207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1208 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1208  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
831 aa  1640    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  62.81 
 
 
846 aa  954    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  31.68 
 
 
762 aa  241  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  31.52 
 
 
800 aa  230  8e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  29.86 
 
 
790 aa  226  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  29.72 
 
 
812 aa  222  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  30.6 
 
 
850 aa  213  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  30.52 
 
 
825 aa  211  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  31.33 
 
 
810 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  32.27 
 
 
763 aa  204  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  33.12 
 
 
798 aa  189  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  28.68 
 
 
788 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  28.77 
 
 
725 aa  163  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  26.1 
 
 
794 aa  157  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  30.29 
 
 
827 aa  155  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  26.83 
 
 
783 aa  154  8e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  28.39 
 
 
743 aa  152  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  29.33 
 
 
914 aa  149  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  30.08 
 
 
771 aa  140  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  33.04 
 
 
790 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  29.79 
 
 
822 aa  123  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  27.53 
 
 
792 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  28.93 
 
 
862 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  29.17 
 
 
818 aa  120  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  29.39 
 
 
890 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  33.73 
 
 
790 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3804  transglutaminase domain-containing protein  29.62 
 
 
820 aa  114  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  27.73 
 
 
720 aa  115  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  29.54 
 
 
774 aa  111  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  28.57 
 
 
840 aa  110  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  34.26 
 
 
744 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  29.34 
 
 
736 aa  108  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  33.11 
 
 
737 aa  107  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  27.07 
 
 
728 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  27.38 
 
 
635 aa  104  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27440  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  28.57 
 
 
859 aa  103  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  38.79 
 
 
681 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  27.22 
 
 
742 aa  101  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  25.87 
 
 
742 aa  100  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  27.05 
 
 
742 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  32.72 
 
 
760 aa  98.6  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  26.83 
 
 
742 aa  97.8  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  25 
 
 
730 aa  97.8  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  31.67 
 
 
800 aa  97.4  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  27.24 
 
 
742 aa  97.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  27.24 
 
 
742 aa  97.4  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  26.52 
 
 
742 aa  95.9  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  25.56 
 
 
742 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  34.76 
 
 
795 aa  92.4  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  27.3 
 
 
749 aa  92  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  29.27 
 
 
742 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5534  transglutaminase domain protein  27 
 
 
753 aa  89  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0283272  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2914  transglutaminase domain-containing protein  28.32 
 
 
769 aa  88.6  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2344  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  39.86 
 
 
826 aa  87.4  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  33.55 
 
 
730 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  32.9 
 
 
806 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3833  transglutaminase domain protein  32.27 
 
 
790 aa  85.1  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0481829  normal  0.0321175 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  33.89 
 
 
815 aa  84  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0960  transglutaminase-like cysteine protease  31.41 
 
 
837 aa  83.2  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3114  transglutaminase domain-containing protein  29.24 
 
 
784 aa  83.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.0170569 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0413  transglutaminase domain-containing protein  36.42 
 
 
507 aa  82.8  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.939018 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0581  transglutaminase-like domain-containing protein  36.88 
 
 
1238 aa  82  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4815  transglutaminase domain protein  32.89 
 
 
775 aa  82  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8517  transglutaminase domain protein  29.18 
 
 
788 aa  81.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0481033 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0440  transglutaminase domain protein  25.41 
 
 
748 aa  80.9  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1334  transglutaminase domain protein  24.2 
 
 
859 aa  80.9  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000357459 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2535  transglutaminase domain protein  25.62 
 
 
748 aa  79.7  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0156  transglutaminase-like  26.16 
 
 
799 aa  80.1  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.973257  normal  0.0989488 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  23.97 
 
 
662 aa  79  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2905  transglutaminase domain protein  31.33 
 
 
769 aa  78.2  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  30.54 
 
 
677 aa  77.4  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  28.8 
 
 
754 aa  76.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  30.81 
 
 
689 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1198  transglutaminase domain-containing protein  26.49 
 
 
491 aa  76.6  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.135202  normal  0.356317 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  26.42 
 
 
886 aa  75.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  23.77 
 
 
662 aa  75.1  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05650  Na+-driven multidrug efflux pump  30.38 
 
 
808 aa  75.1  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  27.06 
 
 
689 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  24.02 
 
 
634 aa  74.3  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  26.43 
 
 
680 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  35 
 
 
635 aa  73.9  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3214  transglutaminase domain protein  38.4 
 
 
788 aa  72.8  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.257235  normal  0.234323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  32.88 
 
 
767 aa  73.2  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1762  transglutaminase domain protein  30 
 
 
754 aa  72.4  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250515  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  33.83 
 
 
732 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  35.96 
 
 
667 aa  72  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  35.96 
 
 
709 aa  72  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1333  transglutaminase domain protein  27.27 
 
 
762 aa  72  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135993  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  32.88 
 
 
767 aa  72  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1290  transglutaminase domain-containing protein  32.89 
 
 
866 aa  71.6  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19935  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  25.72 
 
 
639 aa  72  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  34.75 
 
 
691 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  32.58 
 
 
672 aa  71.2  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  27.8 
 
 
669 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  27.6 
 
 
668 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3747  transglutaminase domain protein  29.56 
 
 
768 aa  70.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664376  normal  0.434261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3693  transglutaminase domain protein  26.97 
 
 
768 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  34.04 
 
 
763 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  27.01 
 
 
631 aa  69.7  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  33.59 
 
 
688 aa  70.1  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>