More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1212 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  100 
 
 		 685 aa  1389    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  99.85 
 
 		 685 aa  1387    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  60.89 
 
 		 635 aa  697    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  57 
 
 		 649 aa  620  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  35.93 
 
 		 645 aa  323  6e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  35.88 
 
 		 662 aa  319  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  34.93 
 
 		 656 aa  282  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  34.25 
 
 		 680 aa  280  4e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  35.36 
 
 		 681 aa  273  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  35.41 
 
 		 653 aa  264  4e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  34.78 
 
 		 689 aa  263  8.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  34.27 
 
 		 645 aa  260  6e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  34.51 
 
 		 668 aa  255  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  36.21 
 
 		 674 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  36.21 
 
 		 674 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  34.18 
 
 		 673 aa  249  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  37.03 
 
 		 676 aa  248  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  32 
 
 		 767 aa  244  3e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  33.75 
 
 		 767 aa  242  1e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  34.88 
 
 		 705 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  32.53 
 
 		 667 aa  233  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  33.28 
 
 		 673 aa  232  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  35.1 
 
 		 688 aa  232  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  34.67 
 
 		 671 aa  231  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  30.57 
 
 		 683 aa  230  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  34.88 
 
 		 688 aa  231  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  35.03 
 
 		 943 aa  224  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  32.96 
 
 		 698 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  34.87 
 
 		 684 aa  223  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  36.84 
 
 		 672 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  33.86 
 
 		 676 aa  222  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  29.19 
 
 		 662 aa  221  3e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  36.45 
 
 		 726 aa  219  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  32.27 
 
 		 641 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  31.73 
 
 		 680 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  28.24 
 
 		 689 aa  213  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  28.35 
 
 		 674 aa  212  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  30.48 
 
 		 661 aa  210  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  28.81 
 
 		 662 aa  209  9e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  30.72 
 
 		 732 aa  209  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  28.59 
 
 		 691 aa  206  8e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  31.05 
 
 		 668 aa  203  9e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  31.02 
 
 		 696 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  30.28 
 
 		 689 aa  201  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  27.55 
 
 		 667 aa  201  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  28.44 
 
 		 715 aa  201  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  28.13 
 
 		 715 aa  200  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  38.13 
 
 		 685 aa  198  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  27.98 
 
 		 715 aa  198  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  30.54 
 
 		 730 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  29.75 
 
 		 669 aa  196  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  30.9 
 
 		 709 aa  194  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  29.83 
 
 		 754 aa  194  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  30.25 
 
 		 707 aa  193  8e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  29.63 
 
 		 734 aa  187  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  29.63 
 
 		 734 aa  187  8e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  33.82 
 
 		 706 aa  185  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  30.18 
 
 		 660 aa  183  8.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  33.26 
 
 		 662 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  28.1 
 
 		 739 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  28.1 
 
 		 739 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  27.08 
 
 		 692 aa  160  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  27.97 
 
 		 633 aa  158  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  25.97 
 
 		 634 aa  151  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  28.26 
 
 		 644 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  30.15 
 
 		 644 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  22.37 
 
 		 631 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  27.3 
 
 		 744 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  26.68 
 
 		 687 aa  124  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  29.66 
 
 		 639 aa  123  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  33.01 
 
 		 632 aa  117  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  29.73 
 
 		 632 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  25.75 
 
 		 634 aa  110  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  25 
 
 		 730 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  23.28 
 
 		 637 aa  102  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  33.21 
 
 		 812 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  29 
 
 		 737 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  49 
 
 		 673 aa  96.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  37.13 
 
 		 782 aa  95.9  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  30.29 
 
 		 706 aa  95.1  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27440  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  41.58 
 
 		 859 aa  92.4  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  29.38 
 
 		 825 aa  91.3  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  29.26 
 
 		 886 aa  90.1  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3214  transglutaminase domain protein  44.04 
 
 		 788 aa  89.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.257235  normal  0.234323 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  22.19 
 
 		 742 aa  87.4  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  22.19 
 
 		 742 aa  87.4  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  22.78 
 
 		 742 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  38.73 
 
 		 763 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  22.19 
 
 		 742 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  22.19 
 
 		 742 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  22.58 
 
 		 742 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  22.19 
 
 		 635 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  21.99 
 
 		 742 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4603  transglutaminase domain-containing protein  26.34 
 
 		 764 aa  85.1  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  36.5 
 
 		 790 aa  85.1  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  23.12 
 
 		 742 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  33.99 
 
 		 800 aa  84  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  36 
 
 		 736 aa  83.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  39.18 
 
 		 681 aa  83.6  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  33.63 
 
 		 800 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>