More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2128 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  56.99 
 
 		 732 aa  763    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  54.05 
 
 		 689 aa  758    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  54.09 
 
 		 734 aa  722    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  59.13 
 
 		 674 aa  800    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  59.1 
 
 		 667 aa  796    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  52.59 
 
 		 734 aa  723    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  53.94 
 
 		 709 aa  723    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  49.38 
 
 		 730 aa  664    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  57.1 
 
 		 715 aa  759    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  56.95 
 
 		 715 aa  758    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  54.6 
 
 		 691 aa  759    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 680 aa  1382    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  55.31 
 
 		 707 aa  736    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  51.94 
 
 		 739 aa  717    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  57.1 
 
 		 715 aa  758    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  51.94 
 
 		 739 aa  717    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  52.97 
 
 		 689 aa  675    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  35.46 
 
 		 754 aa  413  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  36.38 
 
 		 641 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  36.6 
 
 		 668 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  36.32 
 
 		 669 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  35.76 
 
 		 661 aa  381  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  39.16 
 
 		 662 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  36.62 
 
 		 667 aa  353  8e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  34.53 
 
 		 660 aa  350  7e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  34.73 
 
 		 653 aa  348  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  33.9 
 
 		 662 aa  345  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  32.49 
 
 		 683 aa  342  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  33.53 
 
 		 696 aa  325  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  32.35 
 
 		 767 aa  323  6e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  33.82 
 
 		 767 aa  321  3e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  32.86 
 
 		 705 aa  318  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  32.55 
 
 		 656 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  32.12 
 
 		 681 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  32.18 
 
 		 671 aa  300  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  31.23 
 
 		 645 aa  294  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  32.59 
 
 		 687 aa  292  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  34.33 
 
 		 676 aa  291  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  35.4 
 
 		 674 aa  273  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  35.4 
 
 		 674 aa  273  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  31.17 
 
 		 645 aa  270  8e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  30.19 
 
 		 662 aa  264  4.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  33.57 
 
 		 673 aa  262  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  29.71 
 
 		 662 aa  254  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  31.92 
 
 		 688 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  30.38 
 
 		 680 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  30.61 
 
 		 698 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  31.75 
 
 		 688 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  30.09 
 
 		 673 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  29.94 
 
 		 689 aa  237  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  32.05 
 
 		 635 aa  237  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  31.13 
 
 		 676 aa  236  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  30.67 
 
 		 684 aa  229  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  31.1 
 
 		 649 aa  227  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  32.55 
 
 		 672 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  34.45 
 
 		 943 aa  223  9e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  32.68 
 
 		 726 aa  219  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  32.86 
 
 		 668 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  32.83 
 
 		 706 aa  215  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  31.78 
 
 		 685 aa  214  5.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  32.16 
 
 		 685 aa  213  7e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  30.99 
 
 		 685 aa  202  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  23.7 
 
 		 634 aa  171  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  29.43 
 
 		 633 aa  163  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  28.21 
 
 		 632 aa  162  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  25.47 
 
 		 644 aa  161  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  29.08 
 
 		 632 aa  160  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  28.84 
 
 		 639 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  25.36 
 
 		 692 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  23.86 
 
 		 637 aa  145  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  25.83 
 
 		 631 aa  144  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  26.62 
 
 		 644 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  25.34 
 
 		 730 aa  128  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  24.52 
 
 		 744 aa  127  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  25.84 
 
 		 634 aa  125  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  39.22 
 
 		 760 aa  110  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  31.23 
 
 		 737 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  31.45 
 
 		 800 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  33.15 
 
 		 862 aa  105  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4603  transglutaminase domain-containing protein  22.28 
 
 		 764 aa  103  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  25.62 
 
 		 815 aa  100  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  29.94 
 
 		 681 aa  99.4  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  27.62 
 
 		 706 aa  96.7  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  25.74 
 
 		 790 aa  96.3  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  29.04 
 
 		 749 aa  92.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  29.29 
 
 		 825 aa  92  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  37.88 
 
 		 782 aa  92  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  24.89 
 
 		 728 aa  90.9  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  30.91 
 
 		 673 aa  90.5  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  24.37 
 
 		 742 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  22.78 
 
 		 742 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  28.46 
 
 		 812 aa  88.6  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  29.12 
 
 		 788 aa  87.8  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  30.1 
 
 		 810 aa  86.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  23.68 
 
 		 742 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  24.23 
 
 		 742 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  37.4 
 
 		 890 aa  85.1  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  24.23 
 
 		 742 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  23.65 
 
 		 635 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  24.86 
 
 		 730 aa  84.3  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>