158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4603 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4603  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
764 aa  1505    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  24.64 
 
 
744 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  26.44 
 
 
730 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  26.33 
 
 
644 aa  108  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  25.28 
 
 
730 aa  106  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  28.5 
 
 
671 aa  105  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  22.5 
 
 
732 aa  102  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  22.16 
 
 
680 aa  102  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  25.59 
 
 
680 aa  99.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  24.21 
 
 
767 aa  97.4  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  26.97 
 
 
676 aa  96.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  24.65 
 
 
767 aa  95.5  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  24.75 
 
 
715 aa  95.5  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  24.63 
 
 
715 aa  94.7  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  25.97 
 
 
673 aa  94  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  25.73 
 
 
653 aa  92.8  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  24.75 
 
 
715 aa  92.8  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  25.05 
 
 
632 aa  92  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  22.84 
 
 
683 aa  91.7  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  28.25 
 
 
631 aa  92  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  26.37 
 
 
644 aa  90.5  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  25.92 
 
 
632 aa  90.5  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  24.03 
 
 
754 aa  89.7  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  25.9 
 
 
668 aa  89.4  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  29.25 
 
 
634 aa  88.2  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  33.84 
 
 
667 aa  87.8  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  27.36 
 
 
696 aa  88.2  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  27.59 
 
 
662 aa  87  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  23.94 
 
 
709 aa  87  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  43.22 
 
 
662 aa  87  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  25.91 
 
 
681 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  25.16 
 
 
689 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  26.34 
 
 
685 aa  85.9  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  45.56 
 
 
705 aa  85.5  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  26.34 
 
 
685 aa  85.5  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  33.71 
 
 
633 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  24.94 
 
 
687 aa  84.7  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  27.01 
 
 
662 aa  83.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  35.48 
 
 
656 aa  83.2  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  34.3 
 
 
649 aa  82.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  24.18 
 
 
707 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  27.15 
 
 
639 aa  81.6  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  22.99 
 
 
734 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  21.98 
 
 
734 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  30.72 
 
 
660 aa  79.3  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1293  transglutaminase domain protein  27.56 
 
 
803 aa  79.7  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269788  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  25.58 
 
 
645 aa  79  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  34.15 
 
 
635 aa  79  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  28.57 
 
 
669 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  26 
 
 
676 aa  78.2  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  26.94 
 
 
674 aa  77.8  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  28.22 
 
 
685 aa  77.8  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  26.94 
 
 
674 aa  77.8  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  40.95 
 
 
788 aa  77.4  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  23.54 
 
 
641 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  22.56 
 
 
634 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  25.13 
 
 
661 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  33.53 
 
 
662 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  36.62 
 
 
684 aa  75.5  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  24.58 
 
 
673 aa  73.9  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  34.18 
 
 
689 aa  73.6  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  37.39 
 
 
800 aa  72.8  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  34.55 
 
 
706 aa  73.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  32.94 
 
 
668 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  20.7 
 
 
689 aa  72  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  28.46 
 
 
681 aa  72  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  27.04 
 
 
637 aa  72  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  34.74 
 
 
691 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  31.54 
 
 
672 aa  70.5  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  28.08 
 
 
800 aa  70.5  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  30.19 
 
 
688 aa  69.7  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  38.46 
 
 
692 aa  69.3  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  27.54 
 
 
763 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  33.82 
 
 
812 aa  68.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  40.66 
 
 
645 aa  69.3  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  31.69 
 
 
886 aa  68.6  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  39.22 
 
 
673 aa  67.8  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  46.58 
 
 
726 aa  67.4  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  37.61 
 
 
698 aa  67.4  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  32.2 
 
 
667 aa  67  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  34.19 
 
 
943 aa  66.6  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3693  transglutaminase domain protein  30.93 
 
 
768 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0581  transglutaminase-like domain-containing protein  37.96 
 
 
1238 aa  65.9  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3747  transglutaminase domain protein  31.96 
 
 
768 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664376  normal  0.434261 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  31.71 
 
 
739 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  31.71 
 
 
739 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 
736 aa  65.5  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  39.13 
 
 
688 aa  65.1  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  32.73 
 
 
674 aa  64.7  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  25.35 
 
 
862 aa  64.3  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0156  transglutaminase-like  21.17 
 
 
799 aa  63.9  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.0989488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  34.35 
 
 
810 aa  63.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  38.3 
 
 
743 aa  62.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  32 
 
 
762 aa  62.4  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  35.29 
 
 
737 aa  62  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  30.28 
 
 
890 aa  61.6  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  28.36 
 
 
783 aa  61.2  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  40 
 
 
706 aa  61.2  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  36.9 
 
 
782 aa  61.2  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  33.64 
 
 
760 aa  61.2  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>