293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0413 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0413  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
507 aa  969    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.939018 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1198  transglutaminase domain-containing protein  51.99 
 
 
491 aa  419  1e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.135202  normal  0.356317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  35.37 
 
 
812 aa  94  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  33.17 
 
 
890 aa  91.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  30.11 
 
 
800 aa  91.3  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  32.79 
 
 
862 aa  89.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  24.43 
 
 
681 aa  87  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  33.14 
 
 
810 aa  86.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  37.25 
 
 
763 aa  85.9  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  32 
 
 
788 aa  84.7  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  35.94 
 
 
914 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1208  transglutaminase domain-containing protein  29.12 
 
 
831 aa  83.2  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  23.05 
 
 
754 aa  82  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  32.12 
 
 
795 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  27.11 
 
 
730 aa  80.1  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  39.07 
 
 
673 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
782 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  40.91 
 
 
668 aa  79  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  34.33 
 
 
760 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  33.1 
 
 
790 aa  78.2  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  40.13 
 
 
676 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  30.05 
 
 
720 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  34.06 
 
 
806 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  35.76 
 
 
790 aa  77.4  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  37.88 
 
 
644 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  36.43 
 
 
706 aa  77  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  30.81 
 
 
762 aa  77  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  33.12 
 
 
800 aa  76.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  37.12 
 
 
639 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  26.8 
 
 
645 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  29.04 
 
 
815 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  32.33 
 
 
689 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  35.25 
 
 
685 aa  75.1  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  32.64 
 
 
798 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3804  transglutaminase domain-containing protein  30.9 
 
 
820 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  32.9 
 
 
730 aa  74.7  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  41.96 
 
 
705 aa  74.3  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  37.36 
 
 
681 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  37.5 
 
 
684 aa  74.3  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  34.48 
 
 
689 aa  73.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  32.28 
 
 
850 aa  73.9  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  36.02 
 
 
943 aa  73.9  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  30 
 
 
783 aa  73.6  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  32.19 
 
 
763 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  36.22 
 
 
672 aa  73.6  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  34.29 
 
 
744 aa  73.6  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  32.53 
 
 
649 aa  72.8  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3707  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
876 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  32.61 
 
 
667 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  35.77 
 
 
673 aa  72.8  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  31.16 
 
 
633 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  30.26 
 
 
742 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  36.5 
 
 
840 aa  72.4  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  41.98 
 
 
739 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  30.26 
 
 
742 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  28.4 
 
 
825 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  41.98 
 
 
739 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0440  transglutaminase domain protein  26.4 
 
 
748 aa  72.4  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  32.08 
 
 
706 aa  72  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  25.37 
 
 
680 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  41.98 
 
 
707 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  29.61 
 
 
742 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  33.55 
 
 
661 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  41.98 
 
 
734 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  41.98 
 
 
734 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  34.56 
 
 
726 aa  71.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  31.39 
 
 
689 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  35 
 
 
688 aa  70.9  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  28.25 
 
 
826 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  26.74 
 
 
674 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  36.84 
 
 
634 aa  70.5  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  34.82 
 
 
667 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  34.81 
 
 
635 aa  70.1  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  28.71 
 
 
683 aa  69.7  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  26.09 
 
 
774 aa  69.7  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  42.31 
 
 
662 aa  69.3  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  34.29 
 
 
688 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  34.03 
 
 
644 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  30.94 
 
 
730 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  28.74 
 
 
728 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  37.3 
 
 
641 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  36.17 
 
 
680 aa  68.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  30.43 
 
 
709 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  33.14 
 
 
771 aa  68.2  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  40.74 
 
 
732 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  30.15 
 
 
767 aa  67.8  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  31.85 
 
 
715 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  30.68 
 
 
656 aa  67.4  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  29.84 
 
 
846 aa  67.4  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  35.07 
 
 
1305 aa  67.4  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  30.5 
 
 
725 aa  67  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  32.89 
 
 
677 aa  67  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  36.51 
 
 
669 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  31.52 
 
 
698 aa  66.6  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0581  transglutaminase-like domain-containing protein  26.39 
 
 
1238 aa  65.5  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  27.33 
 
 
742 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  26.17 
 
 
696 aa  65.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  30.88 
 
 
634 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  40.74 
 
 
715 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
634 aa  65.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>