More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3856 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  79.03 
 
 		 681 aa  996    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 674 aa  1321    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 674 aa  1321    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  52.63 
 
 		 671 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  51.93 
 
 		 676 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  39.43 
 
 		 645 aa  391  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  39.87 
 
 		 653 aa  375  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  41.42 
 
 		 645 aa  340  5e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  37.31 
 
 		 662 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  38.63 
 
 		 661 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  38.01 
 
 		 705 aa  327  6e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  38.56 
 
 		 656 aa  320  3.9999999999999996e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  32.58 
 
 		 691 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  36.87 
 
 		 668 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  33.13 
 
 		 674 aa  296  9e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  33.28 
 
 		 683 aa  295  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  31.69 
 
 		 689 aa  294  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  36.7 
 
 		 641 aa  293  5e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  37.2 
 
 		 767 aa  293  6e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  32.7 
 
 		 732 aa  293  7e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  31.1 
 
 		 667 aa  293  7e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  33.43 
 
 		 707 aa  293  9e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  33.48 
 
 		 715 aa  292  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  33.24 
 
 		 715 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  37.67 
 
 		 635 aa  289  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  33.09 
 
 		 715 aa  289  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  32.58 
 
 		 734 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  36.71 
 
 		 662 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  41.74 
 
 		 943 aa  287  5e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  32.44 
 
 		 734 aa  287  5e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  32.7 
 
 		 680 aa  286  9e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  36.62 
 
 		 767 aa  285  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  31.02 
 
 		 739 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  31.02 
 
 		 739 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  34.21 
 
 		 680 aa  283  7.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  34.65 
 
 		 689 aa  280  8e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  36.15 
 
 		 669 aa  273  9e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  40.26 
 
 		 672 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  37.52 
 
 		 676 aa  270  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  36.38 
 
 		 709 aa  270  8.999999999999999e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  33.76 
 
 		 754 aa  269  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  35.4 
 
 		 667 aa  267  5e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  35.07 
 
 		 696 aa  266  5.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  35.11 
 
 		 684 aa  266  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  35.73 
 
 		 688 aa  266  8.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  36.03 
 
 		 688 aa  266  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  33.99 
 
 		 673 aa  265  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  34.6 
 
 		 685 aa  263  8.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  35.24 
 
 		 673 aa  262  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  36.34 
 
 		 730 aa  263  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  34.45 
 
 		 685 aa  261  3e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  34.95 
 
 		 689 aa  259  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  37.67 
 
 		 685 aa  255  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  36.89 
 
 		 649 aa  251  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  36.21 
 
 		 668 aa  246  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  33.69 
 
 		 698 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  35.03 
 
 		 726 aa  224  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  31.46 
 
 		 660 aa  218  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  27.64 
 
 		 662 aa  213  7e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  37.75 
 
 		 706 aa  207  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  27.01 
 
 		 662 aa  205  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  31.24 
 
 		 687 aa  186  9e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  31.12 
 
 		 633 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  29.29 
 
 		 692 aa  169  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  27.49 
 
 		 634 aa  162  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  30.31 
 
 		 632 aa  158  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  29.22 
 
 		 632 aa  154  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  30.47 
 
 		 644 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  32.26 
 
 		 639 aa  152  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  23.87 
 
 		 631 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  29.54 
 
 		 644 aa  139  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  28.04 
 
 		 730 aa  128  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  28.05 
 
 		 634 aa  123  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  26.84 
 
 		 744 aa  122  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  29.53 
 
 		 737 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  21.18 
 
 		 637 aa  102  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  31.07 
 
 		 706 aa  99  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  36.3 
 
 		 760 aa  97.4  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  29.07 
 
 		 850 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2905  transglutaminase domain protein  25.86 
 
 		 769 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  28.46 
 
 		 742 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  21.46 
 
 		 742 aa  89.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  28.52 
 
 		 677 aa  89  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  29.93 
 
 		 790 aa  89.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  24.5 
 
 		 635 aa  89  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  28.46 
 
 		 742 aa  88.6  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  38.1 
 
 		 800 aa  88.6  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  28.46 
 
 		 742 aa  87.8  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  24.23 
 
 		 742 aa  87.8  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  28.46 
 
 		 742 aa  87.8  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3693  transglutaminase domain protein  22.31 
 
 		 768 aa  87.4  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  28.99 
 
 		 788 aa  87  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  30.86 
 
 		 681 aa  86.7  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  24.23 
 
 		 742 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  37.75 
 
 		 812 aa  85.1  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1077  transglutaminase domain protein  29.59 
 
 		 770 aa  85.1  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785713 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3747  transglutaminase domain protein  22.31 
 
 		 768 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664376  normal  0.434261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  45.74 
 
 		 673 aa  84.3  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  24.19 
 
 		 742 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1473  transglutaminase-like  26.25 
 
 		 753 aa  83.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.647705  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>