More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0466 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  100 
 
 
705 aa  1395    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  41.55 
 
 
662 aa  467  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  39.4 
 
 
653 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  40.31 
 
 
645 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  41.34 
 
 
656 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  38.46 
 
 
645 aa  355  1e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  38.1 
 
 
680 aa  352  1e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  40 
 
 
681 aa  350  5e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  39.06 
 
 
661 aa  342  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  33.19 
 
 
683 aa  338  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  36.61 
 
 
671 aa  338  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  37.26 
 
 
668 aa  337  7e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  37.24 
 
 
641 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  39.53 
 
 
662 aa  329  8e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  34.15 
 
 
689 aa  317  5e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  33.17 
 
 
680 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  32.03 
 
 
674 aa  312  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  36.43 
 
 
669 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  38.54 
 
 
674 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  38.54 
 
 
674 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  36.53 
 
 
676 aa  306  7e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  34.84 
 
 
696 aa  306  9.000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  32.75 
 
 
732 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  30.93 
 
 
667 aa  296  9e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  36.12 
 
 
673 aa  295  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  37.32 
 
 
684 aa  291  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  37.29 
 
 
635 aa  291  4e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  39.38 
 
 
672 aa  283  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  34.09 
 
 
689 aa  279  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  31.1 
 
 
707 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  35.44 
 
 
673 aa  277  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  32.37 
 
 
767 aa  276  8e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  32.86 
 
 
767 aa  276  9e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  30.8 
 
 
715 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  30.22 
 
 
715 aa  273  7e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  29.91 
 
 
715 aa  273  9e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  34.12 
 
 
668 aa  272  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  28.75 
 
 
691 aa  272  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  30.21 
 
 
734 aa  271  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  30.21 
 
 
734 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  32.36 
 
 
689 aa  268  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  37.92 
 
 
943 aa  267  5e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  34.24 
 
 
698 aa  265  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  33.29 
 
 
667 aa  263  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  29.99 
 
 
709 aa  262  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  35.77 
 
 
649 aa  257  5e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  34.92 
 
 
676 aa  256  7e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  28.91 
 
 
660 aa  256  9e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  34.6 
 
 
688 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  34.45 
 
 
688 aa  252  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  28.63 
 
 
730 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  29.74 
 
 
754 aa  242  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  36.65 
 
 
706 aa  240  6.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  26.12 
 
 
662 aa  238  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  33.51 
 
 
685 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  35.19 
 
 
726 aa  235  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  33.51 
 
 
685 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  35.73 
 
 
685 aa  231  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  29.46 
 
 
692 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  26.2 
 
 
662 aa  223  8e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  32.35 
 
 
739 aa  208  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  32.35 
 
 
739 aa  208  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  30.71 
 
 
687 aa  199  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  28.39 
 
 
644 aa  174  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  27.77 
 
 
633 aa  169  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  26.18 
 
 
634 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  22.71 
 
 
631 aa  151  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  28.87 
 
 
632 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  28.52 
 
 
632 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  28.03 
 
 
644 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  30.23 
 
 
639 aa  140  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  26.41 
 
 
730 aa  127  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  30.69 
 
 
634 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  24.33 
 
 
637 aa  113  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  33.81 
 
 
737 aa  107  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  29.58 
 
 
790 aa  100  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  44.08 
 
 
800 aa  97.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  23.23 
 
 
744 aa  97.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  36.42 
 
 
681 aa  96.3  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  36.5 
 
 
800 aa  92.8  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  29.16 
 
 
706 aa  93.2  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  25.96 
 
 
806 aa  89.7  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  29.41 
 
 
763 aa  89  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  41.67 
 
 
788 aa  85.5  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4603  transglutaminase domain-containing protein  45.56 
 
 
764 aa  85.1  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  30.48 
 
 
728 aa  84.3  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  46.6 
 
 
792 aa  83.2  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  30.62 
 
 
826 aa  81.6  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  38.26 
 
 
760 aa  80.9  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  36.57 
 
 
812 aa  80.1  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  30.46 
 
 
730 aa  80.1  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  47.13 
 
 
673 aa  80.5  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  38.69 
 
 
782 aa  79.7  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  31.49 
 
 
815 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3747  transglutaminase domain protein  25.83 
 
 
768 aa  78.2  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664376  normal  0.434261 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0156  transglutaminase-like  23.4 
 
 
799 aa  78.2  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.0989488 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  25.84 
 
 
862 aa  77.8  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  35.38 
 
 
825 aa  77.4  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  37.96 
 
 
810 aa  77  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  36.08 
 
 
850 aa  75.9  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>