More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1683 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 673 aa  1214    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  38.81 
 
 		 706 aa  169  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  27.11 
 
 		 742 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  26.7 
 
 		 683 aa  120  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  30.25 
 
 		 728 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  30.58 
 
 		 720 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  26.98 
 
 		 742 aa  118  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  26.98 
 
 		 742 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  34.56 
 
 		 649 aa  117  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  27.44 
 
 		 742 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  27.11 
 
 		 742 aa  115  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  27.11 
 
 		 742 aa  115  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  27.44 
 
 		 742 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  40.96 
 
 		 862 aa  114  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  26.76 
 
 		 742 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 763 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  27.64 
 
 		 681 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  26.35 
 
 		 742 aa  111  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  31.06 
 
 		 840 aa  111  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  26.41 
 
 		 635 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  32.01 
 
 		 790 aa  110  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  28.33 
 
 		 744 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  33.21 
 
 		 635 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  34.62 
 
 		 737 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  27.62 
 
 		 645 aa  106  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  42.33 
 
 		 725 aa  107  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  34.22 
 
 		 685 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  34.6 
 
 		 685 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  28.72 
 
 		 754 aa  105  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  34.56 
 
 		 825 aa  105  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  31.91 
 
 		 730 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  31.21 
 
 		 774 aa  104  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  24.61 
 
 		 634 aa  104  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  29.7 
 
 		 653 aa  104  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  41.79 
 
 		 730 aa  104  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  30.07 
 
 		 680 aa  103  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  41.78 
 
 		 677 aa  103  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  29.05 
 
 		 705 aa  102  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  26.47 
 
 		 662 aa  102  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  30.64 
 
 		 645 aa  101  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1077  transglutaminase domain protein  30 
 
 		 770 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785713 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  24.38 
 
 		 662 aa  100  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  27.67 
 
 		 633 aa  99.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  30.68 
 
 		 672 aa  100  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  42.96 
 
 		 815 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  31.52 
 
 		 680 aa  99  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  33.33 
 
 		 669 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  42.96 
 
 		 826 aa  98.6  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2535  transglutaminase domain protein  32.17 
 
 		 748 aa  99  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  32.97 
 
 		 696 aa  98.6  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  30.53 
 
 		 644 aa  97.8  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  33.96 
 
 		 662 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  33.82 
 
 		 673 aa  97.8  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  24.88 
 
 		 662 aa  97.4  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  39.57 
 
 		 667 aa  97.4  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  37.23 
 
 		 760 aa  97.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  26.57 
 
 		 767 aa  97.1  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1473  transglutaminase-like  27.14 
 
 		 753 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.647705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  42.25 
 
 		 684 aa  96.3  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2905  transglutaminase domain protein  27.24 
 
 		 769 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  26.87 
 
 		 767 aa  95.9  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  26.42 
 
 		 656 aa  95.9  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  38.67 
 
 		 790 aa  96.3  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  31.73 
 
 		 641 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  29.38 
 
 		 736 aa  95.5  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  30.47 
 
 		 681 aa  95.1  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  27.61 
 
 		 800 aa  95.1  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  27.08 
 
 		 812 aa  95.1  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  31.82 
 
 		 661 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  30.56 
 
 		 850 aa  94.7  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  33.46 
 
 		 943 aa  94.4  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  33.09 
 
 		 749 aa  94  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  32.5 
 
 		 673 aa  93.6  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  33.46 
 
 		 810 aa  93.2  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  35.94 
 
 		 763 aa  93.2  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  31.11 
 
 		 668 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  35.71 
 
 		 890 aa  92.8  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  29.57 
 
 		 762 aa  92.8  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  29.19 
 
 		 632 aa  92.8  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  29.96 
 
 		 800 aa  92  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  25.06 
 
 		 689 aa  92.4  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0440  transglutaminase domain protein  34.69 
 
 		 748 aa  92  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  29.5 
 
 		 687 aa  91.7  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  28.37 
 
 		 632 aa  91.3  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  32.51 
 
 		 676 aa  89.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  38.24 
 
 		 691 aa  90.1  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  50 
 
 		 668 aa  89.4  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  42.86 
 
 		 698 aa  89.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0156  transglutaminase-like  25.36 
 
 		 799 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.0989488 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  30.66 
 
 		 806 aa  89.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  45.05 
 
 		 676 aa  88.6  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  40.8 
 
 		 689 aa  88.2  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  41.96 
 
 		 706 aa  87.8  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  32.39 
 
 		 886 aa  87.8  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3693  transglutaminase domain protein  22.8 
 
 		 768 aa  87.4  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  28.18 
 
 		 674 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  28.18 
 
 		 674 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  31.94 
 
 		 688 aa  86.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3747  transglutaminase domain protein  22.8 
 
 		 768 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664376  normal  0.434261 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  26.3 
 
 		 674 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>