236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2773 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  100 
 
 
749 aa  1452    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  36.39 
 
 
736 aa  155  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  36.12 
 
 
840 aa  152  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  37.88 
 
 
774 aa  151  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2535  transglutaminase domain protein  37.55 
 
 
748 aa  143  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  31.97 
 
 
886 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  28.06 
 
 
742 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  30.87 
 
 
742 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  30.87 
 
 
742 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  34.57 
 
 
782 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  26.69 
 
 
742 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  26.27 
 
 
742 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  30.02 
 
 
850 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  30.99 
 
 
825 aa  128  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  30.69 
 
 
742 aa  128  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  30.69 
 
 
742 aa  127  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  27.21 
 
 
742 aa  126  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  27.4 
 
 
728 aa  126  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3214  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 
788 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.257235  normal  0.234323 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  28.64 
 
 
790 aa  124  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  27.32 
 
 
635 aa  124  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  32.72 
 
 
815 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  27.34 
 
 
742 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  32.02 
 
 
826 aa  120  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  30.75 
 
 
812 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  33.21 
 
 
762 aa  118  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  34.19 
 
 
720 aa  118  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  34.82 
 
 
862 aa  117  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  31.7 
 
 
790 aa  114  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  29.91 
 
 
677 aa  114  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  28.42 
 
 
744 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  31.1 
 
 
810 aa  108  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  34.85 
 
 
822 aa  108  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  30.94 
 
 
763 aa  108  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  29.75 
 
 
846 aa  106  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  30.36 
 
 
800 aa  105  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  28.92 
 
 
725 aa  105  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  27.98 
 
 
798 aa  103  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3572  transglutaminase domain protein  31.63 
 
 
982 aa  102  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0384986  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  35.29 
 
 
815 aa  101  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0156  transglutaminase-like  27.3 
 
 
799 aa  101  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.0989488 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  32.25 
 
 
641 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  31.16 
 
 
669 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  28.61 
 
 
788 aa  99.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  33.12 
 
 
794 aa  98.6  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  30.54 
 
 
668 aa  99  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  38.36 
 
 
818 aa  98.6  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1077  transglutaminase domain protein  27.97 
 
 
770 aa  97.4  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785713 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  32.95 
 
 
790 aa  97.1  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  34.67 
 
 
827 aa  96.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2905  transglutaminase domain protein  25.16 
 
 
769 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  34.71 
 
 
743 aa  94.7  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  31.54 
 
 
662 aa  94.7  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  29.04 
 
 
680 aa  93.6  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3693  transglutaminase domain protein  26.07 
 
 
768 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1208  transglutaminase domain-containing protein  27.3 
 
 
831 aa  92.4  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  31.43 
 
 
737 aa  92.4  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  26.59 
 
 
800 aa  91.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  30.95 
 
 
706 aa  92  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  36.84 
 
 
730 aa  91.3  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  30.39 
 
 
771 aa  90.9  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  34.91 
 
 
792 aa  90.9  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1473  transglutaminase-like  27.24 
 
 
753 aa  90.9  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.647705  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  28.99 
 
 
763 aa  90.1  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  34.01 
 
 
914 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3804  transglutaminase domain-containing protein  31.15 
 
 
820 aa  88.6  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3747  transglutaminase domain protein  25.44 
 
 
768 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664376  normal  0.434261 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  28.42 
 
 
681 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  27.6 
 
 
684 aa  87  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  28.92 
 
 
890 aa  87  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  26.98 
 
 
673 aa  86.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  27.92 
 
 
730 aa  86.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  32.03 
 
 
783 aa  86.7  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  31.47 
 
 
689 aa  86.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  33.81 
 
 
760 aa  84.7  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  29.57 
 
 
635 aa  84.3  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  29.23 
 
 
685 aa  82.4  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  24.86 
 
 
637 aa  82.4  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  28.31 
 
 
698 aa  82.4  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27440  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  41.96 
 
 
859 aa  82.4  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  29.59 
 
 
673 aa  81.3  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  24.44 
 
 
634 aa  80.9  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  27.75 
 
 
653 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  34.51 
 
 
806 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  31.32 
 
 
673 aa  80.1  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  28.18 
 
 
706 aa  79.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0440  transglutaminase domain protein  27.48 
 
 
748 aa  79.7  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  28.37 
 
 
726 aa  79.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0636  transglutaminase domain-containing protein  28.72 
 
 
830 aa  78.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00254265  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  24.25 
 
 
656 aa  78.6  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  28.87 
 
 
633 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  28.24 
 
 
688 aa  78.2  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  26.67 
 
 
649 aa  77.4  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  30.07 
 
 
795 aa  77.4  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  28.81 
 
 
644 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  35.04 
 
 
667 aa  77  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  26.77 
 
 
674 aa  77  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  26.77 
 
 
674 aa  77  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  27.76 
 
 
632 aa  77  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  31.34 
 
 
661 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>