More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2289 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  74.85 
 
 
732 aa  1079    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  100 
 
 
707 aa  1462    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  56.77 
 
 
680 aa  729    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  94.14 
 
 
734 aa  1370    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  92.85 
 
 
739 aa  1356    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  93.87 
 
 
734 aa  1364    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  92.85 
 
 
739 aa  1356    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  75.43 
 
 
709 aa  1046    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  52.45 
 
 
730 aa  729    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  56.14 
 
 
674 aa  770    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  53.47 
 
 
689 aa  750    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  75.76 
 
 
715 aa  1069    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  75.04 
 
 
715 aa  1062    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  57.85 
 
 
691 aa  804    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  74.96 
 
 
715 aa  1069    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  55.28 
 
 
667 aa  750    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  52.67 
 
 
689 aa  676    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  35.92 
 
 
668 aa  379  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  34.5 
 
 
754 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  33.82 
 
 
641 aa  361  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  35.45 
 
 
667 aa  357  2.9999999999999997e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  34.43 
 
 
662 aa  353  7e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  32.8 
 
 
661 aa  351  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  34.12 
 
 
662 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  32.98 
 
 
669 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  33.53 
 
 
653 aa  324  4e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  31.01 
 
 
660 aa  317  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  33.28 
 
 
656 aa  317  4e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  33.28 
 
 
681 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  31.87 
 
 
683 aa  314  3.9999999999999997e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  33.92 
 
 
676 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  31.05 
 
 
645 aa  302  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  36.02 
 
 
767 aa  302  1e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  31.05 
 
 
705 aa  296  6e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  30.83 
 
 
767 aa  295  2e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  32.14 
 
 
671 aa  292  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  36.98 
 
 
674 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  36.98 
 
 
674 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  34.3 
 
 
687 aa  276  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  32.72 
 
 
673 aa  271  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  30.56 
 
 
696 aa  264  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  31.48 
 
 
645 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  29.6 
 
 
680 aa  261  3e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  31.25 
 
 
698 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  32.54 
 
 
688 aa  251  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  29.73 
 
 
689 aa  248  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  32.37 
 
 
688 aa  247  6e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  29.02 
 
 
673 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  28.15 
 
 
662 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  30.82 
 
 
662 aa  240  6.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  30 
 
 
635 aa  238  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  32.15 
 
 
672 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  36.15 
 
 
943 aa  232  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  30.85 
 
 
676 aa  230  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  30.9 
 
 
684 aa  230  8e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  31.99 
 
 
726 aa  213  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  31.61 
 
 
685 aa  211  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  31.46 
 
 
706 aa  210  8e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  29.58 
 
 
685 aa  207  6e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  29.58 
 
 
685 aa  206  9e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  29.79 
 
 
649 aa  206  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  31.04 
 
 
668 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  26.95 
 
 
634 aa  154  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  23.82 
 
 
692 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  26.3 
 
 
644 aa  140  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  31.31 
 
 
644 aa  137  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  28.94 
 
 
639 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  27.55 
 
 
632 aa  132  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  26.67 
 
 
633 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  26.97 
 
 
632 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  22.53 
 
 
637 aa  119  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  23.66 
 
 
744 aa  118  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  22.05 
 
 
631 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  37.18 
 
 
760 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  26.56 
 
 
634 aa  105  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  29.02 
 
 
790 aa  104  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  24.55 
 
 
730 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2905  transglutaminase domain protein  27.27 
 
 
769 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  29.55 
 
 
737 aa  100  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  42.75 
 
 
681 aa  100  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  40.77 
 
 
800 aa  100  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4603  transglutaminase domain-containing protein  23.17 
 
 
764 aa  97.1  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3693  transglutaminase domain protein  25.09 
 
 
768 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  25.68 
 
 
815 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1077  transglutaminase domain protein  29.62 
 
 
770 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785713 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3747  transglutaminase domain protein  23.53 
 
 
768 aa  90.9  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664376  normal  0.434261 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  38.46 
 
 
782 aa  90.9  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  38.93 
 
 
890 aa  90.1  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  40.15 
 
 
806 aa  90.1  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  25.49 
 
 
862 aa  89.7  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  25.07 
 
 
795 aa  88.6  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  27.8 
 
 
788 aa  87  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  22.58 
 
 
742 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0581  transglutaminase-like domain-containing protein  26.09 
 
 
1238 aa  86.3  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  32.52 
 
 
800 aa  85.1  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  22.71 
 
 
742 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  26.1 
 
 
826 aa  84  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  22.44 
 
 
742 aa  84  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  22.44 
 
 
742 aa  84  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  26.81 
 
 
763 aa  83.2  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>