More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1674 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  100 
 
 		 767 aa  1575    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  86.7 
 
 		 767 aa  1328    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  34.81 
 
 		 667 aa  348  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  35.1 
 
 		 683 aa  348  3e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  39.26 
 
 		 668 aa  346  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  36.16 
 
 		 662 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  34.13 
 
 		 680 aa  332  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  35.69 
 
 		 653 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  32.34 
 
 		 645 aa  321  3e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  31.38 
 
 		 732 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  35.63 
 
 		 674 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  31.62 
 
 		 689 aa  310  8e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  37.31 
 
 		 641 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  33.85 
 
 		 691 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  36.23 
 
 		 661 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  37.35 
 
 		 656 aa  305  2.0000000000000002e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  33.07 
 
 		 705 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  39.27 
 
 		 667 aa  304  5.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  36.66 
 
 		 635 aa  301  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  36.96 
 
 		 696 aa  298  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  35.3 
 
 		 681 aa  295  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  37.39 
 
 		 676 aa  294  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  37.88 
 
 		 674 aa  295  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  37.88 
 
 		 674 aa  295  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  31.3 
 
 		 715 aa  293  7e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  31.3 
 
 		 689 aa  293  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  31.35 
 
 		 715 aa  292  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  32.54 
 
 		 707 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  36.89 
 
 		 669 aa  291  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  31.73 
 
 		 680 aa  290  7e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  33.57 
 
 		 734 aa  290  8e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  33.57 
 
 		 734 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  38.75 
 
 		 671 aa  287  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  30.58 
 
 		 715 aa  286  8e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  41.32 
 
 		 662 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  32.13 
 
 		 739 aa  283  9e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  32.13 
 
 		 739 aa  283  9e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  33.91 
 
 		 673 aa  282  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  33.72 
 
 		 645 aa  280  6e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  35.6 
 
 		 730 aa  280  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  32.22 
 
 		 673 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  34.89 
 
 		 709 aa  269  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  32.39 
 
 		 684 aa  262  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  32.52 
 
 		 754 aa  260  6e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  33.75 
 
 		 685 aa  257  5e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  33.75 
 
 		 685 aa  256  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  33.16 
 
 		 689 aa  253  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  31.29 
 
 		 660 aa  249  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  36.09 
 
 		 649 aa  246  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  34.35 
 
 		 672 aa  244  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  40.31 
 
 		 943 aa  243  7e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  32.66 
 
 		 676 aa  243  9e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  27.99 
 
 		 662 aa  243  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  28.01 
 
 		 662 aa  237  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  29.01 
 
 		 687 aa  234  6e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  35.98 
 
 		 685 aa  233  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  31.59 
 
 		 688 aa  231  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 726 aa  229  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  32.28 
 
 		 688 aa  228  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  32.33 
 
 		 668 aa  226  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  30.97 
 
 		 698 aa  217  7e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  30.51 
 
 		 706 aa  191  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  28.63 
 
 		 692 aa  177  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  28.9 
 
 		 644 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  29.32 
 
 		 633 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  26.55 
 
 		 634 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  30.86 
 
 		 644 aa  164  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  27.77 
 
 		 632 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  26.05 
 
 		 637 aa  150  6e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  28.61 
 
 		 639 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  28.54 
 
 		 634 aa  148  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  26.76 
 
 		 632 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  25.77 
 
 		 631 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  25.14 
 
 		 744 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  26.27 
 
 		 730 aa  112  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  38.81 
 
 		 760 aa  103  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  29.43 
 
 		 737 aa  101  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  43.75 
 
 		 788 aa  100  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  37.16 
 
 		 812 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  37.24 
 
 		 782 aa  99.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  29.41 
 
 		 800 aa  99.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  40.15 
 
 		 806 aa  99.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  29.11 
 
 		 681 aa  99  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4603  transglutaminase domain-containing protein  24.48 
 
 		 764 aa  98.6  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  32.5 
 
 		 720 aa  98.6  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  36.03 
 
 		 790 aa  98.6  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  32.58 
 
 		 728 aa  97.8  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  27.99 
 
 		 635 aa  97.4  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  31.63 
 
 		 810 aa  97.4  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  30.8 
 
 		 763 aa  95.9  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  23.63 
 
 		 742 aa  95.1  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  30.39 
 
 		 706 aa  94.7  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  27.3 
 
 		 742 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  31.43 
 
 		 825 aa  92.8  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  23.3 
 
 		 742 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  27.76 
 
 		 886 aa  92  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  30.39 
 
 		 742 aa  92  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  26.48 
 
 		 742 aa  91.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  29.95 
 
 		 742 aa  91.7  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  29.95 
 
 		 742 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>