151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0487 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0487  transglutaminase domain protein  100 
 
 
848 aa  1637    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1290  transglutaminase domain-containing protein  38.23 
 
 
866 aa  369  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19935  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1334  transglutaminase domain protein  37.32 
 
 
859 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000357459 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1762  transglutaminase domain protein  39.8 
 
 
754 aa  326  1e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250515  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1333  transglutaminase domain protein  36.31 
 
 
762 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135993  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2195  transglutaminase domain protein  37.36 
 
 
790 aa  272  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.330551  normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05650  Na+-driven multidrug efflux pump  36.34 
 
 
808 aa  265  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21580  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  33.55 
 
 
844 aa  248  4e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.881874  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0960  transglutaminase-like cysteine protease  30.71 
 
 
837 aa  232  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4815  transglutaminase domain protein  33.46 
 
 
775 aa  223  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5534  transglutaminase domain protein  29.62 
 
 
753 aa  95.1  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0283272  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  29.91 
 
 
815 aa  92.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3833  transglutaminase domain protein  25.21 
 
 
790 aa  87.8  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0481829  normal  0.0321175 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0636  transglutaminase domain-containing protein  30.26 
 
 
830 aa  84  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00254265  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  27.46 
 
 
825 aa  83.2  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8517  transglutaminase domain protein  27.5 
 
 
788 aa  82  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0481033 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1151  transglutaminase domain protein  29.81 
 
 
764 aa  77  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.301395  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  27.99 
 
 
827 aa  72  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  27.47 
 
 
810 aa  71.2  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  25 
 
 
762 aa  70.9  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  45.83 
 
 
818 aa  69.7  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  45.71 
 
 
822 aa  68.6  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  27.52 
 
 
788 aa  68.2  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3114  transglutaminase domain-containing protein  28.57 
 
 
784 aa  66.6  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.0170569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3804  transglutaminase domain-containing protein  25.93 
 
 
820 aa  65.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  24.19 
 
 
850 aa  65.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  28.61 
 
 
749 aa  65.1  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  26.91 
 
 
794 aa  64.7  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  25.13 
 
 
742 aa  64.3  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  24.2 
 
 
743 aa  63.9  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  30 
 
 
782 aa  64.3  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2914  transglutaminase domain-containing protein  37.38 
 
 
769 aa  63.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2344  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  29.7 
 
 
720 aa  63.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  25.86 
 
 
728 aa  62.8  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  25.13 
 
 
635 aa  62.4  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  25.13 
 
 
742 aa  62  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  25.13 
 
 
742 aa  62  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  25.13 
 
 
742 aa  61.6  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  25.13 
 
 
742 aa  61.6  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  34.25 
 
 
798 aa  61.6  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  31.02 
 
 
763 aa  61.2  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4247  transglutaminase domain-containing protein  29.45 
 
 
803 aa  61.2  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  25.51 
 
 
846 aa  61.2  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  26.29 
 
 
795 aa  60.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3707  transglutaminase domain-containing protein  22.45 
 
 
876 aa  60.1  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  37.8 
 
 
677 aa  58.5  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  40.45 
 
 
792 aa  58.5  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  24.95 
 
 
800 aa  57.8  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  32.18 
 
 
742 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  32.18 
 
 
742 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  26.14 
 
 
725 aa  55.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  26.4 
 
 
790 aa  55.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  32.7 
 
 
689 aa  55.8  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  36.14 
 
 
730 aa  55.1  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  36.84 
 
 
886 aa  54.3  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  31.52 
 
 
676 aa  54.3  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  36.63 
 
 
684 aa  54.3  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0581  transglutaminase-like domain-containing protein  45.9 
 
 
1238 aa  53.9  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  32.03 
 
 
767 aa  53.9  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  36.05 
 
 
668 aa  53.9  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  30.77 
 
 
774 aa  53.9  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  31.03 
 
 
742 aa  54.3  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27440  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  43.24 
 
 
859 aa  53.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  38.3 
 
 
800 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  25.3 
 
 
790 aa  53.5  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  35.9 
 
 
806 aa  52.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  30 
 
 
767 aa  52.4  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  29.45 
 
 
667 aa  52.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  28.74 
 
 
645 aa  52.4  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  37.66 
 
 
656 aa  52.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  30.15 
 
 
890 aa  52.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  25.15 
 
 
742 aa  52  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  35.71 
 
 
688 aa  52  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  36.36 
 
 
685 aa  52  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  36.36 
 
 
685 aa  52  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  34.4 
 
 
730 aa  51.6  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  33.87 
 
 
671 aa  51.2  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  36.71 
 
 
943 aa  51.6  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  36.71 
 
 
783 aa  51.2  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0251  transglutaminase-like protein  35.44 
 
 
851 aa  51.6  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0634947  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  41.79 
 
 
683 aa  51.2  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  35.29 
 
 
673 aa  51.2  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  40.91 
 
 
744 aa  50.8  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  36.17 
 
 
862 aa  50.8  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  40.51 
 
 
681 aa  50.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  40.91 
 
 
639 aa  50.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  27.1 
 
 
732 aa  49.7  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  33.61 
 
 
771 aa  50.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  36.36 
 
 
691 aa  50.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  35.71 
 
 
688 aa  49.7  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  37 
 
 
730 aa  49.7  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  34.85 
 
 
667 aa  49.3  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  37.88 
 
 
680 aa  49.3  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  37.36 
 
 
635 aa  49.3  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  36.23 
 
 
736 aa  49.7  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  28.57 
 
 
840 aa  49.3  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2753  transglutaminase-like  32.61 
 
 
288 aa  48.9  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.251215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  39.13 
 
 
812 aa  48.9  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3572  transglutaminase domain protein  43.04 
 
 
982 aa  48.9  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0384986  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  40 
 
 
673 aa  48.5  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>