64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4247 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4247  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 803 aa  1518    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2914  transglutaminase domain-containing protein  31.29 
 
 		 769 aa  124  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8517  transglutaminase domain protein  29.59 
 
 		 788 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0481033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0636  transglutaminase domain-containing protein  30.92 
 
 		 830 aa  117  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00254265  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3114  transglutaminase domain-containing protein  29.94 
 
 		 784 aa  112  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.0170569 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5534  transglutaminase domain protein  29.98 
 
 		 753 aa  91.7  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0283272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  28.12 
 
 		 810 aa  79  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  27.91 
 
 		 762 aa  78.2  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1151  transglutaminase domain protein  28.27 
 
 		 764 aa  75.9  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.301395  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1762  transglutaminase domain protein  26.88 
 
 		 754 aa  75.9  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0960  transglutaminase-like cysteine protease  23.13 
 
 		 837 aa  72  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4815  transglutaminase domain protein  29.15 
 
 		 775 aa  71.2  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1290  transglutaminase domain-containing protein  24.96 
 
 		 866 aa  69.7  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19935  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0487  transglutaminase domain protein  29.56 
 
 		 848 aa  68.2  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1208  transglutaminase domain-containing protein  26.73 
 
 		 831 aa  67  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2195  transglutaminase domain protein  28.12 
 
 		 790 aa  66.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.330551  normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3833  transglutaminase domain protein  29.18 
 
 		 790 aa  65.1  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0481829  normal  0.0321175 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0251  transglutaminase-like protein  34.41 
 
 		 851 aa  62.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0634947  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05650  Na+-driven multidrug efflux pump  27.33 
 
 		 808 aa  63.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  26.39 
 
 		 800 aa  62.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1333  transglutaminase domain protein  27.58 
 
 		 762 aa  62.4  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  27.24 
 
 		 812 aa  61.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  26.74 
 
 		 798 aa  59.7  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  27.82 
 
 		 763 aa  58.9  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  26.06 
 
 		 825 aa  57  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  25.84 
 
 		 846 aa  56.6  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  30.37 
 
 		 730 aa  55.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  23.58 
 
 		 890 aa  54.7  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  24.32 
 
 		 850 aa  54.3  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  25.14 
 
 		 795 aa  53.5  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  36.99 
 
 		 730 aa  52.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  24.74 
 
 		 790 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  28.91 
 
 		 815 aa  52  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1334  transglutaminase domain protein  23.08 
 
 		 859 aa  51.6  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000357459 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  26.44 
 
 		 680 aa  51.2  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  27.7 
 
 		 749 aa  51.2  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21580  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  25.51 
 
 		 844 aa  50.4  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.881874  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  25.37 
 
 		 818 aa  48.9  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  24.64 
 
 		 744 aa  49.3  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  24.55 
 
 		 754 aa  48.9  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  31.73 
 
 		 790 aa  48.9  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  26.84 
 
 		 815 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  30.77 
 
 		 788 aa  48.5  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  23.77 
 
 		 790 aa  48.1  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  31.06 
 
 		 639 aa  47.8  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27440  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  43.48 
 
 		 859 aa  47.8  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  32.46 
 
 		 677 aa  47.8  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  25.9 
 
 		 862 aa  47.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  25 
 
 		 774 aa  47.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 792 aa  47  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  26.54 
 
 		 674 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  25.65 
 
 		 668 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  26.17 
 
 		 782 aa  46.6  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  26.54 
 
 		 674 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3707  transglutaminase domain-containing protein  27.34 
 
 		 876 aa  45.8  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  26.56 
 
 		 641 aa  46.2  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2535  transglutaminase domain protein  30.26 
 
 		 748 aa  45.8  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  25.83 
 
 		 771 aa  45.4  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2396  transglutaminase-like  29.01 
 
 		 328 aa  45.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  34.21 
 
 		 720 aa  45.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0138  transglutaminase domain protein  27.89 
 
 		 320 aa  45.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  34.25 
 
 		 681 aa  44.7  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  30.66 
 
 		 706 aa  44.3  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  30 
 
 		 743 aa  44.3  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.344249 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>