 aa  351  2e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  35.48 
 
 
689 aa  350  5e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  33.5 
 
 
641 aa  342  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  32.65 
 
 
732 aa  335  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  32.8 
 
 
709 aa  327  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  31.92 
 
 
661 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  33.44 
 
 
669 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  33.89 
 
 
715 aa  326  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  33.48 
 
 
715 aa  325  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  33.19 
 
 
715 aa  324  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  33.45 
 
 
730 aa  310  5e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  32.12 
 
 
707 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  32.03 
 
 
662 aa  303  8.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  34.1 
 
 
683 aa  300  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  32.37 
 
 
667 aa  300  7e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  30.9 
 
 
734 aa  300  8e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  30.42 
 
 
734 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  30.31 
 
 
739 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  30.31 
 
 
739 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  33.07 
 
 
754 aa  297  4e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  32.45 
 
 
668 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  32.59 
 
 
662 aa  287  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  28.22 
 
 
705 aa  273  6e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  35.7 
 
 
687 aa  269  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  29.3 
 
 
696 aa  259  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  31.88 
 
 
767 aa  256  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  30.82 
 
 
767 aa  256  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  31.68 
 
 
653 aa  252  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  30.45 
 
 
676 aa  250  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  31.51 
 
 
671 aa  243  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  29.04 
 
 
680 aa  240  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  29.09 
 
 
645 aa  239  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  30.96 
 
 
656 aa  238  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  30.6 
 
 
681 aa  227  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  29.53 
 
 
645 aa  227  7e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  33.62 
 
 
674 aa  226  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  33.62 
 
 
674 aa  226  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  28.6 
 
 
635 aa  204  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  28.71 
 
 
673 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  29.93 
 
 
685 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  29.93 
 
 
685 aa  199  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  27.05 
 
 
662 aa  196  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  31.66 
 
 
673 aa  195  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  28.25 
 
 
698 aa  193  8e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  27.53 
 
 
649 aa  193  9e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  29.15 
 
 
689 aa  189  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  31.43 
 
 
672 aa  187  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  28.38 
 
 
662 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  32.79 
 
 
943 aa  185  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  29.91 
 
 
676 aa  182  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  27.38 
 
 
684 aa  178  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  28.63 
 
 
685 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  27.7 
 
 
688 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  27.7 
 
 
688 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  27.49 
 
 
706 aa  166  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  27.39 
 
 
668 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  26.14 
 
 
634 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  29.98 
 
 
726 aa  159  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  26.33 
 
 
633 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  25.83 
 
 
644 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  24.27 
 
 
692 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  26.56 
 
 
644 aa  120  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  25.89 
 
 
631 aa  118  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  23.75 
 
 
637 aa  117  7.999999999999999e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  25.07 
 
 
639 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  26.45 
 
 
632 aa  104  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  23.08 
 
 
632 aa  104  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  25.05 
 
 
634 aa  100  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  23.73 
 
 
742 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  27.59 
 
 
737 aa  97.4  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  23.44 
 
 
742 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  23.26 
 
 
635 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  31.36 
 
 
730 aa  91.3  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  23.04 
 
 
742 aa  89  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  23.68 
 
 
742 aa  88.6  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  39.09 
 
 
681 aa  87.4  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  23.34 
 
 
742 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  23.34 
 
 
742 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  23.6 
 
 
742 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  21.72 
 
 
744 aa  85.5  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  23.6 
 
 
742 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  26.1 
 
 
790 aa  84.7  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  25.13 
 
 
742 aa  84  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  25.06 
 
 
728 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  28.24 
 
 
706 aa  82.4  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  32.68 
 
 
806 aa  80.5  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  40.62 
 
 
788 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4603  transglutaminase domain-containing protein  30.72 
 
 
764 aa  79.7  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  27.38 
 
 
730 aa  79.3  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  38.38 
 
 
760 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  23.73 
 
 
815 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  44.21 
 
 
673 aa  77  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  26.38 
 
 
736 aa  75.1  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  32.31 
 
 
790 aa  73.9  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  29.2 
 
 
800 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>