170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5534 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5534  transglutaminase domain protein  100 
 
 
753 aa  1430    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0283272  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3114  transglutaminase domain-containing protein  33.96 
 
 
784 aa  206  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.0170569 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2914  transglutaminase domain-containing protein  35.85 
 
 
769 aa  204  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2344  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1151  transglutaminase domain protein  32.62 
 
 
764 aa  137  9e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.301395  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3804  transglutaminase domain-containing protein  31.58 
 
 
820 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0636  transglutaminase domain-containing protein  35.57 
 
 
830 aa  131  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00254265  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8517  transglutaminase domain protein  30.79 
 
 
788 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0481033 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  34.28 
 
 
763 aa  117  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  30.88 
 
 
825 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2195  transglutaminase domain protein  30.95 
 
 
790 aa  104  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.330551  normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  30.53 
 
 
790 aa  103  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  30.7 
 
 
850 aa  102  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  29.07 
 
 
846 aa  100  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  28.61 
 
 
810 aa  97.8  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  29.68 
 
 
800 aa  97.8  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3833  transglutaminase domain protein  28.63 
 
 
790 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0481829  normal  0.0321175 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05650  Na+-driven multidrug efflux pump  29.02 
 
 
808 aa  94.4  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  30.18 
 
 
762 aa  94  9e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  30.51 
 
 
812 aa  92.8  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4815  transglutaminase domain protein  28.28 
 
 
775 aa  92.4  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  34.45 
 
 
792 aa  91.7  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1333  transglutaminase domain protein  30.33 
 
 
762 aa  91.3  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135993  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0960  transglutaminase-like cysteine protease  23.78 
 
 
837 aa  89  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1334  transglutaminase domain protein  25.3 
 
 
859 aa  87.8  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000357459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  31.69 
 
 
815 aa  87.4  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1762  transglutaminase domain protein  30.37 
 
 
754 aa  86.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250515  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  31.33 
 
 
744 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  27.21 
 
 
798 aa  86.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  29.04 
 
 
840 aa  85.5  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1290  transglutaminase domain-containing protein  25.45 
 
 
866 aa  85.9  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19935  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1208  transglutaminase domain-containing protein  27.27 
 
 
831 aa  84.7  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  30.13 
 
 
677 aa  84.3  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0487  transglutaminase domain protein  30.31 
 
 
848 aa  82.8  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  29.15 
 
 
827 aa  82  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  26.79 
 
 
890 aa  81.3  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  28.09 
 
 
818 aa  80.5  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4247  transglutaminase domain-containing protein  27.54 
 
 
803 aa  80.1  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  27.5 
 
 
736 aa  79.3  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  29.72 
 
 
822 aa  78.2  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  30.22 
 
 
788 aa  77  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  29.43 
 
 
783 aa  74.7  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  35.29 
 
 
782 aa  74.7  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  32.38 
 
 
790 aa  73.6  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  29.37 
 
 
743 aa  72.8  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  34.91 
 
 
790 aa  73.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  23.36 
 
 
728 aa  73.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  30.49 
 
 
680 aa  72.4  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  28.3 
 
 
725 aa  71.6  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  29.18 
 
 
886 aa  71.2  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3747  transglutaminase domain protein  26.12 
 
 
768 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664376  normal  0.434261 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  31.36 
 
 
862 aa  70.1  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  24.35 
 
 
795 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  28.05 
 
 
774 aa  69.7  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3693  transglutaminase domain protein  26.97 
 
 
768 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  27.45 
 
 
720 aa  69.7  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  30.74 
 
 
771 aa  68.9  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  32.21 
 
 
760 aa  68.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  25.39 
 
 
742 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  28.16 
 
 
681 aa  68.2  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  28.68 
 
 
737 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  23.59 
 
 
742 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  28.99 
 
 
914 aa  64.3  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  25.14 
 
 
742 aa  63.9  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  25.14 
 
 
742 aa  63.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  25.14 
 
 
742 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  24.87 
 
 
635 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  25.14 
 
 
742 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  27.37 
 
 
730 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  24.35 
 
 
742 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  24.19 
 
 
742 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  31.11 
 
 
706 aa  62.4  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  28.31 
 
 
749 aa  62  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  25.25 
 
 
742 aa  62  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  25.51 
 
 
794 aa  62  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1473  transglutaminase-like  26.45 
 
 
753 aa  61.2  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.647705  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  32.59 
 
 
639 aa  60.8  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  28.57 
 
 
730 aa  60.8  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  36.23 
 
 
673 aa  60.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  24.81 
 
 
767 aa  60.1  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0156  transglutaminase-like  26.14 
 
 
799 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.0989488 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  29.81 
 
 
715 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  33.96 
 
 
667 aa  60.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  45.95 
 
 
688 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  27.59 
 
 
806 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  28.46 
 
 
645 aa  60.1  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  36 
 
 
698 aa  59.3  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  28.57 
 
 
800 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3707  transglutaminase domain-containing protein  26.97 
 
 
876 aa  59.7  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  31.52 
 
 
715 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  43.02 
 
 
684 aa  59.3  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  48.33 
 
 
653 aa  58.9  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  31.52 
 
 
715 aa  58.9  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  27.15 
 
 
763 aa  58.9  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  48.33 
 
 
672 aa  58.5  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  30.06 
 
 
730 aa  58.2  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  45.31 
 
 
635 aa  58.2  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0440  transglutaminase domain protein  22.99 
 
 
748 aa  58.2  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  48.33 
 
 
681 aa  57.8  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  28.37 
 
 
732 aa  57.8  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  43.75 
 
 
767 aa  57.8  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>