More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4563 on replicon NC_009035
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  72.44 
 
 
732 aa  1071    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
739 aa  1528    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  51.86 
 
 
667 aa  720    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  92.85 
 
 
707 aa  1356    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  95.95 
 
 
734 aa  1417    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  96.09 
 
 
734 aa  1420    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  51.24 
 
 
689 aa  737    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  53.4 
 
 
680 aa  708    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  71.96 
 
 
709 aa  1039    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  50.52 
 
 
730 aa  721    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  72.82 
 
 
715 aa  1058    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  72.4 
 
 
715 aa  1052    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  55.6 
 
 
691 aa  793    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  100 
 
 
739 aa  1528    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  53.76 
 
 
674 aa  753    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  72.49 
 
 
715 aa  1061    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  50.45 
 
 
689 aa  663    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  33.84 
 
 
754 aa  362  1e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  31.54 
 
 
661 aa  344  4e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  29.54 
 
 
660 aa  309  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  31.75 
 
 
681 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  31.57 
 
 
662 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  32.56 
 
 
667 aa  303  7.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  30.83 
 
 
683 aa  302  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  30.38 
 
 
641 aa  296  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  32.64 
 
 
676 aa  292  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  33.95 
 
 
767 aa  291  3e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  30.77 
 
 
656 aa  291  3e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  37.82 
 
 
668 aa  290  8e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  31.93 
 
 
767 aa  286  7e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  32.47 
 
 
671 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  34.38 
 
 
674 aa  281  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  34.38 
 
 
674 aa  281  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  27.02 
 
 
696 aa  264  4.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  32.58 
 
 
687 aa  259  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  30.54 
 
 
673 aa  246  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  34.64 
 
 
669 aa  242  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  36.62 
 
 
653 aa  239  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  29.33 
 
 
645 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  36.76 
 
 
662 aa  234  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  30.32 
 
 
698 aa  234  5e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  29.01 
 
 
688 aa  231  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  28.65 
 
 
689 aa  231  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  27.85 
 
 
673 aa  227  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  28.85 
 
 
688 aa  226  9e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  28.68 
 
 
662 aa  219  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  28.13 
 
 
635 aa  219  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  27.04 
 
 
645 aa  217  7e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  27.02 
 
 
680 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  31.84 
 
 
943 aa  212  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  26.37 
 
 
662 aa  211  3e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  29.13 
 
 
684 aa  211  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  30.24 
 
 
672 aa  210  9e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  29.34 
 
 
676 aa  209  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  26.24 
 
 
705 aa  204  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  29.21 
 
 
726 aa  190  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  27.61 
 
 
685 aa  188  3e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  27.61 
 
 
685 aa  187  5e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  28.04 
 
 
649 aa  183  9.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  28.1 
 
 
685 aa  169  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  28.73 
 
 
668 aa  160  8e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  37.1 
 
 
706 aa  145  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  23 
 
 
692 aa  144  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  28.93 
 
 
644 aa  125  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  26.16 
 
 
639 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  37.82 
 
 
760 aa  114  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  26.22 
 
 
633 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  34.34 
 
 
634 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  30.73 
 
 
644 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  27.56 
 
 
632 aa  104  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  25.93 
 
 
637 aa  103  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  31.06 
 
 
632 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  43 
 
 
790 aa  99  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2905  transglutaminase domain protein  26.22 
 
 
769 aa  97.4  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3693  transglutaminase domain protein  22.74 
 
 
768 aa  97.4  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  22.69 
 
 
634 aa  97.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  39.23 
 
 
800 aa  96.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  29.39 
 
 
744 aa  95.9  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  25.51 
 
 
631 aa  95.5  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  26.97 
 
 
681 aa  95.5  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  42.73 
 
 
737 aa  94  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  25.07 
 
 
795 aa  92.4  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1077  transglutaminase domain protein  29.23 
 
 
770 aa  91.3  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  23.08 
 
 
730 aa  89.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  36.3 
 
 
815 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  48.31 
 
 
890 aa  88.6  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  40 
 
 
862 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  36.15 
 
 
782 aa  87  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
800 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3747  transglutaminase domain protein  22.84 
 
 
768 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664376  normal  0.434261 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  37.88 
 
 
806 aa  85.1  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0581  transglutaminase-like domain-containing protein  25.71 
 
 
1238 aa  84.7  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  26.47 
 
 
826 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  38.79 
 
 
763 aa  82.4  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  32.29 
 
 
810 aa  82  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  35.51 
 
 
788 aa  81.6  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  22.01 
 
 
742 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  22.01 
 
 
742 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  38.02 
 
 
815 aa  80.1  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  34.4 
 
 
763 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>