More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03011 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  100 
 
 		 681 aa  1331    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  79.03 
 
 		 674 aa  928    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  79.03 
 
 		 674 aa  928    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  50.31 
 
 		 671 aa  557  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  50.53 
 
 		 676 aa  548  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  40.71 
 
 		 653 aa  382  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  39.32 
 
 		 645 aa  372  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  38.02 
 
 		 662 aa  355  1e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  40.16 
 
 		 705 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  40.6 
 
 		 645 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  38.74 
 
 		 656 aa  332  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  32.61 
 
 		 674 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  35.59 
 
 		 683 aa  319  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  37.38 
 
 		 661 aa  318  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  32.31 
 
 		 691 aa  318  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  31 
 
 		 667 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  32.84 
 
 		 732 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  31.42 
 
 		 689 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  32.93 
 
 		 680 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  33.09 
 
 		 715 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  33.28 
 
 		 715 aa  302  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  32.99 
 
 		 715 aa  300  4e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  32.98 
 
 		 707 aa  300  5e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  32.9 
 
 		 734 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  32.6 
 
 		 734 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  34.64 
 
 		 689 aa  294  4e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  31.78 
 
 		 739 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  31.78 
 
 		 739 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  41.03 
 
 		 672 aa  288  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  33.54 
 
 		 767 aa  288  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  34.77 
 
 		 641 aa  287  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  34.46 
 
 		 680 aa  287  4e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  31.8 
 
 		 709 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  35.8 
 
 		 668 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  36.72 
 
 		 635 aa  283  6.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  35.52 
 
 		 696 aa  282  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  34.74 
 
 		 767 aa  278  3e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  34.83 
 
 		 673 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  35.77 
 
 		 685 aa  274  4.0000000000000004e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  34.25 
 
 		 689 aa  272  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  35.62 
 
 		 685 aa  272  1e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  34.03 
 
 		 754 aa  271  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  34.34 
 
 		 673 aa  269  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  33.73 
 
 		 669 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  40.99 
 
 		 943 aa  268  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  34.7 
 
 		 662 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  35.77 
 
 		 688 aa  266  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  36.54 
 
 		 684 aa  264  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  35.61 
 
 		 668 aa  263  8.999999999999999e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  35.88 
 
 		 676 aa  262  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  36.06 
 
 		 688 aa  263  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  34.99 
 
 		 698 aa  261  4e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  32.75 
 
 		 730 aa  256  7e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  34.3 
 
 		 667 aa  255  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  36.07 
 
 		 685 aa  248  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  36.73 
 
 		 649 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  35.05 
 
 		 726 aa  232  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  37.32 
 
 		 706 aa  218  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  32.28 
 
 		 660 aa  217  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  29.11 
 
 		 662 aa  216  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  29.51 
 
 		 662 aa  204  6e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  30.39 
 
 		 687 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  31.72 
 
 		 633 aa  184  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  30.6 
 
 		 644 aa  170  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  29.42 
 
 		 692 aa  167  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  26.07 
 
 		 634 aa  162  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  29.55 
 
 		 632 aa  161  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  29.15 
 
 		 632 aa  160  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  30.43 
 
 		 639 aa  157  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  22.79 
 
 		 631 aa  154  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  30.15 
 
 		 644 aa  145  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  25.85 
 
 		 730 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  28.98 
 
 		 744 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  29.77 
 
 		 737 aa  125  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  27.57 
 
 		 634 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  20.52 
 
 		 637 aa  106  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  31.8 
 
 		 706 aa  101  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  37.41 
 
 		 760 aa  97.8  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  30.71 
 
 		 790 aa  95.9  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1077  transglutaminase domain protein  26.44 
 
 		 770 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785713 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  25.2 
 
 		 862 aa  94  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  38.1 
 
 		 800 aa  92  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  39.85 
 
 		 812 aa  91.3  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  31.29 
 
 		 792 aa  90.5  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2905  transglutaminase domain protein  23.54 
 
 		 769 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  47.87 
 
 		 673 aa  87.8  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  36.19 
 
 		 743 aa  87  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  37.04 
 
 		 681 aa  87  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4603  transglutaminase domain-containing protein  25.91 
 
 		 764 aa  86.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  33.75 
 
 		 850 aa  86.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  27.7 
 
 		 749 aa  86.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  34.16 
 
 		 800 aa  84  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  26.98 
 
 		 742 aa  84  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  26.94 
 
 		 742 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  26.94 
 
 		 742 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  26.19 
 
 		 742 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  40.62 
 
 		 788 aa  83.2  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  33.91 
 
 		 783 aa  82.8  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  34.18 
 
 		 763 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0156  transglutaminase-like  21.36 
 
 		 799 aa  82.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.0989488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>