84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0960 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0960  transglutaminase-like cysteine protease  100 
 
 
837 aa  1689    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2195  transglutaminase domain protein  35.86 
 
 
790 aa  269  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.330551  normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05650  Na+-driven multidrug efflux pump  35.85 
 
 
808 aa  248  4e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1762  transglutaminase domain protein  30.02 
 
 
754 aa  234  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250515  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1334  transglutaminase domain protein  27.93 
 
 
859 aa  229  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000357459 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1290  transglutaminase domain-containing protein  28.26 
 
 
866 aa  225  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19935  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1333  transglutaminase domain protein  28.77 
 
 
762 aa  224  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135993  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21580  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  28.34 
 
 
844 aa  213  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.881874  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4815  transglutaminase domain protein  30.74 
 
 
775 aa  205  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0487  transglutaminase domain protein  29.21 
 
 
848 aa  201  6e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5534  transglutaminase domain protein  25.1 
 
 
753 aa  92.4  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0283272  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1208  transglutaminase domain-containing protein  31.91 
 
 
831 aa  90.9  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3804  transglutaminase domain-containing protein  27.81 
 
 
820 aa  90.5  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  26.58 
 
 
763 aa  86.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  26.84 
 
 
790 aa  84  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  25.87 
 
 
815 aa  74.7  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2914  transglutaminase domain-containing protein  26.96 
 
 
769 aa  73.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2344  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3114  transglutaminase domain-containing protein  28.75 
 
 
784 aa  72.8  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.0170569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  31.48 
 
 
846 aa  71.2  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1151  transglutaminase domain protein  39.67 
 
 
764 aa  70.5  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.301395  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  27.23 
 
 
825 aa  69.3  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  24.74 
 
 
800 aa  69.3  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  26.69 
 
 
810 aa  68.6  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0636  transglutaminase domain-containing protein  27.2 
 
 
830 aa  68.2  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00254265  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  27.08 
 
 
762 aa  67.8  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  25.26 
 
 
798 aa  67  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  25.68 
 
 
782 aa  65.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  25.17 
 
 
812 aa  64.7  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  31.97 
 
 
890 aa  63.9  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  34.23 
 
 
783 aa  63.9  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  26.06 
 
 
771 aa  64.3  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  25.36 
 
 
792 aa  63.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  25.51 
 
 
720 aa  62.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0440  transglutaminase domain protein  24.75 
 
 
748 aa  61.6  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  26.16 
 
 
862 aa  61.6  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  22.95 
 
 
728 aa  61.2  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  28.44 
 
 
725 aa  61.2  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  25.86 
 
 
788 aa  60.8  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  43.59 
 
 
827 aa  60.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  25.88 
 
 
794 aa  59.7  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  37.04 
 
 
790 aa  58.9  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  36.03 
 
 
743 aa  58.9  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  27.76 
 
 
763 aa  58.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  25.37 
 
 
730 aa  57.8  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  24.32 
 
 
850 aa  55.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3833  transglutaminase domain protein  25.88 
 
 
790 aa  55.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0481829  normal  0.0321175 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4247  transglutaminase domain-containing protein  25.48 
 
 
803 aa  55.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  26.56 
 
 
749 aa  55.1  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  29.86 
 
 
681 aa  54.7  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  20.88 
 
 
742 aa  52.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  29.17 
 
 
760 aa  52.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  30.56 
 
 
730 aa  52  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  40.26 
 
 
744 aa  51.6  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  29.17 
 
 
914 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  25 
 
 
795 aa  51.6  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  27.94 
 
 
822 aa  51.6  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  31.87 
 
 
737 aa  51.2  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  25.89 
 
 
653 aa  50.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  35.87 
 
 
767 aa  50.4  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  19.54 
 
 
742 aa  50.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  37.08 
 
 
767 aa  49.7  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  28.72 
 
 
806 aa  49.3  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  19.27 
 
 
742 aa  49.3  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3707  transglutaminase domain-containing protein  34.21 
 
 
876 aa  49.3  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  19.27 
 
 
742 aa  49.3  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  19.54 
 
 
742 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  36.59 
 
 
818 aa  49.7  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  19.23 
 
 
742 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  19.42 
 
 
742 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  28.17 
 
 
639 aa  47.8  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  24.91 
 
 
681 aa  47.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  18.91 
 
 
742 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  19.03 
 
 
742 aa  47  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27440  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  36.25 
 
 
859 aa  47.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  30.34 
 
 
943 aa  46.6  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  36.36 
 
 
707 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  36.36 
 
 
656 aa  46.2  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0156  transglutaminase-like  23.08 
 
 
799 aa  46.2  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.0989488 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  29.69 
 
 
680 aa  45.4  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  33.71 
 
 
668 aa  45.4  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  20.93 
 
 
635 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  35 
 
 
706 aa  45.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  35.06 
 
 
680 aa  45.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0581  transglutaminase-like domain-containing protein  32.11 
 
 
1238 aa  44.3  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>