239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3075 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 798 aa  1568    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  32.7 
 
 		 812 aa  246  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  31.61 
 
 		 790 aa  239  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  35 
 
 		 782 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  32.89 
 
 		 762 aa  233  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  32.85 
 
 		 810 aa  226  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  31.77 
 
 		 800 aa  220  7.999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  34.38 
 
 		 763 aa  216  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1208  transglutaminase domain-containing protein  31.3 
 
 		 831 aa  211  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  29.89 
 
 		 850 aa  211  6e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  31.23 
 
 		 846 aa  206  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  31.22 
 
 		 825 aa  204  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  32.38 
 
 		 788 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  31.42 
 
 		 914 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  30.11 
 
 		 827 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  32.65 
 
 		 771 aa  155  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  29.85 
 
 		 818 aa  152  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  32.59 
 
 		 792 aa  151  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  30.56 
 
 		 822 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  30.61 
 
 		 815 aa  144  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  33.59 
 
 		 790 aa  141  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  28.74 
 
 		 743 aa  138  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  31.27 
 
 		 783 aa  125  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  28.95 
 
 		 725 aa  121  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  27.89 
 
 		 794 aa  120  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  29.6 
 
 		 736 aa  115  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  27.34 
 
 		 890 aa  114  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27440  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  33.96 
 
 		 859 aa  114  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3804  transglutaminase domain-containing protein  31.27 
 
 		 820 aa  107  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  23.91 
 
 		 635 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  23.97 
 
 		 742 aa  104  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  32 
 
 		 826 aa  101  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  27.68 
 
 		 749 aa  101  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  36.63 
 
 		 730 aa  101  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  34.98 
 
 		 790 aa  101  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  41.89 
 
 		 737 aa  100  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  38.85 
 
 		 720 aa  98.6  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  22.87 
 
 		 742 aa  98.6  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  26.1 
 
 		 742 aa  97.8  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  26.89 
 
 		 742 aa  97.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  26.14 
 
 		 742 aa  97.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  26.89 
 
 		 742 aa  97.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  26.89 
 
 		 742 aa  97.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  28.54 
 
 		 744 aa  95.9  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  39.29 
 
 		 862 aa  95.9  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  32.93 
 
 		 742 aa  92.8  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  28.33 
 
 		 730 aa  92.8  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  35.8 
 
 		 815 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1762  transglutaminase domain protein  30.62 
 
 		 754 aa  92  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  28.27 
 
 		 886 aa  90.5  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  30.77 
 
 		 760 aa  90.1  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2914  transglutaminase domain-containing protein  30.07 
 
 		 769 aa  90.1  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  34.54 
 
 		 800 aa  89  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  26.45 
 
 		 840 aa  88.2  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  33.79 
 
 		 728 aa  87.8  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  35.11 
 
 		 681 aa  87.4  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5534  transglutaminase domain protein  29.17 
 
 		 753 aa  87.4  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0283272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  34.33 
 
 		 806 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  32.93 
 
 		 742 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  30.28 
 
 		 795 aa  85.1  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  34.1 
 
 		 677 aa  85.5  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0581  transglutaminase-like domain-containing protein  40.15 
 
 		 1238 aa  84.3  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  32.14 
 
 		 774 aa  84  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1333  transglutaminase domain protein  39.26 
 
 		 762 aa  81.6  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1151  transglutaminase domain protein  28.62 
 
 		 764 aa  81.3  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.301395  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0440  transglutaminase domain protein  31.41 
 
 		 748 aa  80.5  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3114  transglutaminase domain-containing protein  29.39 
 
 		 784 aa  80.1  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.0170569 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2535  transglutaminase domain protein  28 
 
 		 748 aa  79  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3833  transglutaminase domain protein  31.88 
 
 		 790 aa  79  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0481829  normal  0.0321175 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0636  transglutaminase domain-containing protein  32.43 
 
 		 830 aa  76.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00254265  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0413  transglutaminase domain-containing protein  32.64 
 
 		 507 aa  74.7  0.000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.939018 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4815  transglutaminase domain protein  46.51 
 
 		 775 aa  73.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  25.42 
 
 		 767 aa  73.2  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  24.4 
 
 		 767 aa  73.2  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  35.82 
 
 		 685 aa  71.6  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  35.82 
 
 		 685 aa  71.2  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 637 aa  70.9  0.00000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8517  transglutaminase domain protein  27.09 
 
 		 788 aa  71.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0481033 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05650  Na+-driven multidrug efflux pump  33.58 
 
 		 808 aa  70.9  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  38.94 
 
 		 673 aa  70.1  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  34.04 
 
 		 689 aa  70.5  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  38 
 
 		 668 aa  69.7  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  25.09 
 
 		 763 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  35.29 
 
 		 635 aa  69.3  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  32.7 
 
 		 683 aa  69.3  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  29.75 
 
 		 656 aa  69.3  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  33.77 
 
 		 645 aa  67.8  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  34.81 
 
 		 673 aa  67.8  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  35.29 
 
 		 631 aa  67.4  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  33.56 
 
 		 667 aa  67.8  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  30.43 
 
 		 730 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  29.87 
 
 		 691 aa  67.4  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 706 aa  67  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  23.39 
 
 		 754 aa  66.6  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  32.14 
 
 		 676 aa  66.6  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  28.42 
 
 		 689 aa  66.6  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  37.86 
 
 		 649 aa  65.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  30.5 
 
 		 639 aa  65.1  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  30.15 
 
 		 633 aa  65.1  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  37.6 
 
 		 653 aa  64.7  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>