248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3275 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
634 aa  1298    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  35.29 
 
 
631 aa  343  4e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  33.8 
 
 
644 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  31.84 
 
 
644 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  33.9 
 
 
632 aa  280  8e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  33.64 
 
 
632 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  32.37 
 
 
633 aa  274  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  32.42 
 
 
634 aa  253  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  31.96 
 
 
639 aa  239  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  28.67 
 
 
645 aa  198  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  28.18 
 
 
662 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  27.24 
 
 
683 aa  194  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  29.3 
 
 
637 aa  188  2e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  26.67 
 
 
730 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  26.54 
 
 
673 aa  182  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  27.52 
 
 
674 aa  174  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  27.66 
 
 
645 aa  174  5.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  28.23 
 
 
676 aa  167  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  29.47 
 
 
661 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  31.64 
 
 
943 aa  165  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  26.88 
 
 
684 aa  165  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  25.27 
 
 
680 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  27.94 
 
 
656 aa  164  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  26.07 
 
 
681 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  26.41 
 
 
667 aa  161  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  26.18 
 
 
705 aa  160  9e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  28.76 
 
 
653 aa  160  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  26.71 
 
 
730 aa  159  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  29.21 
 
 
668 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  26.45 
 
 
744 aa  159  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  25.33 
 
 
691 aa  158  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  27.7 
 
 
767 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  27.76 
 
 
641 aa  157  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  28.82 
 
 
662 aa  156  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  26.55 
 
 
767 aa  156  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  29.74 
 
 
662 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  29.27 
 
 
662 aa  154  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  26.21 
 
 
689 aa  154  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  28.09 
 
 
698 aa  154  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  24.52 
 
 
689 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  25.97 
 
 
685 aa  152  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  25.97 
 
 
685 aa  151  4e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  26.37 
 
 
732 aa  150  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  27.12 
 
 
671 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  26.77 
 
 
688 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  26.77 
 
 
688 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  27.35 
 
 
674 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  27.35 
 
 
674 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  25.59 
 
 
680 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  28.92 
 
 
669 aa  147  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  25.66 
 
 
676 aa  146  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  25.88 
 
 
689 aa  144  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  25.86 
 
 
649 aa  140  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  31 
 
 
707 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  27.95 
 
 
667 aa  139  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  27.34 
 
 
635 aa  138  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  26.23 
 
 
660 aa  139  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  24.5 
 
 
715 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  24.34 
 
 
715 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  25.58 
 
 
673 aa  136  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  24.31 
 
 
685 aa  136  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  23.49 
 
 
715 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  24.45 
 
 
696 aa  134  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  25.44 
 
 
709 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  27.12 
 
 
706 aa  130  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  27.37 
 
 
726 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1293  transglutaminase domain protein  24.84 
 
 
803 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269788  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  24.39 
 
 
754 aa  126  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  25.89 
 
 
672 aa  120  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  35.86 
 
 
734 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  35.86 
 
 
734 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  34.34 
 
 
739 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  34.34 
 
 
739 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  30.48 
 
 
681 aa  112  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  24.61 
 
 
687 aa  109  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  37.09 
 
 
790 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  27.76 
 
 
668 aa  108  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  29.89 
 
 
800 aa  108  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  30.45 
 
 
763 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  40.94 
 
 
730 aa  105  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  42.22 
 
 
788 aa  103  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  30.42 
 
 
692 aa  99.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  37.5 
 
 
815 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  32.06 
 
 
762 aa  99  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  41.18 
 
 
782 aa  98.2  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  39.55 
 
 
812 aa  96.3  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2905  transglutaminase domain protein  37.24 
 
 
769 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  35.07 
 
 
862 aa  95.5  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  29.77 
 
 
737 aa  95.5  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  29.27 
 
 
728 aa  94.4  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  30.12 
 
 
736 aa  93.2  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  37.43 
 
 
792 aa  92.4  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  38.24 
 
 
800 aa  91.3  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  36.03 
 
 
826 aa  90.5  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  33.57 
 
 
742 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  33.57 
 
 
742 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  35 
 
 
742 aa  88.2  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  35 
 
 
742 aa  88.2  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4603  transglutaminase domain-containing protein  29.25 
 
 
764 aa  88.2  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  35 
 
 
742 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>