188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2914 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2914  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
769 aa  1453    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2344  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3114  transglutaminase domain-containing protein  83.45 
 
 
784 aa  1037    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.0170569 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5534  transglutaminase domain protein  35.44 
 
 
753 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0283272  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3804  transglutaminase domain-containing protein  30.07 
 
 
820 aa  178  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0636  transglutaminase domain-containing protein  36.96 
 
 
830 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00254265  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1151  transglutaminase domain protein  35.44 
 
 
764 aa  146  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.301395  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8517  transglutaminase domain protein  28.55 
 
 
788 aa  137  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0481033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  32.58 
 
 
825 aa  133  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4815  transglutaminase domain protein  31.22 
 
 
775 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  31.95 
 
 
762 aa  126  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4247  transglutaminase domain-containing protein  30.75 
 
 
803 aa  111  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2195  transglutaminase domain protein  30.08 
 
 
790 aa  109  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.330551  normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3833  transglutaminase domain protein  29.4 
 
 
790 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0481829  normal  0.0321175 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  30.95 
 
 
782 aa  107  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  29.94 
 
 
846 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  31.77 
 
 
800 aa  104  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  31.35 
 
 
788 aa  104  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1333  transglutaminase domain protein  27.37 
 
 
762 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135993  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  30.27 
 
 
810 aa  102  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  29.14 
 
 
812 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  29.06 
 
 
730 aa  95.9  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05650  Na+-driven multidrug efflux pump  25.36 
 
 
808 aa  95.5  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  28.92 
 
 
850 aa  94.4  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1077  transglutaminase domain protein  32.71 
 
 
770 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785713 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  29.01 
 
 
798 aa  91.7  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1208  transglutaminase domain-containing protein  27.52 
 
 
831 aa  91.3  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1762  transglutaminase domain protein  29.23 
 
 
754 aa  89.7  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250515  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  30.62 
 
 
815 aa  88.6  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  28.09 
 
 
790 aa  87.8  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0960  transglutaminase-like cysteine protease  27.05 
 
 
837 aa  87  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  29.89 
 
 
763 aa  85.5  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  34.06 
 
 
795 aa  85.9  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  33.77 
 
 
792 aa  84.7  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  25.1 
 
 
681 aa  81.6  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1290  transglutaminase domain-containing protein  27.23 
 
 
866 aa  81.6  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19935  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  27.38 
 
 
725 aa  80.5  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  29.78 
 
 
720 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  35.17 
 
 
806 aa  79  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  30.04 
 
 
730 aa  78.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  32.52 
 
 
827 aa  79  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2905  transglutaminase domain protein  26.15 
 
 
769 aa  78.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  30.49 
 
 
790 aa  78.6  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1334  transglutaminase domain protein  24.42 
 
 
859 aa  77.8  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000357459 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  30.73 
 
 
743 aa  77.4  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  24.81 
 
 
890 aa  77.4  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  38.93 
 
 
744 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3693  transglutaminase domain protein  29.22 
 
 
768 aa  74.3  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1473  transglutaminase-like  29.25 
 
 
753 aa  73.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.647705  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  26.44 
 
 
862 aa  73.9  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3747  transglutaminase domain protein  26.92 
 
 
768 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664376  normal  0.434261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  25.56 
 
 
771 aa  72.8  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0156  transglutaminase-like  28.03 
 
 
799 aa  73.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.0989488 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  31.75 
 
 
790 aa  72.8  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0440  transglutaminase domain protein  26.82 
 
 
748 aa  71.6  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  32.49 
 
 
800 aa  70.5  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  28.84 
 
 
736 aa  69.7  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  28.19 
 
 
767 aa  69.3  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  28.57 
 
 
914 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  32.76 
 
 
656 aa  68.6  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  25.23 
 
 
683 aa  68.2  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  28.7 
 
 
774 aa  68.2  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0487  transglutaminase domain protein  28.03 
 
 
848 aa  67.8  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  29.72 
 
 
840 aa  67.4  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  26.52 
 
 
767 aa  67  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  31.34 
 
 
677 aa  67  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  27.91 
 
 
728 aa  66.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  29.08 
 
 
705 aa  65.1  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  30.94 
 
 
760 aa  64.3  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  31.08 
 
 
668 aa  63.9  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  32.14 
 
 
749 aa  63.9  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
706 aa  63.9  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  20.73 
 
 
794 aa  63.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  29.58 
 
 
826 aa  63.9  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  21.65 
 
 
742 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2535  transglutaminase domain protein  27.84 
 
 
748 aa  62.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  27.83 
 
 
632 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  25.71 
 
 
732 aa  62.4  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  23.79 
 
 
742 aa  62.4  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27440  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  28.03 
 
 
859 aa  62.8  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  27.09 
 
 
818 aa  62.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  34.72 
 
 
681 aa  62  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  21.03 
 
 
742 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  28.85 
 
 
674 aa  62  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  28.29 
 
 
653 aa  61.6  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  29.73 
 
 
680 aa  61.6  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  28.85 
 
 
674 aa  62  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  46.05 
 
 
672 aa  61.2  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  27.92 
 
 
763 aa  61.6  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  35.54 
 
 
943 aa  61.2  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  28.22 
 
 
822 aa  61.2  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  28.08 
 
 
783 aa  61.2  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  23.3 
 
 
742 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  23.3 
 
 
742 aa  60.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  30.2 
 
 
645 aa  60.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  23.3 
 
 
742 aa  60.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  21.72 
 
 
742 aa  60.1  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0581  transglutaminase-like domain-containing protein  33.94 
 
 
1238 aa  59.7  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  32.98 
 
 
673 aa  59.3  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  21.03 
 
 
635 aa  59.3  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0251  transglutaminase-like protein  29.37 
 
 
851 aa  58.9  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0634947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>