289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3938 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  100 
 
 
743 aa  1443    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  34.87 
 
 
827 aa  312  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  35.38 
 
 
815 aa  252  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  31.45 
 
 
850 aa  200  6e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  31.33 
 
 
792 aa  185  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  31.95 
 
 
762 aa  182  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  30.09 
 
 
822 aa  174  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  31.69 
 
 
818 aa  173  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  30.52 
 
 
810 aa  171  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  27.7 
 
 
846 aa  171  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1208  transglutaminase domain-containing protein  28.65 
 
 
831 aa  170  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  27.42 
 
 
794 aa  168  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  30.21 
 
 
800 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  29.26 
 
 
788 aa  155  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  33.66 
 
 
763 aa  150  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  28.85 
 
 
825 aa  140  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  28.35 
 
 
914 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  29.79 
 
 
798 aa  134  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  27.12 
 
 
790 aa  134  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  29.4 
 
 
771 aa  128  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  39.3 
 
 
744 aa  118  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  34.56 
 
 
725 aa  117  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  31.85 
 
 
790 aa  114  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  42.97 
 
 
774 aa  108  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  30.2 
 
 
720 aa  107  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  43.41 
 
 
730 aa  104  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  33.46 
 
 
840 aa  103  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  30.83 
 
 
862 aa  103  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  32.58 
 
 
656 aa  101  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  27.17 
 
 
742 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  37.35 
 
 
736 aa  99  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27440  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  43.7 
 
 
859 aa  98.6  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  30 
 
 
790 aa  97.4  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  25.14 
 
 
742 aa  97.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  33.95 
 
 
681 aa  95.5  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  27.43 
 
 
728 aa  95.1  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  34.71 
 
 
749 aa  95.1  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  25.87 
 
 
742 aa  94  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0581  transglutaminase-like domain-containing protein  43.07 
 
 
1238 aa  92.8  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2535  transglutaminase domain protein  35.5 
 
 
748 aa  92.8  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  39.86 
 
 
730 aa  92.8  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  24.42 
 
 
742 aa  92  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  25 
 
 
742 aa  92  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  24.42 
 
 
742 aa  92  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  26.23 
 
 
742 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  35.71 
 
 
800 aa  90.9  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  28.25 
 
 
742 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1333  transglutaminase domain protein  28.71 
 
 
762 aa  90.1  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135993  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  25.07 
 
 
635 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1290  transglutaminase domain-containing protein  27.74 
 
 
866 aa  90.1  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19935  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  25.62 
 
 
890 aa  89.7  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  33.73 
 
 
812 aa  89  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3572  transglutaminase domain protein  44.72 
 
 
982 aa  88.6  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0384986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 
742 aa  88.6  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  38.79 
 
 
783 aa  88.2  6e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  35.11 
 
 
681 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  38.99 
 
 
677 aa  87  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  31.28 
 
 
676 aa  87  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  39.71 
 
 
668 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  31.52 
 
 
688 aa  85.9  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  37.41 
 
 
715 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1334  transglutaminase domain protein  29.35 
 
 
859 aa  85.5  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000357459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  38.46 
 
 
653 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  35.5 
 
 
689 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  37.82 
 
 
760 aa  85.1  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  37.09 
 
 
661 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  46.15 
 
 
943 aa  84.7  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  36.65 
 
 
668 aa  84.3  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3804  transglutaminase domain-containing protein  30.77 
 
 
820 aa  84  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  41.04 
 
 
669 aa  84.3  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  37.5 
 
 
763 aa  84.3  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  30.98 
 
 
688 aa  84  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  33.33 
 
 
730 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  42.86 
 
 
674 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  35.54 
 
 
826 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  47.73 
 
 
706 aa  84  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  42.86 
 
 
674 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  36.53 
 
 
815 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  36.69 
 
 
715 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  36.76 
 
 
715 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3833  transglutaminase domain protein  25.26 
 
 
790 aa  82  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0481829  normal  0.0321175 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  35.71 
 
 
732 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  44.57 
 
 
662 aa  81.3  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  36.96 
 
 
737 aa  80.9  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  44.09 
 
 
726 aa  80.9  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  30 
 
 
691 aa  80.9  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  36.44 
 
 
806 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3114  transglutaminase domain-containing protein  32.26 
 
 
784 aa  80.5  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.0170569 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  39.06 
 
 
671 aa  80.5  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  39.66 
 
 
673 aa  80.1  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  40.68 
 
 
641 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  27.49 
 
 
667 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  40.95 
 
 
706 aa  79.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  42.86 
 
 
635 aa  79  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  37.7 
 
 
662 aa  79  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  42.39 
 
 
662 aa  78.6  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  32.8 
 
 
886 aa  78.6  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  47.83 
 
 
685 aa  78.6  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  29.15 
 
 
767 aa  78.6  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  47.83 
 
 
685 aa  78.6  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>