286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25050 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  100 
 
 		 827 aa  1648    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  45.91 
 
 		 815 aa  405  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  39.06 
 
 		 743 aa  294  5e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  29.66 
 
 		 850 aa  232  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  31.26 
 
 		 846 aa  196  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  34.18 
 
 		 810 aa  190  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  28.65 
 
 		 825 aa  188  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  31.05 
 
 		 762 aa  181  4.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  30.78 
 
 		 800 aa  179  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  31.5 
 
 		 818 aa  172  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  28.42 
 
 		 822 aa  170  9e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1208  transglutaminase domain-containing protein  30.68 
 
 		 831 aa  169  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  37.41 
 
 		 792 aa  162  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  26.75 
 
 		 794 aa  146  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  29.77 
 
 		 798 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  29.77 
 
 		 788 aa  142  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  31.69 
 
 		 763 aa  140  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  29.96 
 
 		 771 aa  139  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  28.46 
 
 		 812 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  42.79 
 
 		 782 aa  134  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  48.12 
 
 		 744 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  30.04 
 
 		 725 aa  133  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  29.12 
 
 		 790 aa  132  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  38.28 
 
 		 720 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  26.54 
 
 		 914 aa  117  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  38.7 
 
 		 790 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  36.51 
 
 		 730 aa  114  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  35.38 
 
 		 890 aa  114  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  30.41 
 
 		 742 aa  111  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27440  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  27.32 
 
 		 859 aa  107  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  34.93 
 
 		 677 aa  107  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  42.31 
 
 		 742 aa  106  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  42.31 
 
 		 742 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  33.92 
 
 		 800 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  39.26 
 
 		 728 aa  105  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  30.52 
 
 		 742 aa  104  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  30.52 
 
 		 635 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  29.58 
 
 		 742 aa  103  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  29.58 
 
 		 742 aa  103  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  34.07 
 
 		 736 aa  102  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  29.58 
 
 		 742 aa  102  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  29.58 
 
 		 742 aa  102  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  39.26 
 
 		 862 aa  102  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  34.62 
 
 		 886 aa  101  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  40 
 
 		 742 aa  101  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2535  transglutaminase domain protein  33.62 
 
 		 748 aa  100  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  37.58 
 
 		 774 aa  98.2  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  41.73 
 
 		 806 aa  97.4  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  31.22 
 
 		 840 aa  95.9  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  40.48 
 
 		 730 aa  95.9  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  34.67 
 
 		 749 aa  95.5  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3572  transglutaminase domain protein  42.11 
 
 		 982 aa  94.7  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0384986  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1290  transglutaminase domain-containing protein  30.62 
 
 		 866 aa  93.6  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19935  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  33.12 
 
 		 681 aa  94  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3804  transglutaminase domain-containing protein  29.44 
 
 		 820 aa  92  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  25.05 
 
 		 783 aa  90.5  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0636  transglutaminase domain-containing protein  33.6 
 
 		 830 aa  88.2  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00254265  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0581  transglutaminase-like domain-containing protein  40.28 
 
 		 1238 aa  87.8  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  40.62 
 
 		 815 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1334  transglutaminase domain protein  29.97 
 
 		 859 aa  83.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000357459 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4815  transglutaminase domain protein  34.3 
 
 		 775 aa  83.2  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3214  transglutaminase domain protein  47.71 
 
 		 788 aa  82  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.257235  normal  0.234323 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  39.68 
 
 		 826 aa  82  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5534  transglutaminase domain protein  30.66 
 
 		 753 aa  81.6  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0283272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  35.77 
 
 		 706 aa  81.6  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  33.11 
 
 		 683 aa  80.9  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  31.3 
 
 		 790 aa  80.1  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  34.84 
 
 		 671 aa  80.1  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  35.42 
 
 		 668 aa  79.3  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  35.42 
 
 		 656 aa  79.3  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0440  transglutaminase domain protein  26.48 
 
 		 748 aa  79  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2914  transglutaminase domain-containing protein  32.52 
 
 		 769 aa  78.6  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  37.8 
 
 		 649 aa  78.6  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  37.21 
 
 		 644 aa  78.2  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  31.51 
 
 		 633 aa  78.2  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  31.69 
 
 		 760 aa  78.2  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  39.78 
 
 		 685 aa  77.8  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  34.19 
 
 		 726 aa  77.8  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  40.86 
 
 		 653 aa  77.8  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  24.53 
 
 		 767 aa  77.4  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  38.4 
 
 		 737 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  34.4 
 
 		 635 aa  76.6  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  33.33 
 
 		 662 aa  75.5  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  30.14 
 
 		 673 aa  75.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3114  transglutaminase domain-containing protein  33.01 
 
 		 784 aa  75.5  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.0170569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3833  transglutaminase domain protein  28.22 
 
 		 790 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0481829  normal  0.0321175 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1333  transglutaminase domain protein  35.48 
 
 		 762 aa  75.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2905  transglutaminase domain protein  28.45 
 
 		 769 aa  75.5  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  31.25 
 
 		 709 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  32.82 
 
 		 689 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  32.68 
 
 		 662 aa  74.7  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  33.86 
 
 		 637 aa  74.7  0.000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  29.45 
 
 		 767 aa  74.3  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  36.72 
 
 		 684 aa  74.3  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  33.33 
 
 		 732 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  35.48 
 
 		 668 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  35.38 
 
 		 639 aa  73.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  31.9 
 
 		 680 aa  72.8  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  32.59 
 
 		 795 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  34.62 
 
 		 943 aa  72.4  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>