More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2914 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
706 aa  1364    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  53.48 
 
 
698 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  49.63 
 
 
673 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  50.93 
 
 
689 aa  553  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  49.39 
 
 
673 aa  543  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  48.06 
 
 
676 aa  526  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  48.36 
 
 
684 aa  524  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  50.59 
 
 
685 aa  509  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  49.34 
 
 
726 aa  509  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  49.11 
 
 
688 aa  504  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  48.52 
 
 
688 aa  499  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  36.79 
 
 
645 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  36.23 
 
 
653 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  36.85 
 
 
680 aa  302  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  38.65 
 
 
656 aa  301  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  34.97 
 
 
662 aa  289  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  37.32 
 
 
705 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  36.25 
 
 
645 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  34.78 
 
 
641 aa  273  9e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  35.45 
 
 
661 aa  266  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  32.33 
 
 
689 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  35.69 
 
 
681 aa  258  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  31.26 
 
 
680 aa  249  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  30.66 
 
 
732 aa  248  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  28.93 
 
 
662 aa  248  3e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  35.06 
 
 
669 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  35.88 
 
 
635 aa  246  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  36.67 
 
 
676 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  33.22 
 
 
667 aa  243  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  34.24 
 
 
671 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  28.09 
 
 
662 aa  240  6.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  32.7 
 
 
689 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  31.41 
 
 
707 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  30.53 
 
 
715 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  30.43 
 
 
715 aa  237  7e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  30.89 
 
 
683 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  29.38 
 
 
667 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  30.53 
 
 
715 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  31.73 
 
 
696 aa  234  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  38.2 
 
 
649 aa  231  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  39.71 
 
 
672 aa  230  8e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  29.46 
 
 
674 aa  229  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  29.65 
 
 
691 aa  228  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  34.81 
 
 
668 aa  228  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  36.26 
 
 
674 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  36.26 
 
 
674 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  30.65 
 
 
734 aa  227  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  30.46 
 
 
734 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  30.01 
 
 
739 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  32.87 
 
 
668 aa  221  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  30.01 
 
 
739 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  30.11 
 
 
754 aa  221  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  38.7 
 
 
943 aa  220  7e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  33.39 
 
 
685 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  33.39 
 
 
685 aa  214  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  34.04 
 
 
662 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  29.45 
 
 
709 aa  209  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  28.98 
 
 
730 aa  201  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  30.35 
 
 
767 aa  196  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  30.4 
 
 
767 aa  196  1e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  30.38 
 
 
687 aa  176  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  26.15 
 
 
660 aa  167  5.9999999999999996e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  26.8 
 
 
634 aa  153  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  29.25 
 
 
632 aa  151  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  28.75 
 
 
644 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  29.19 
 
 
632 aa  144  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  26.8 
 
 
730 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  24.75 
 
 
744 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  27.34 
 
 
692 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  28.1 
 
 
633 aa  128  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  23.33 
 
 
631 aa  125  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  27.07 
 
 
644 aa  124  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  28.82 
 
 
639 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  26.35 
 
 
634 aa  104  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  32.39 
 
 
706 aa  99.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  34.08 
 
 
790 aa  95.9  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  26.91 
 
 
763 aa  94  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  43.62 
 
 
681 aa  90.9  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4603  transglutaminase domain-containing protein  26.91 
 
 
764 aa  90.5  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  32.89 
 
 
862 aa  89.7  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1293  transglutaminase domain protein  26.04 
 
 
803 aa  89.7  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  35 
 
 
812 aa  87.4  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  48.89 
 
 
673 aa  87  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  34.42 
 
 
760 aa  85.9  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  22.16 
 
 
637 aa  85.1  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  28.76 
 
 
737 aa  85.1  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  33.11 
 
 
800 aa  85.1  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2905  transglutaminase domain protein  31.6 
 
 
769 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  24.02 
 
 
728 aa  84  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  37.1 
 
 
890 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  28.47 
 
 
749 aa  82.4  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1077  transglutaminase domain protein  28.66 
 
 
770 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785713 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  41.75 
 
 
788 aa  81.3  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  35.71 
 
 
800 aa  80.9  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  40.95 
 
 
743 aa  79.7  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  40.91 
 
 
790 aa  79.7  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  37.32 
 
 
782 aa  79  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  48.31 
 
 
792 aa  78.6  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1473  transglutaminase-like  23.97 
 
 
753 aa  78.2  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.647705  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  27.03 
 
 
815 aa  78.2  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>