More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3211 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  100 
 
 
763 aa  1463    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  47.88 
 
 
790 aa  608  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  34.13 
 
 
812 aa  324  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  36.18 
 
 
810 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  37.17 
 
 
782 aa  269  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  32.62 
 
 
846 aa  259  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  35.39 
 
 
788 aa  259  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  34.41 
 
 
762 aa  259  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1208  transglutaminase domain-containing protein  32.53 
 
 
831 aa  256  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  33.29 
 
 
825 aa  236  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  33.52 
 
 
800 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  32.05 
 
 
850 aa  232  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  33.95 
 
 
725 aa  229  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  34.39 
 
 
798 aa  224  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  35.7 
 
 
790 aa  201  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  31.77 
 
 
914 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  34.07 
 
 
771 aa  183  9.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  31.36 
 
 
783 aa  177  8e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  32.07 
 
 
815 aa  167  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  29.95 
 
 
822 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  27.52 
 
 
794 aa  164  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  32.72 
 
 
743 aa  164  8.000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  30.54 
 
 
792 aa  162  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  31.95 
 
 
827 aa  157  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  30.63 
 
 
720 aa  145  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  31.35 
 
 
728 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  29.06 
 
 
890 aa  135  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27440  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  33.23 
 
 
859 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  40.12 
 
 
760 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  31.32 
 
 
730 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  29.74 
 
 
862 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  28.73 
 
 
744 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5534  transglutaminase domain protein  33.42 
 
 
753 aa  115  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0283272  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  37.58 
 
 
840 aa  114  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  38.62 
 
 
774 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  30.08 
 
 
795 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  37.58 
 
 
736 aa  111  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  41.38 
 
 
790 aa  111  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  35.12 
 
 
681 aa  108  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  30.77 
 
 
749 aa  107  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  30.9 
 
 
826 aa  104  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  24.39 
 
 
742 aa  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  30.88 
 
 
742 aa  103  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  30.1 
 
 
742 aa  102  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  37.5 
 
 
806 aa  102  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  29.63 
 
 
742 aa  101  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  27.12 
 
 
742 aa  101  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  30.6 
 
 
815 aa  100  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  27.94 
 
 
742 aa  100  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  29.29 
 
 
742 aa  99.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  29.29 
 
 
742 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  29.29 
 
 
742 aa  99.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2535  transglutaminase domain protein  32.92 
 
 
748 aa  98.6  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  37.8 
 
 
730 aa  98.2  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  31.2 
 
 
767 aa  97.4  9e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  40.36 
 
 
737 aa  97.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  36.42 
 
 
886 aa  97.1  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  36.07 
 
 
800 aa  96.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  29.43 
 
 
635 aa  97.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  34.11 
 
 
677 aa  95.5  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3833  transglutaminase domain protein  30.2 
 
 
790 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0481829  normal  0.0321175 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4815  transglutaminase domain protein  28.81 
 
 
775 aa  92.8  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  30.18 
 
 
763 aa  91.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3572  transglutaminase domain protein  45.3 
 
 
982 aa  90.5  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0384986  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  33.15 
 
 
767 aa  89.7  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1290  transglutaminase domain-containing protein  29.02 
 
 
866 aa  89.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19935  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1334  transglutaminase domain protein  30.06 
 
 
859 aa  89  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000357459 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  38.19 
 
 
688 aa  89  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  36.73 
 
 
683 aa  89.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  37.5 
 
 
688 aa  88.2  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0581  transglutaminase-like domain-containing protein  37.5 
 
 
1238 aa  88.2  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  38.79 
 
 
730 aa  87.8  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  28.7 
 
 
709 aa  87  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  38.79 
 
 
667 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  43.52 
 
 
943 aa  86.3  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  32.31 
 
 
676 aa  85.9  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  26.75 
 
 
707 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0413  transglutaminase domain-containing protein  37.91 
 
 
507 aa  85.9  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.939018 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  34.72 
 
 
689 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  39.66 
 
 
734 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  39.66 
 
 
734 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2914  transglutaminase domain-containing protein  29.89 
 
 
769 aa  85.1  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2344  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1762  transglutaminase domain protein  27.42 
 
 
754 aa  85.1  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250515  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  36.69 
 
 
674 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  36.13 
 
 
691 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05650  Na+-driven multidrug efflux pump  35.84 
 
 
808 aa  84.7  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0960  transglutaminase-like cysteine protease  26.16 
 
 
837 aa  84.3  0.000000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8517  transglutaminase domain protein  28.76 
 
 
788 aa  84.3  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0481033 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  38.79 
 
 
739 aa  84.3  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  38.79 
 
 
739 aa  84.3  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3114  transglutaminase domain-containing protein  28.79 
 
 
784 aa  82.8  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.0170569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  34.72 
 
 
673 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  34.3 
 
 
684 aa  83.2  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  36.97 
 
 
732 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  29.54 
 
 
671 aa  82  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  32.22 
 
 
706 aa  81.6  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  26.14 
 
 
680 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  42.2 
 
 
673 aa  81.3  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  35.12 
 
 
689 aa  81.3  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  35.78 
 
 
673 aa  80.5  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>