More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3274 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 792 aa  1498    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  34.66 
 
 		 825 aa  262  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  33.71 
 
 		 850 aa  233  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1208  transglutaminase domain-containing protein  29.32 
 
 		 831 aa  226  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  32.75 
 
 		 800 aa  223  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  35.68 
 
 		 812 aa  222  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  32.21 
 
 		 762 aa  220  6e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  32.75 
 
 		 743 aa  219  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  38.27 
 
 		 782 aa  210  9e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  36.57 
 
 		 810 aa  209  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  31.64 
 
 		 788 aa  206  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  36.63 
 
 		 818 aa  200  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  29.63 
 
 		 794 aa  189  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  33.48 
 
 		 827 aa  187  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  33.68 
 
 		 815 aa  187  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  30.51 
 
 		 846 aa  185  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  34.77 
 
 		 822 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  32.74 
 
 		 763 aa  174  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  33.13 
 
 		 798 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  30.28 
 
 		 914 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  28.17 
 
 		 790 aa  135  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  30.06 
 
 		 725 aa  131  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  31.69 
 
 		 771 aa  122  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  29.87 
 
 		 728 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  33.26 
 
 		 790 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  30.77 
 
 		 720 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  37.28 
 
 		 681 aa  115  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  29.48 
 
 		 744 aa  114  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  28.01 
 
 		 742 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  28.37 
 
 		 742 aa  110  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  28.37 
 
 		 742 aa  109  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  37.88 
 
 		 840 aa  108  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  27.14 
 
 		 635 aa  107  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  26.79 
 
 		 742 aa  105  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  27.3 
 
 		 742 aa  105  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  27.05 
 
 		 742 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  27.05 
 
 		 742 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  27.05 
 
 		 742 aa  105  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  27.05 
 
 		 742 aa  105  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  40.6 
 
 		 730 aa  104  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  33.68 
 
 		 749 aa  103  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  39.39 
 
 		 774 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 862 aa  99.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  28.25 
 
 		 783 aa  99.8  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1290  transglutaminase domain-containing protein  25.85 
 
 		 866 aa  99  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19935  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3804  transglutaminase domain-containing protein  32.17 
 
 		 820 aa  98.6  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  30.05 
 
 		 736 aa  98.2  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5534  transglutaminase domain protein  31.5 
 
 		 753 aa  98.2  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0283272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2535  transglutaminase domain protein  30.21 
 
 		 748 aa  98.2  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27440  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  31.43 
 
 		 859 aa  97.4  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  26.83 
 
 		 890 aa  94.4  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1334  transglutaminase domain protein  25.74 
 
 		 859 aa  94  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000357459 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4815  transglutaminase domain protein  29.27 
 
 		 775 aa  93.6  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  37.43 
 
 		 634 aa  92.8  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3572  transglutaminase domain protein  40.96 
 
 		 982 aa  92.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0384986  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  28.72 
 
 		 730 aa  92  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  31.29 
 
 		 681 aa  91.3  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  28.5 
 
 		 806 aa  91.3  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  44.78 
 
 		 706 aa  90.5  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  30.3 
 
 		 886 aa  89.7  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  35.42 
 
 		 637 aa  89  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 677 aa  89  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  35.75 
 
 		 676 aa  88.6  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  27.27 
 
 		 800 aa  88.2  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  45.45 
 
 		 669 aa  88.2  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3833  transglutaminase domain protein  32.57 
 
 		 790 aa  87.8  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0481829  normal  0.0321175 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3114  transglutaminase domain-containing protein  33.03 
 
 		 784 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.0170569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  37.02 
 
 		 815 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  41.91 
 
 		 645 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  38.31 
 
 		 671 aa  86.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  32.67 
 
 		 795 aa  86.7  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  41.6 
 
 		 641 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  38.46 
 
 		 656 aa  84.3  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  31.5 
 
 		 661 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  46.6 
 
 		 705 aa  83.2  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  38.35 
 
 		 633 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1333  transglutaminase domain protein  29.94 
 
 		 762 aa  82.8  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  42.42 
 
 		 689 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2914  transglutaminase domain-containing protein  32.38 
 
 		 769 aa  82.4  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  28.26 
 
 		 790 aa  82.4  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  41.6 
 
 		 668 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  47.78 
 
 		 653 aa  82  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  42.5 
 
 		 662 aa  81.3  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  32.11 
 
 		 667 aa  81.6  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  36.46 
 
 		 826 aa  81.3  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  45.37 
 
 		 674 aa  81.3  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  45.37 
 
 		 674 aa  81.3  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  39.6 
 
 		 726 aa  80.1  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  32.47 
 
 		 732 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  47.83 
 
 		 943 aa  79  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  48.31 
 
 		 706 aa  79  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  43.82 
 
 		 673 aa  78.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05650  Na+-driven multidrug efflux pump  29.34 
 
 		 808 aa  78.2  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  36.5 
 
 		 645 aa  78.2  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  37.01 
 
 		 674 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  37.5 
 
 		 672 aa  77.8  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  34.84 
 
 		 631 aa  77.8  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  46.74 
 
 		 673 aa  76.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0581  transglutaminase-like domain-containing protein  37.61 
 
 		 1238 aa  75.9  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  39.8 
 
 		 662 aa  76.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>