283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5110 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  55.04 
 
 
850 aa  757    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
825 aa  1611    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  35.62 
 
 
810 aa  324  5e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  34.14 
 
 
762 aa  277  6e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  35.62 
 
 
812 aa  274  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  31.9 
 
 
800 aa  249  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  33.08 
 
 
782 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  31.88 
 
 
788 aa  233  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1208  transglutaminase domain-containing protein  30.68 
 
 
831 aa  223  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  30.17 
 
 
846 aa  219  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  34.18 
 
 
792 aa  209  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  30.22 
 
 
790 aa  206  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  34.19 
 
 
763 aa  200  7.999999999999999e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  31.42 
 
 
798 aa  199  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  28.75 
 
 
827 aa  194  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  30.83 
 
 
822 aa  181  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  31.87 
 
 
818 aa  171  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  29.51 
 
 
914 aa  167  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  26.9 
 
 
794 aa  157  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  29.62 
 
 
815 aa  150  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  27.6 
 
 
783 aa  144  7e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  27.66 
 
 
743 aa  139  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  31.83 
 
 
725 aa  139  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  31.22 
 
 
790 aa  137  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  30.49 
 
 
749 aa  125  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  26.6 
 
 
742 aa  124  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  33.33 
 
 
742 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  33.49 
 
 
742 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  27.44 
 
 
736 aa  124  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  30.24 
 
 
742 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  28.05 
 
 
742 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  33.49 
 
 
742 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  33.49 
 
 
742 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  28.81 
 
 
728 aa  122  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  28.16 
 
 
635 aa  122  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3804  transglutaminase domain-containing protein  32.49 
 
 
820 aa  121  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  31.42 
 
 
742 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  27.73 
 
 
742 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  30.38 
 
 
862 aa  117  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  32.43 
 
 
720 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  32.29 
 
 
677 aa  114  9e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  42.54 
 
 
890 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  30.58 
 
 
771 aa  111  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2914  transglutaminase domain-containing protein  32.67 
 
 
769 aa  110  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2344  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  27.75 
 
 
790 aa  109  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5534  transglutaminase domain protein  30.48 
 
 
753 aa  108  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0283272  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27440  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  31.37 
 
 
859 aa  108  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  29.89 
 
 
840 aa  108  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  40.62 
 
 
806 aa  108  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  40.91 
 
 
760 aa  107  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  33.99 
 
 
800 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  30.92 
 
 
774 aa  105  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  32.63 
 
 
815 aa  102  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  38.82 
 
 
744 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2535  transglutaminase domain protein  29.37 
 
 
748 aa  99.8  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  32.68 
 
 
943 aa  99.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3214  transglutaminase domain protein  50.91 
 
 
788 aa  99.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.257235  normal  0.234323 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  25.51 
 
 
730 aa  99  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  31.64 
 
 
886 aa  99  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4815  transglutaminase domain protein  30.81 
 
 
775 aa  99  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3114  transglutaminase domain-containing protein  32.95 
 
 
784 aa  98.2  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.0170569 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  34.67 
 
 
681 aa  96.3  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  23.5 
 
 
795 aa  96.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  32.37 
 
 
767 aa  95.1  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  29.19 
 
 
685 aa  94.7  6e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  27.17 
 
 
680 aa  94.7  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  34.07 
 
 
826 aa  94  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  31.43 
 
 
767 aa  92.8  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 
668 aa  92.8  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  28.93 
 
 
685 aa  93.2  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  30.63 
 
 
653 aa  92  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  26.24 
 
 
680 aa  92  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  34.15 
 
 
730 aa  91.7  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  35.04 
 
 
661 aa  90.9  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  35.16 
 
 
691 aa  90.1  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  39.57 
 
 
649 aa  90.5  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  35.71 
 
 
726 aa  89.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  39.2 
 
 
672 aa  88.2  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  29.52 
 
 
706 aa  88.2  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  32.95 
 
 
685 aa  88.2  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  29.85 
 
 
641 aa  87.4  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  28.57 
 
 
669 aa  87.4  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  30.56 
 
 
689 aa  87.4  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  30.81 
 
 
644 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  27.13 
 
 
754 aa  86.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  29.35 
 
 
645 aa  86.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  22.38 
 
 
667 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  34.76 
 
 
671 aa  86.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  28.47 
 
 
634 aa  86.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  28.37 
 
 
673 aa  85.5  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  36.43 
 
 
668 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  31.08 
 
 
637 aa  85.5  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  27.95 
 
 
688 aa  85.1  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  34.62 
 
 
683 aa  84.7  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  30.54 
 
 
737 aa  84.7  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  33.64 
 
 
645 aa  84.7  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  32.93 
 
 
662 aa  84.3  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  27.95 
 
 
688 aa  84.3  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  26.87 
 
 
763 aa  84.3  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  35 
 
 
662 aa  83.2  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>