74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0251 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0251  transglutaminase-like protein  100 
 
 		 851 aa  1735    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0634947  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  30.36 
 
 		 795 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  31.9 
 
 		 763 aa  72  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  33.85 
 
 		 818 aa  64.7  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3114  transglutaminase domain-containing protein  30.14 
 
 		 784 aa  64.3  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.0170569 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  24.42 
 
 		 827 aa  63.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  26.55 
 
 		 762 aa  63.2  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0636  transglutaminase domain-containing protein  25.58 
 
 		 830 aa  62.4  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00254265  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3804  transglutaminase domain-containing protein  29.27 
 
 		 820 aa  62.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  21.59 
 
 		 810 aa  62  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  32.03 
 
 		 792 aa  61.2  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 822 aa  60.8  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  30.14 
 
 		 798 aa  60.1  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2914  transglutaminase domain-containing protein  29.71 
 
 		 769 aa  58.9  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  29.94 
 
 		 790 aa  58.5  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  30.71 
 
 		 846 aa  58.2  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1208  transglutaminase domain-containing protein  31.91 
 
 		 831 aa  57.8  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5534  transglutaminase domain protein  25.33 
 
 		 753 aa  57.4  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0283272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  30.06 
 
 		 890 aa  56.6  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  28.57 
 
 		 749 aa  55.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  22.73 
 
 		 812 aa  54.7  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  31.03 
 
 		 800 aa  54.7  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  22.47 
 
 		 815 aa  54.3  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2861  transglutaminase domain-containing protein  30.3 
 
 		 366 aa  53.5  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.816183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0665  transglutaminase domain-containing protein  27.48 
 
 		 371 aa  53.9  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.713396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  25.41 
 
 		 782 aa  53.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  27.69 
 
 		 790 aa  53.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4247  transglutaminase domain-containing protein  32.65 
 
 		 803 aa  52.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  25.84 
 
 		 681 aa  52.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  26.99 
 
 		 720 aa  52.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  31.01 
 
 		 730 aa  52.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3833  transglutaminase domain protein  25.48 
 
 		 790 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0481829  normal  0.0321175 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0487  transglutaminase domain protein  35.44 
 
 		 848 aa  52  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1473  transglutaminase-like  23.39 
 
 		 753 aa  51.6  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.647705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  25.93 
 
 		 677 aa  51.2  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8517  transglutaminase domain protein  36.27 
 
 		 788 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0481033 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  27.63 
 
 		 728 aa  50.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  26.36 
 
 		 788 aa  50.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1290  transglutaminase domain-containing protein  21.21 
 
 		 866 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19935  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1334  transglutaminase domain protein  24.09 
 
 		 859 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000357459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  28.23 
 
 		 794 aa  49.3  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  28.91 
 
 		 730 aa  49.3  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  27.49 
 
 		 742 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  28 
 
 		 763 aa  48.9  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  28.12 
 
 		 571 aa  48.9  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  22.18 
 
 		 743 aa  48.9  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21580  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  25.93 
 
 		 844 aa  48.9  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.881874  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  28.57 
 
 		 806 aa  48.5  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  27.49 
 
 		 742 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  30.33 
 
 		 338 aa  48.1  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  23.87 
 
 		 689 aa  48.5  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0440  transglutaminase domain protein  25 
 
 		 748 aa  48.1  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  26.05 
 
 		 825 aa  48.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  25.58 
 
 		 850 aa  47.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  26.06 
 
 		 634 aa  47.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  26.06 
 
 		 771 aa  47.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  22.67 
 
 		 742 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  30.07 
 
 		 632 aa  45.8  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  35.51 
 
 		 632 aa  45.8  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  30.33 
 
 		 336 aa  45.8  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1762  transglutaminase domain protein  23.26 
 
 		 754 aa  45.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  25.24 
 
 		 744 aa  45.8  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3586  transglutaminase domain-containing protein  25.87 
 
 		 363 aa  45.4  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  27.78 
 
 		 736 aa  45.8  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  28.03 
 
 		 644 aa  45.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  29.51 
 
 		 337 aa  45.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2064  DNA-binding response regulator  27.74 
 
 		 359 aa  45.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0413  transglutaminase domain-containing protein  27.34 
 
 		 507 aa  45.1  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.939018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  25 
 
 		 725 aa  45.1  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  22.58 
 
 		 500 aa  45.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  30.33 
 
 		 633 aa  44.7  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  38.18 
 
 		 815 aa  44.3  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27440  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  27.43 
 
 		 859 aa  44.3  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0138  transglutaminase domain protein  27.87 
 
 		 320 aa  44.3  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>