189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1290 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1334  transglutaminase domain protein  81.4 
 
 
859 aa  1205    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000357459 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1290  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
866 aa  1725    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19935  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0487  transglutaminase domain protein  37.55 
 
 
848 aa  336  9e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1333  transglutaminase domain protein  35.53 
 
 
762 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135993  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2195  transglutaminase domain protein  38.56 
 
 
790 aa  300  8e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.330551  normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1762  transglutaminase domain protein  35.47 
 
 
754 aa  297  6e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250515  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21580  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  34.1 
 
 
844 aa  296  1e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.881874  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0960  transglutaminase-like cysteine protease  29.1 
 
 
837 aa  259  2e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05650  Na+-driven multidrug efflux pump  34.68 
 
 
808 aa  213  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3804  transglutaminase domain-containing protein  26.47 
 
 
820 aa  124  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  30 
 
 
827 aa  98.6  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  24.92 
 
 
812 aa  96.3  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  26.43 
 
 
782 aa  95.1  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  22.73 
 
 
850 aa  94.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  26.28 
 
 
743 aa  91.7  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  26.98 
 
 
792 aa  91.7  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  25.82 
 
 
730 aa  90.5  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5534  transglutaminase domain protein  26.23 
 
 
753 aa  89.7  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0283272  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  24.86 
 
 
825 aa  87  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  27.52 
 
 
815 aa  84  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  28.9 
 
 
800 aa  84  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  25 
 
 
810 aa  83.2  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  32.22 
 
 
818 aa  82  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  26.12 
 
 
794 aa  81.3  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8517  transglutaminase domain protein  25.3 
 
 
788 aa  80.5  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0481033 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  33.12 
 
 
763 aa  79.7  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  32.8 
 
 
822 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  25.15 
 
 
762 aa  78.6  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1151  transglutaminase domain protein  33.53 
 
 
764 aa  77.8  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.301395  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0636  transglutaminase domain-containing protein  26.21 
 
 
830 aa  76.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00254265  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  23.85 
 
 
728 aa  75.9  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2914  transglutaminase domain-containing protein  25.3 
 
 
769 aa  75.5  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2344  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  28.46 
 
 
790 aa  73.6  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3114  transglutaminase domain-containing protein  25.16 
 
 
784 aa  72.8  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.0170569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  29.86 
 
 
730 aa  72  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0581  transglutaminase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
1238 aa  72  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1208  transglutaminase domain-containing protein  23.73 
 
 
831 aa  71.6  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  24.44 
 
 
790 aa  70.1  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  23.46 
 
 
795 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  28.26 
 
 
749 aa  69.3  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  26.42 
 
 
846 aa  68.9  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  24.18 
 
 
681 aa  68.6  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  50 
 
 
806 aa  68.2  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  28.47 
 
 
914 aa  68.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  22.38 
 
 
742 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  28.82 
 
 
725 aa  67  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  30.64 
 
 
720 aa  66.6  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  32.06 
 
 
886 aa  64.7  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  46.67 
 
 
744 aa  64.7  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3833  transglutaminase domain protein  23.3 
 
 
790 aa  64.3  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0481829  normal  0.0321175 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3707  transglutaminase domain-containing protein  23.44 
 
 
876 aa  64.7  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  30.61 
 
 
798 aa  64.3  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  28.57 
 
 
736 aa  64.3  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  32.54 
 
 
763 aa  63.9  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  24.65 
 
 
788 aa  62.8  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  31.85 
 
 
783 aa  62.4  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  29.2 
 
 
890 aa  62  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  30.77 
 
 
771 aa  62  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  25.97 
 
 
862 aa  61.6  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27440  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  27.02 
 
 
859 aa  61.6  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  27.64 
 
 
840 aa  60.1  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  37.84 
 
 
634 aa  58.5  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3747  transglutaminase domain protein  38.55 
 
 
768 aa  58.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664376  normal  0.434261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3693  transglutaminase domain protein  25.68 
 
 
768 aa  58.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4815  transglutaminase domain protein  44.87 
 
 
775 aa  57.8  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  22.78 
 
 
742 aa  57.8  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2535  transglutaminase domain protein  32.87 
 
 
748 aa  57.8  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  22.78 
 
 
635 aa  57.8  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  21.43 
 
 
742 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  28.09 
 
 
774 aa  57.4  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  32.79 
 
 
943 aa  57  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2905  transglutaminase domain protein  28.1 
 
 
769 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  27.32 
 
 
677 aa  57  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  23.24 
 
 
742 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  22.78 
 
 
742 aa  57  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  25.34 
 
 
689 aa  56.6  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  23.24 
 
 
742 aa  56.2  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  28.29 
 
 
800 aa  56.2  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  25.18 
 
 
662 aa  55.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  22.45 
 
 
742 aa  55.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1473  transglutaminase-like  38.37 
 
 
753 aa  55.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.647705  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  35.48 
 
 
631 aa  54.7  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  22.61 
 
 
742 aa  54.3  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  26.49 
 
 
767 aa  53.9  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  27.17 
 
 
767 aa  53.9  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  40.26 
 
 
706 aa  54.3  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4247  transglutaminase domain-containing protein  26.41 
 
 
803 aa  53.9  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  41.79 
 
 
685 aa  53.5  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0413  transglutaminase domain-containing protein  29.17 
 
 
507 aa  53.1  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.939018 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2238  transglutaminase domain protein  35.37 
 
 
862 aa  53.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0156  transglutaminase-like  34.94 
 
 
799 aa  52.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.0989488 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  37.31 
 
 
726 aa  52.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  41.79 
 
 
661 aa  52  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  38.89 
 
 
790 aa  51.6  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  39.68 
 
 
709 aa  51.6  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  25.14 
 
 
742 aa  51.6  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  28.89 
 
 
632 aa  51.6  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  39.71 
 
 
656 aa  51.2  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1077  transglutaminase domain protein  39.19 
 
 
770 aa  51.2  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785713 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  38.37 
 
 
673 aa  51.2  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>