More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0726 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  100 
 
 
668 aa  1350    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  38.22 
 
 
653 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  36.02 
 
 
662 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  36.52 
 
 
645 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  36.29 
 
 
645 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  36.12 
 
 
656 aa  318  3e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  34.36 
 
 
705 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  35.61 
 
 
680 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  36 
 
 
681 aa  297  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  37.72 
 
 
943 aa  290  5.0000000000000004e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  36.52 
 
 
635 aa  281  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  35.28 
 
 
685 aa  280  7e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  35.28 
 
 
685 aa  279  1e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  31.72 
 
 
683 aa  275  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  37.61 
 
 
673 aa  273  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  33.87 
 
 
671 aa  270  8.999999999999999e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  37.36 
 
 
674 aa  267  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  37.36 
 
 
674 aa  267  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  34.69 
 
 
698 aa  263  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  34.12 
 
 
673 aa  259  8e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  34.17 
 
 
641 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  36.97 
 
 
676 aa  257  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  30.92 
 
 
691 aa  256  9e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  31.52 
 
 
696 aa  255  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  32.03 
 
 
680 aa  253  7e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  31.87 
 
 
674 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  35.49 
 
 
661 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  34.52 
 
 
649 aa  251  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  32.78 
 
 
767 aa  251  3e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  32.72 
 
 
767 aa  251  4e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  37.85 
 
 
684 aa  250  7e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  36.54 
 
 
672 aa  249  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  35.38 
 
 
676 aa  246  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  34.05 
 
 
667 aa  243  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  30.92 
 
 
689 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  33.65 
 
 
668 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  30.82 
 
 
689 aa  240  8e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  32.76 
 
 
689 aa  239  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  30.91 
 
 
667 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  35.83 
 
 
688 aa  238  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  35.5 
 
 
688 aa  239  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  33.76 
 
 
726 aa  230  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  35.02 
 
 
730 aa  229  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  31.21 
 
 
669 aa  227  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  33.44 
 
 
662 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  35.33 
 
 
685 aa  222  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  32.08 
 
 
732 aa  219  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  31.87 
 
 
715 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  32.13 
 
 
715 aa  217  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  30.84 
 
 
754 aa  217  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  29.56 
 
 
715 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  26.58 
 
 
662 aa  203  8e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  33.55 
 
 
706 aa  201  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  30.25 
 
 
707 aa  194  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  26.28 
 
 
662 aa  190  8e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  29.37 
 
 
734 aa  187  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  29 
 
 
734 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  28.06 
 
 
709 aa  185  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  28.57 
 
 
660 aa  184  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  28.41 
 
 
739 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  28.41 
 
 
739 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  29.77 
 
 
687 aa  161  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  24.82 
 
 
692 aa  151  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  27.43 
 
 
633 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  29.55 
 
 
632 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  31.46 
 
 
632 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  27.74 
 
 
644 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  29.93 
 
 
644 aa  126  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  27.31 
 
 
634 aa  126  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  30.59 
 
 
639 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  25.26 
 
 
631 aa  115  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  24.07 
 
 
730 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  33.23 
 
 
737 aa  105  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  23.08 
 
 
742 aa  104  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4603  transglutaminase domain-containing protein  24.91 
 
 
764 aa  104  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  23.26 
 
 
635 aa  104  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  25.85 
 
 
637 aa  104  5e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  28.31 
 
 
706 aa  103  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  23.26 
 
 
742 aa  103  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  23.26 
 
 
742 aa  103  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  22.49 
 
 
742 aa  103  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  26.67 
 
 
742 aa  103  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  26.67 
 
 
742 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  23.59 
 
 
744 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  22.73 
 
 
742 aa  100  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  23.09 
 
 
742 aa  100  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  22.91 
 
 
742 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  26.94 
 
 
634 aa  98.2  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  32.23 
 
 
850 aa  97.4  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  39.2 
 
 
760 aa  97.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  41.67 
 
 
788 aa  94  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
825 aa  92.8  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  42.57 
 
 
681 aa  90.5  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0581  transglutaminase-like domain-containing protein  35.48 
 
 
1238 aa  89.4  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  40 
 
 
720 aa  89.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  30.85 
 
 
728 aa  89  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  50 
 
 
673 aa  88.6  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  30 
 
 
800 aa  88.2  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  34.43 
 
 
815 aa  88.2  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  32.24 
 
 
782 aa  87.8  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>