285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1403 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  100 
 
 		 850 aa  1662    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  54.02 
 
 		 825 aa  739    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  34.32 
 
 		 810 aa  314  4.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  35.78 
 
 		 762 aa  285  3.0000000000000004e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 800 aa  261  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  36.19 
 
 		 782 aa  259  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  32 
 
 		 812 aa  257  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  30.94 
 
 		 846 aa  229  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  29.42 
 
 		 827 aa  222  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1208  transglutaminase domain-containing protein  30.11 
 
 		 831 aa  220  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  30.28 
 
 		 788 aa  219  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  32.44 
 
 		 790 aa  214  5.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  30.88 
 
 		 798 aa  189  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  26.69 
 
 		 794 aa  186  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  34.46 
 
 		 763 aa  183  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  30.57 
 
 		 822 aa  181  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  30.19 
 
 		 914 aa  178  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  29.72 
 
 		 743 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  34.08 
 
 		 792 aa  171  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  30.28 
 
 		 818 aa  169  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  29.63 
 
 		 815 aa  164  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  36.88 
 
 		 790 aa  137  8e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  27.55 
 
 		 783 aa  137  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  35.76 
 
 		 677 aa  134  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3804  transglutaminase domain-containing protein  33.89 
 
 		 820 aa  133  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  35.05 
 
 		 725 aa  133  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  38.5 
 
 		 862 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  29.82 
 
 		 744 aa  126  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  30.56 
 
 		 749 aa  124  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  35.02 
 
 		 720 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  29.01 
 
 		 771 aa  119  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  26.45 
 
 		 728 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  29.54 
 
 		 840 aa  116  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  27.06 
 
 		 774 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  44.7 
 
 		 730 aa  115  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  29.12 
 
 		 736 aa  115  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  36.12 
 
 		 790 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  32.67 
 
 		 890 aa  113  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  38 
 
 		 760 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2535  transglutaminase domain protein  28.4 
 
 		 748 aa  111  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  32.23 
 
 		 800 aa  110  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  30.26 
 
 		 742 aa  110  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  28.07 
 
 		 742 aa  110  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  28.07 
 
 		 742 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  28.07 
 
 		 742 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27440  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  30.19 
 
 		 859 aa  109  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  28.07 
 
 		 742 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  45.38 
 
 		 815 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  34.44 
 
 		 742 aa  107  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  36.92 
 
 		 886 aa  108  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  37.43 
 
 		 826 aa  107  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  34.44 
 
 		 742 aa  107  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  34.44 
 
 		 742 aa  107  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  34.44 
 
 		 635 aa  106  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  38.76 
 
 		 806 aa  105  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4815  transglutaminase domain protein  32.93 
 
 		 775 aa  104  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 742 aa  104  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  40.48 
 
 		 681 aa  104  9e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  39.42 
 
 		 943 aa  100  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3572  transglutaminase domain protein  30.48 
 
 		 982 aa  99.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0384986  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5534  transglutaminase domain protein  28.94 
 
 		 753 aa  99.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0283272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  38.56 
 
 		 706 aa  95.9  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  29.37 
 
 		 645 aa  95.5  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  34.38 
 
 		 730 aa  95.5  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  27.41 
 
 		 763 aa  94.7  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  32.37 
 
 		 737 aa  94.7  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  33.9 
 
 		 668 aa  94.4  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  32.5 
 
 		 676 aa  94  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3214  transglutaminase domain protein  43.08 
 
 		 788 aa  93.6  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.257235  normal  0.234323 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  34.53 
 
 		 689 aa  93.6  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  28.63 
 
 		 767 aa  92.4  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  32.37 
 
 		 633 aa  92.4  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  27.44 
 
 		 683 aa  92  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  32.94 
 
 		 795 aa  90.9  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0581  transglutaminase-like domain-containing protein  36.57 
 
 		 1238 aa  90.9  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8517  transglutaminase domain protein  29.69 
 
 		 788 aa  90.5  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0481033 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2914  transglutaminase domain-containing protein  29.85 
 
 		 769 aa  90.5  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  28.35 
 
 		 653 aa  90.1  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  39.02 
 
 		 672 aa  90.9  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  26.91 
 
 		 767 aa  89.7  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  29.07 
 
 		 674 aa  90.1  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  29.07 
 
 		 674 aa  90.1  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0636  transglutaminase domain-containing protein  31.12 
 
 		 830 aa  89  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00254265  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  34.38 
 
 		 732 aa  88.2  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  34.62 
 
 		 661 aa  88.6  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  32 
 
 		 671 aa  88.2  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  35.04 
 
 		 656 aa  88.2  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3114  transglutaminase domain-containing protein  29.7 
 
 		 784 aa  87.8  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.0170569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3833  transglutaminase domain protein  28.98 
 
 		 790 aa  87.8  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0481829  normal  0.0321175 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1077  transglutaminase domain protein  28.1 
 
 		 770 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785713 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  32 
 
 		 674 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  33.12 
 
 		 726 aa  86.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  38.76 
 
 		 669 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  34.59 
 
 		 730 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0156  transglutaminase-like  26 
 
 		 799 aa  86.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.0989488 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  33.75 
 
 		 681 aa  85.9  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  39.53 
 
 		 641 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  31.75 
 
 		 645 aa  85.5  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  26.74 
 
 		 667 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  28.79 
 
 		 644 aa  84.7  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>