More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1056 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  100 
 
 		 890 aa  1805    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  34.45 
 
 		 806 aa  228  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  37.69 
 
 		 730 aa  183  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  47.8 
 
 		 795 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  32.32 
 
 		 720 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  30.4 
 
 		 760 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  37.44 
 
 		 862 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0440  transglutaminase domain protein  31.21 
 
 		 748 aa  140  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  31.23 
 
 		 728 aa  138  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  31.01 
 
 		 790 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  38.2 
 
 		 763 aa  131  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  35.35 
 
 		 742 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  31.2 
 
 		 742 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  31.2 
 
 		 742 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  31.2 
 
 		 742 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  31.2 
 
 		 742 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  41.61 
 
 		 742 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  43.75 
 
 		 742 aa  126  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  32.03 
 
 		 815 aa  126  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  39.75 
 
 		 742 aa  125  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  33.84 
 
 		 635 aa  124  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  44.2 
 
 		 730 aa  123  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  44.16 
 
 		 826 aa  122  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  39.13 
 
 		 742 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  39.25 
 
 		 725 aa  121  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  34.29 
 
 		 800 aa  120  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3707  transglutaminase domain-containing protein  25.94 
 
 		 876 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  28.53 
 
 		 744 aa  120  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  28.79 
 
 		 810 aa  118  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  31.28 
 
 		 790 aa  117  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  45.45 
 
 		 681 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  43.8 
 
 		 737 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  27.73 
 
 		 812 aa  114  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  35.38 
 
 		 827 aa  114  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  42.54 
 
 		 825 aa  113  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  35.29 
 
 		 788 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  37.93 
 
 		 771 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  32.67 
 
 		 850 aa  112  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  36.72 
 
 		 815 aa  111  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  26.91 
 
 		 736 aa  110  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1208  transglutaminase domain-containing protein  29.57 
 
 		 831 aa  110  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  42.75 
 
 		 790 aa  108  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  33.54 
 
 		 798 aa  108  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  27.14 
 
 		 846 aa  106  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  37.06 
 
 		 774 aa  105  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  36.02 
 
 		 677 aa  104  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  34.27 
 
 		 840 aa  103  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  38.17 
 
 		 782 aa  103  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  37.82 
 
 		 763 aa  103  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  36.18 
 
 		 800 aa  103  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2535  transglutaminase domain protein  36.88 
 
 		 748 aa  101  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 762 aa  96.7  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 886 aa  95.5  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  25.88 
 
 		 645 aa  94.7  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0581  transglutaminase-like domain-containing protein  40.15 
 
 		 1238 aa  93.6  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  34.34 
 
 		 633 aa  94  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  41.98 
 
 		 914 aa  93.2  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  34.97 
 
 		 639 aa  92.4  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1473  transglutaminase-like  27.41 
 
 		 753 aa  92  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.647705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  38.93 
 
 		 734 aa  91.7  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  38.93 
 
 		 734 aa  91.3  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2905  transglutaminase domain protein  27.33 
 
 		 769 aa  91.3  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0413  transglutaminase domain-containing protein  40 
 
 		 507 aa  91.3  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.939018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3804  transglutaminase domain-containing protein  32.42 
 
 		 820 aa  91.3  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  37.4 
 
 		 674 aa  90.5  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  38.69 
 
 		 709 aa  90.5  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  38.93 
 
 		 707 aa  90.1  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1077  transglutaminase domain protein  26.67 
 
 		 770 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785713 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  32.43 
 
 		 783 aa  89.4  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  37.5 
 
 		 673 aa  89  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  37.5 
 
 		 649 aa  89.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  33.77 
 
 		 644 aa  89  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  32.35 
 
 		 792 aa  88.6  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  36.18 
 
 		 732 aa  89  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  48.31 
 
 		 739 aa  88.6  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  28.76 
 
 		 689 aa  88.6  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  48.31 
 
 		 739 aa  88.6  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  37.78 
 
 		 943 aa  88.2  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  34.59 
 
 		 691 aa  87.8  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  35.61 
 
 		 767 aa  87  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  29.33 
 
 		 688 aa  87.4  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  30.23 
 
 		 743 aa  87.4  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  35.48 
 
 		 818 aa  87.4  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  28.89 
 
 		 688 aa  86.3  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  37.5 
 
 		 730 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  41.58 
 
 		 767 aa  87  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  30.11 
 
 		 689 aa  87  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  29.35 
 
 		 749 aa  86.3  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  36.03 
 
 		 684 aa  85.9  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  39.45 
 
 		 635 aa  85.5  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  35.88 
 
 		 667 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  41.18 
 
 		 668 aa  85.5  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  33.14 
 
 		 673 aa  84.7  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  34.42 
 
 		 673 aa  84.7  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  36.15 
 
 		 680 aa  84.7  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  37.4 
 
 		 680 aa  84.7  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  35.53 
 
 		 715 aa  84.3  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  38.17 
 
 		 676 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  35.53 
 
 		 715 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  35.1 
 
 		 715 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>